Recherche:Corrélation entre les codons dans les gènes de protéines/Annexe/Tableur

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Paris le 19.11.17

Sommaire

Diagrammes codons-GC-DRNA[modifier | modifier le wikicode]

Compilation DRNA[modifier | modifier le wikicode]

codons DRNA[modifier | modifier le wikicode]

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  • Résultats directs de la compilation des 111 bactéries. A copier dans un tableur avec une largeur de colonne de 1.3 cm.
a2777A;a27771;a27761;a27762;a6114;a6115;
Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
aae;55;11;136;54;83;266;228;398;106;155;33;31;21;14;92;41;29;223;30;184;143;2;9;189;9;0;6;109;41;119;232;107;44;44;436;235;81;275;112;93;96;61;26;36;112;75;30;53;34;169;189;152;76;65;54;54;86;90;71;286;76;2;3;1;
aba;6;89;50;11;180;283;92;348;28;219;16;15;12;113;70;89;41;170;37;190;5;10;84;3;292;29;39;116;37;203;65;70;320;27;302;235;149;289;59;76;214;219;12;63;171;66;29;32;171;88;82;30;217;205;28;12;118;202;60;3;323;4;2;0;
ade;0;2;3;0;304;314;4;372;0;226;0;0;0;133;87;56;1;171;2;173;1;0;4;3;377;139;0;139;0;198;4;6;433;89;3;552;13;396;1;3;384;322;1;51;135;78;1;4;277;80;1;0;348;210;0;0;100;190;1;1;334;0;2;4;
age;0;11;2;0;345;305;3;459;1;231;7;0;6;94;110;96;4;187;7;181;0;4;29;12;316;94;10;121;4;218;16;56;366;62;26;550;55;344;5;12;242;324;1;55;134;69;3;7;152;166;4;1;334;192;2;1;153;170;10;0;338;0;2;4;
amd;0;11;7;1;394;188;3;249;1;212;3;3;2;155;86;40;5;185;1;181;0;5;30;0;278;173;1;145;0;212;9;62;375;82;93;382;18;440;13;13;337;305;3;33;127;91;2;0;266;64;7;2;176;351;8;1;147;209;3;0;269;0;1;5;
amo;54;176;176;25;142;85;124;288;114;118;41;25;11;68;88;105;90;123;53;144;72;27;44;197;83;15;62;68;66;137;147;74;170;79;227;355;204;222;80;77;62;228;19;61;146;86;27;73;70;142;95;89;156;156;36;36;100;95;67;231;146;4;2;0;
apt;8;71;105;20;371;36;139;177;123;102;93;19;13;22;100;56;83;82;59;116;5;10;212;8;192;59;84;52;37;202;17;198;214;96;412;93;295;129;180;164;123;215;21;48;174;83;68;69;130;84;168;55;250;45;25;110;107;120;212;6;136;3;0;3;
axl;283;68;93;95;24;16;291;132;164;71;58;126;68;29;5;23;179;45;155;94;69;71;120;2;47;15;82;48;212;56;98;214;55;28;358;153;312;95;145;145;67;24;25;3;133;62;134;56;55;0;210;132;36;45;80;158;65;9;318;26;107;4;2;0;
bae;87;82;229;15;108;56;316;118;127;95;74;83;29;22;54;66;121;94;96;124;64;23;121;9;89;24;76;57;105;122;129;119;134;48;404;137;237;144;101;131;120;72;16;18;149;62;30;98;134;6;144;110;110;96;54;124;93;32;190;26;156;3;3;0;
bbd;103;218;140;41;42;47;371;161;164;130;139;84;47;19;34;47;148;96;213;117;197;25;41;27;15;12;79;49;143;98;133;207;59;32;422;141;335;87;148;177;45;70;28;13;155;75;101;110;23;18;149;160;98;59;123;91;30;64;232;41;226;5;0;1;
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bla;1;63;32;3;257;229;35;282;8;225;5;17;12;123;118;64;71;159;62;178;2;25;137;12;224;26;75;86;34;205;39;120;337;37;136;360;151;393;68;27;173;303;5;44;186;83;17;29;236;58;21;7;337;142;10;17;144;189;61;4;270;0;1;5;
bmf;2;51;124;7;271;127;53;320;54;188;21;15;8;141;91;49;124;59;73;139;1;7;127;5;302;21;85;41;26;201;16;112;329;41;324;193;238;228;84;108;234;230;10;41;200;78;18;39;229;39;129;14;178;183;23;20;140;154;96;3;303;2;2;2;
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bsu;81;70;227;28;128;46;309;119;125;98;95;86;30;15;34;68;120;94;78;135;53;22;122;13;96;29;70;58;107;118;113;123;149;46;404;140;248;137;110;121;123;73;14;19;147;63;48;89;121;9;163;99;95;102;56;136;97;19;187;18;169;6;0;0;
bvs;6;124;34;1;234;201;206;313;68;200;8;7;23;201;52;67;111;164;66;254;9;17;141;1;171;41;15;111;77;138;61;206;161;45;200;362;130;311;24;94;21;330;18;46;176;72;4;63;81;168;62;132;199;101;17;24;92;230;167;49;277;3;0;3;
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ddr;3;15;21;3;495;93;46;264;36;196;9;17;23;51;74;166;27;200;21;181;1;7;79;14;328;66;21;115;5;248;41;94;338;73;235;312;54;399;51;53;167;350;9;34;168;82;14;35;136;161;25;16;290;181;26;18;84;271;54;0;257;5;0;1;
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dte;115;19;351;59;7;80;454;231;206;60;120;72;55;9;32;27;143;110;103;117;265;5;30;40;3;0;52;54;86;79;238;164;35;17;563;126;259;104;136;214;16;43;55;12;119;68;130;131;12;15;309;147;13;31;109;145;21;29;256;164;79;4;0;2;
dvl;1;14;66;3;263;302;21;338;8;227;12;10;6;132;92;67;31;161;7;180;2;14;91;17;316;36;34;109;13;193;35;93;313;55;275;224;67;392;66;23;117;355;13;79;184;78;4;25;101;209;18;17;232;224;5;27;111;256;18;22;310;1;4;1;
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eco;21;43;52;6;455;59;294;105;82;129;83;16;11;33;92;66;86;131;26;197;0;4;252;4;128;11;34;92;48;200;21;250;191;42;373;154;199;240;128;96;259;92;25;36;192;72;54;31;203;12;170;116;137;73;67;13;54;199;97;3;276;5;0;1;
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rru;3;67;65;3;389;86;30;298;21;213;2;1;3;135;66;78;97;69;45;110;2;2;48;4;341;95;70;66;16;180;16;48;404;67;174;327;181;279;0;20;142;544;4;63;185;73;4;7;170;146;57;1;206;252;3;3;54;274;29;0;344;3;2;1;
saci;2;87;46;4;194;335;63;301;16;199;5;5;11;129;51;120;45;147;23;163;3;54;46;6;204;166;30;114;30;200;43;67;265;137;175;345;72;344;24;36;169;337;7;54;148;81;17;23;167;149;44;4;108;338;12;21;101;212;30;0;337;3;0;3;
salb;0;2;4;0;355;241;0;288;1;228;1;0;1;116;144;39;0;180;2;186;0;5;50;2;288;121;3;132;1;217;7;83;385;45;12;514;3;452;10;9;219;406;4;38;150;97;0;5;205;113;3;2;127;388;1;2;77;311;2;0;288;0;0;6;
say;100;203;39;16;137;96;124;80;109;67;15;8;35;100;48;45;115;66;64;77;2;44;69;6;144;216;72;66;137;104;63;67;148;157;259;204;167;193;30;37;199;232;23;21;127;104;4;32;185;100;49;39;243;162;21;19;123;142;181;8;95;3;1;2;
sbn;154;123;65;52;172;64;218;161;112;121;85;77;30;45;16;69;103;90;58;185;13;7;242;2;113;6;66;64;164;87;14;273;175;17;382;145;246;180;117;138;153;172;40;25;179;71;111;85;53;26;156;91;158;74;120;52;54;127;175;12;234;6;0;0;
sbw;388;32;71;32;8;8;594;25;281;17;160;88;59;11;11;26;227;20;319;65;89;25;153;7;14;4;115;11;188;15;154;157;21;18;373;24;285;25;134;152;6;4;56;8;135;67;90;102;11;11;188;133;14;12;125;94;21;14;392;203;34;3;2;1;
sbz;24;47;48;18;436;57;281;113;88;131;72;19;20;44;93;58;97;117;50;173;3;6;234;7;139;12;53;70;45;210;25;206;217;61;336;188;227;213;91;75;274;117;27;32;188;72;52;39;192;15;147;96;155;90;63;12;88;177;145;6;234;5;0;1;
sep;330;50;92;56;9;13;358;74;149;81;99;103;89;9;9;18;180;61;218;79;88;22;170;5;19;1;116;35;203;21;87;242;31;23;439;74;312;98;160;137;30;22;25;4;144;61;122;101;17;5;188;148;55;24;129;144;47;17;269;96;80;6;0;0;
sgr;0;2;7;0;369;210;1;302;2;227;2;1;2;114;146;34;5;172;6;190;1;5;64;7;266;109;2;134;1;213;14;81;365;54;28;484;9;439;6;12;267;363;3;39;157;96;0;2;209;119;7;5;156;368;2;3;134;253;4;1;281;0;2;4;
sho;0;5;11;0;386;187;0;295;4;223;0;1;0;98;152;45;2;183;1;183;0;5;67;5;276;104;0;137;3;212;7;91;394;26;19;510;4;435;8;14;246;394;3;39;152;97;0;1;221;107;7;1;171;331;7;3;102;276;2;0;300;3;1;2;
sma;0;5;11;0;376;209;1;311;1;231;3;2;1;122;143;43;10;170;4;183;1;5;85;3;273;76;0;132;3;220;19;117;356;27;31;501;8;431;11;15;292;330;3;37;150;98;1;3;221;103;14;7;166;339;7;5;150;223;3;0;283;2;1;3;
smf;379;23;134;38;6;0;536;113;214;41;118;143;76;7;2;16;260;19;326;41;244;0;16;14;0;1;92;12;140;19;214;155;6;41;546;65;394;28;159;140;3;14;43;4;159;54;108;97;1;2;208;216;13;3;179;132;2;4;194;372;8;5;1;0;
smk;1;23;77;4;230;237;34;325;21;230;9;6;4;176;95;43;72;108;41;171;2;12;80;18;289;72;58;73;15;210;29;88;364;41;201;296;140;347;54;46;261;303;2;49;201;76;3;12;264;64;50;13;145;282;8;13;143;166;31;7;364;5;0;1;
spi;90;149;186;32;27;50;283;101;158;87;88;96;41;14;21;49;117;106;133;103;21;13;224;8;44;13;66;62;167;61;71;224;58;48;360;112;263;165;101;216;45;115;19;4;168;68;134;85;15;9;220;53;94;82;111;122;35;85;227;9;155;5;1;0;
spl;95;112;151;165;77;20;179;227;112;117;105;89;26;35;7;65;84;116;64;188;20;12;251;1;78;2;56;72;130;121;21;316;125;8;331;213;284;159;153;215;106;85;50;12;191;72;132;95;40;15;221;127;95;41;122;85;37;102;185;10;225;6;0;0;
ssdc;464;37;60;15;1;3;497;61;257;12;168;104;50;12;11;11;231;10;369;18;95;34;152;9;11;2;110;4;168;19;126;178;17;30;304;53;299;15;106;130;37;20;63;9;136;60;123;80;17;5;167;117;15;9;137;99;11;22;434;199;22;6;0;0;
ssm;12;56;224;9;155;140;180;274;146;109;30;18;51;59;107;70;126;93;99;125;25;49;107;46;71;89;74;53;29;189;113;156;99;90;256;317;264;150;78;57;84;223;26;38;171;71;17;68;78;120;152;49;102;159;25;24;48;214;136;41;248;3;1;2;
sty;18;43;34;12;456;63;271;126;82;139;65;15;10;48;98;62;91;124;42;179;4;6;230;5;149;9;53;74;35;224;20;208;232;52;349;177;216;225;71;78;279;130;21;39;185;72;32;43;215;8;153;74;161;107;47;12;93;189;126;5;255;5;0;1;
sus;3;79;34;7;335;145;59;338;34;204;7;4;12;115;60;89;53;148;53;144;5;14;44;10;275;98;37;98;25;198;64;38;305;96;232;294;163;237;26;29;318;179;6;78;169;78;10;17;219;71;29;29;309;110;10;12;165;138;98;2;302;3;1;2;
synd;0;68;54;3;381;178;73;227;17;152;11;21;38;59;116;119;40;121;39;159;3;17;100;8;202;99;22;105;39;243;44;132;260;55;179;287;182;278;41;86;119;344;7;48;125;79;18;43;124;152;64;8;316;113;20;15;65;243;51;1;253;1;0;5;
tai;7;46;82;18;349;165;9;301;23;203;11;4;9;54;210;96;19;152;6;146;7;22;29;180;51;241;18;96;8;200;38;85;176;242;13;527;111;337;8;19;154;279;15;78;160;90;10;16;100;197;59;14;355;163;6;3;26;197;12;182;142;2;2;2;
tde;135;97;223;35;38;80;323;263;200;75;77;50;33;59;73;63;159;89;121;150;64;45;52;56;76;17;58;53;81;106;151;121;136;39;442;148;220;174;117;136;27;165;28;45;162;71;17;95;54;110;195;132;18;61;52;105;52;134;186;147;143;3;3;0;
thl;254;129;61;59;20;11;338;72;166;49;106;69;68;24;15;32;193;51;219;73;45;32;176;10;42;23;77;32;223;34;111;182;63;38;454;63;324;89;133;215;31;46;22;4;165;70;92;113;39;9;194;146;58;52;113;131;48;45;271;32;90;5;1;0;
tli;61;214;156;44;99;65;202;254;111;108;80;42;55;42;78;75;107;90;102;123;128;29;28;171;42;18;62;57;76;120;151;142;84;87;272;353;271;140;102;118;87;127;54;30;136;87;57;120;46;72;160;112;186;102;69;48;54;85;100;241;62;3;2;1;
tma;9;54;146;20;150;225;289;243;64;177;76;32;28;43;81;51;47;219;55;172;213;19;13;105;16;6;27;87;25;132;190;130;56;24;453;183;198;165;80;74;100;102;30;17;131;72;67;74;75;92;156;56;201;119;45;93;83;77;85;200;179;0;1;5;
tme;208;99;161;61;11;18;470;154;199;46;83;89;78;23;27;18;177;97;203;90;179;8;12;72;3;0;67;43;120;25;155;160;14;48;465;108;292;57;165;80;32;25;45;7;121;62;145;83;14;21;197;187;62;23;76;154;42;34;226;277;47;4;1;1;
tos;10;32;70;26;289;334;18;326;49;191;1;1;0;22;127;71;6;217;3;121;1;2;6;55;254;234;8;119;8;180;5;11;225;262;55;635;14;313;1;5;148;443;0;35;131;87;2;17;54;332;15;3;363;150;2;0;53;205;15;6;243;2;3;1;
tpas;68;138;170;30;108;100;164;193;209;53;140;40;57;62;50;34;143;116;130;73;41;45;165;26;133;72;87;77;87;175;105;141;59;122;242;253;260;129;192;87;214;54;88;38;168;72;48;104;86;51;138;105;250;56;72;75;127;79;212;57;119;1;3;2;
tsu;31;102;356;8;31;34;349;236;158;119;106;84;18;29;46;87;112;141;132;150;54;10;80;18;131;10;61;59;31;175;233;89;125;16;429;144;217;214;147;150;102;61;25;75;163;82;60;117;107;4;274;100;32;36;132;155;32;24;281;79;106;4;0;2;
uur;385;48;35;48;1;2;466;57;222;20;48;158;89;12;5;9;229;29;373;48;30;26;122;3;14;2;92;22;213;14;91;142;25;29;345;37;331;39;107;143;24;16;30;9;118;4;100;73;6;8;219;76;22;9;84;150;15;13;475;39;54;4;2;48;
vin;0;4;13;5;217;435;5;378;5;254;10;2;1;148;114;69;14;154;3;187;2;15;39;16;291;189;9;134;5;217;29;62;390;82;39;558;70;380;24;34;291;334;2;56;144;82;1;19;185;169;16;2;280;284;5;3;138;218;7;0;364;1;1;4;
vpr;161;208;130;31;3;39;331;102;108;120;142;15;36;3;85;45;139;92;154;126;10;13;256;1;86;7;103;50;185;17;21;287;120;28;491;106;302;145;152;211;60;56;59;22;171;75;137;114;18;1;182;266;51;25;136;170;47;31;217;13;176;6;0;0;
xcb;1;53;7;1;528;74;18;293;17;200;6;0;11;126;71;101;35;156;35;176;1;1;109;1;354;27;36;105;13;246;6;93;398;30;229;234;110;362;50;22;259;368;0;51;162;78;3;7;251;59;15;2;330;160;7;7;59;263;23;0;318;1;0;5;
ype;77;175;44;27;296;32;267;111;115;110;81;42;31;33;57;60;115;89;65;157;4;11;251;5;101;28;65;61;109;162;21;257;176;56;326;181;282;156;125;167;151;125;32;32;195;76;108;75;87;25;201;86;119;80;88;31;67;150;176;10;207;4;1;1;

Bactéries n'ayant pas  la polymérase 1 (a27771), remplacée par EC 6.1.1.9 (a6119);
a2777A;a6119;a27761;a27762;a6114;a6115;
Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
hcr;373;29;140;20;0;4;653;48;265;23;121;148;37;6;12;9;255;19;462;25;131;21;38;1;5;2;76;6;201;9;154;102;8;13;370;26;330;8;128;85;9;7;22;1;87;1;76;92;6;1;132;90;3;3;59;144;2;6;496;132;59;4;2;67;
rip;255;116;84;67;34;33;520;131;244;93;227;113;53;37;51;16;193;50;261;102;250;77;44;38;4;8;115;26;180;47;263;76;7;18;396;87;316;58;90;109;19;10;67;18;176;81;101;70;30;8;161;95;52;47;110;95;30;27;296;213;161;1;2;3;
ple;402;104;44;51;9;5;560;79;259;10;102;132;91;13;10;17;243;36;315;80;156;23;70;31;12;19;84;25;160;19;129;178;41;29;296;53;242;42;145;106;15;10;96;8;131;79;87;91;17;8;172;148;32;19;110;166;22;13;276;398;35;3;2;1;
zin;492;8;7;9;0;0;1082;19;394;8;127;86;50;1;2;3;330;12;736;17;108;0;4;0;0;0;51;2;82;3;69;111;2;7;171;0;127;2;38;40;2;1;48;3;66;3;53;67;0;4;65;51;1;0;85;66;1;0;373;558;5;6;0;52;
crp;468;48;33;35;2;1;822;39;506;21;144;115;74;12;3;11;304;47;576;68;101;4;7;1;0;0;56;16;88;3;123;60;4;5;186;6;156;12;36;36;6;2;80;11;62;44;56;37;4;2;115;65;5;0;86;73;5;5;480;367;20;4;0;2;

Bactéries dont EC 6.1.1.4 (a6114) est en 2 morceaux. ci-dessous le petit morceau (a61142);
a61142;
Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
aae;4;1;10;1;2;6;11;18;8;4;1;3;1;0;2;0;1;8;4;11;7;0;0;7;0;0;0;3;6;8;5;1;4;3;22;13;8;7;10;2;3;2;0;0;4;4;3;4;1;4;9;9;5;3;5;3;2;2;6;17;1;0;0;1;
hth;5;3;16;1;4;7;10;17;9;5;3;0;2;0;4;2;5;8;4;9;8;0;1;6;0;1;2;5;0;4;4;3;4;3;15;18;9;5;5;8;2;3;0;1;6;3;2;6;0;2;2;6;7;2;2;4;4;3;4;12;3;0;0;1;

Total codons DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Total codons DRNA
  • Sommation des résultats directs du chapitre précédent. A copier dans un tableur avec une largeur de colonne de 1.3 cm.
Total codons;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga
aae;59;12;146;55;85;272;239;416;114;159;34;34;22;14;94;41;30;231;34;195;150;2;9;196;9;0;6;112;47;127;237;108;48;47;458;248;89;282;122;95;99;63;26;36;116;79;33;57;35;173;198;161;81;68;59;57;88;92;77;303;77;2;3;2
aba;6;89;50;11;180;283;92;348;28;219;16;15;12;113;70;89;41;170;37;190;5;10;84;3;292;29;39;116;37;203;65;70;320;27;302;235;149;289;59;76;214;219;12;63;171;66;29;32;171;88;82;30;217;205;28;12;118;202;60;3;323;4;2;0
ade;0;2;3;0;304;314;4;372;0;226;0;0;0;133;87;56;1;171;2;173;1;0;4;3;377;139;0;139;0;198;4;6;433;89;3;552;13;396;1;3;384;322;1;51;135;78;1;4;277;80;1;0;348;210;0;0;100;190;1;1;334;0;2;4
age;0;11;2;0;345;305;3;459;1;231;7;0;6;94;110;96;4;187;7;181;0;4;29;12;316;94;10;121;4;218;16;56;366;62;26;550;55;344;5;12;242;324;1;55;134;69;3;7;152;166;4;1;334;192;2;1;153;170;10;0;338;0;2;4
amd;0;11;7;1;394;188;3;249;1;212;3;3;2;155;86;40;5;185;1;181;0;5;30;0;278;173;1;145;0;212;9;62;375;82;93;382;18;440;13;13;337;305;3;33;127;91;2;0;266;64;7;2;176;351;8;1;147;209;3;0;269;0;1;5
amo;54;176;176;25;142;85;124;288;114;118;41;25;11;68;88;105;90;123;53;144;72;27;44;197;83;15;62;68;66;137;147;74;170;79;227;355;204;222;80;77;62;228;19;61;146;86;27;73;70;142;95;89;156;156;36;36;100;95;67;231;146;4;2;0
apt;8;71;105;20;371;36;139;177;123;102;93;19;13;22;100;56;83;82;59;116;5;10;212;8;192;59;84;52;37;202;17;198;214;96;412;93;295;129;180;164;123;215;21;48;174;83;68;69;130;84;168;55;250;45;25;110;107;120;212;6;136;3;0;3
axl;283;68;93;95;24;16;291;132;164;71;58;126;68;29;5;23;179;45;155;94;69;71;120;2;47;15;82;48;212;56;98;214;55;28;358;153;312;95;145;145;67;24;25;3;133;62;134;56;55;0;210;132;36;45;80;158;65;9;318;26;107;4;2;0
bae;87;82;229;15;108;56;316;118;127;95;74;83;29;22;54;66;121;94;96;124;64;23;121;9;89;24;76;57;105;122;129;119;134;48;404;137;237;144;101;131;120;72;16;18;149;62;30;98;134;6;144;110;110;96;54;124;93;32;190;26;156;3;3;0
bbd;103;218;140;41;42;47;371;161;164;130;139;84;47;19;34;47;148;96;213;117;197;25;41;27;15;12;79;49;143;98;133;207;59;32;422;141;335;87;148;177;45;70;28;13;155;75;101;110;23;18;149;160;98;59;123;91;30;64;232;41;226;5;0;1
bfl;434;127;50;27;11;7;423;76;252;10;179;101;80;18;19;12;268;26;404;38;82;68;124;24;6;18;143;10;235;54;180;142;10;47;275;73;368;13;128;164;29;9;67;10;163;72;89;105;26;11;156;180;53;21;181;98;12;12;412;214;45;2;0;4
bla;1;63;32;3;257;229;35;282;8;225;5;17;12;123;118;64;71;159;62;178;2;25;137;12;224;26;75;86;34;205;39;120;337;37;136;360;151;393;68;27;173;303;5;44;186;83;17;29;236;58;21;7;337;142;10;17;144;189;61;4;270;0;1;5
bmf;2;51;124;7;271;127;53;320;54;188;21;15;8;141;91;49;124;59;73;139;1;7;127;5;302;21;85;41;26;201;16;112;329;41;324;193;238;228;84;108;234;230;10;41;200;78;18;39;229;39;129;14;178;183;23;20;140;154;96;3;303;2;2;2
bmv;1;38;21;3;322;283;21;348;16;226;1;4;3;212;24;51;40;171;15;191;1;18;88;7;380;75;31;112;30;221;10;53;474;41;220;314;107;369;38;11;521;193;5;51;177;77;3;9;263;64;17;9;286;241;1;4;231;105;30;4;319;3;0;3
bsu;81;70;227;28;128;46;309;119;125;98;95;86;30;15;34;68;120;94;78;135;53;22;122;13;96;29;70;58;107;118;113;123;149;46;404;140;248;137;110;121;123;73;14;19;147;63;48;89;121;9;163;99;95;102;56;136;97;19;187;18;169;6;0;0
bvs;6;124;34;1;234;201;206;313;68;200;8;7;23;201;52;67;111;164;66;254;9;17;141;1;171;41;15;111;77;138;61;206;161;45;200;362;130;311;24;94;21;330;18;46;176;72;4;63;81;168;62;132;199;101;17;24;92;230;167;49;277;3;0;3
caa;7;63;63;15;207;255;80;313;41;184;11;27;34;65;129;88;40;151;87;165;3;22;158;0;181;13;27;101;90;155;32;223;187;29;297;243;150;307;125;65;169;207;23;38;131;79;97;18;156;49;111;27;102;198;53;46;44;220;112;2;340;6;0;0
cad;240;31;116;115;14;4;402;136;173;61;100;112;93;17;5;26;210;46;227;78;268;2;17;18;0;1;72;24;109;33;238;134;14;27;477;136;305;116;142;121;22;12;43;6;149;62;128;89;14;1;163;236;31;6;144;152;22;9;97;393;20;4;1;1
cbd;269;195;79;28;65;48;361;77;174;43;50;45;48;69;51;42;126;79;156;74;15;85;103;7;134;72;78;66;190;69;95;135;133;62;396;106;292;114;99;142;157;131;28;26;140;73;33;86;83;87;149;88;157;111;59;50;125;127;251;34;125;4;1;1
cbl;326;37;110;63;3;2;447;114;191;52;123;100;84;3;16;16;230;33;275;52;241;2;16;24;0;0;85;16;134;28;187;139;28;38;507;95;356;57;133;168;6;26;53;12;165;58;120;106;5;6;186;230;21;8;116;156;5;10;113;383;12;3;3;0
cff;200;68;243;75;21;19;503;112;246;34;69;70;125;22;10;132;208;53;272;78;164;13;71;26;25;3;82;35;134;43;146;156;83;28;310;221;388;84;143;206;44;55;33;34;164;62;72;104;47;8;198;160;34;24;137;93;40;28;156;329;77;3;2;1
cgq;6;109;98;12;251;119;32;280;45;163;79;22;6;29;166;17;43;167;31;205;5;20;181;2;182;8;15;113;32;193;62;211;242;17;217;298;216;267;165;193;108;118;14;19;167;87;148;95;45;18;172;20;174;145;66;15;41;243;119;1;232;4;2;0
chp;246;123;119;77;40;40;301;173;180;77;178;53;65;26;45;34;166;66;163;78;89;37;144;22;49;16;106;50;139;74;165;155;47;70;380;160;317;82;100;234;44;44;56;26;151;71;67;162;21;30;203;124;67;70;123;108;39;48;268;84;127;3;2;1
cje;280;93;233;26;4;12;583;87;275;23;93;55;131;13;8;69;212;32;298;46;153;1;81;10;22;2;101;22;184;18;127;193;48;32;491;110;369;32;177;188;61;32;53;22;149;57;74;123;12;6;176;127;79;4;126;76;15;48;311;104;111;4;1;1
cmi;0;5;1;1;236;381;0;244;0;212;0;0;0;115;111;106;0;147;2;152;1;4;20;8;399;88;2;121;1;225;20;34;385;76;4;483;10;466;12;13;312;297;0;25;130;92;1;6;169;146;0;2;186;319;4;2;179;185;0;1;305;1;1;4
cmn;206;164;131;59;45;45;320;147;186;92;184;46;61;33;59;31;152;69;150;70;56;76;119;20;35;35;93;54;133;103;188;89;45;115;353;190;303;86;100;244;64;57;46;31;143;70;78;142;20;37;237;96;83;72;113;87;66;41;273;49;114;4;1;1
crp;468;48;33;35;2;1;822;39;506;21;144;115;74;12;3;11;304;47;576;68;101;4;7;1;0;0;56;16;88;3;123;60;4;5;186;6;156;12;36;36;6;2;80;11;62;44;56;37;4;2;115;65;5;0;86;73;5;5;480;367;20;4;0;2
cta;198;165;119;73;50;49;290;168;168;105;173;46;57;31;58;37;153;68;139;75;68;76;114;15;50;26;82;56;125;116;186;92;50;111;344;205;292;90;104;247;68;68;50;32;144;70;66;149;28;34;197;116;88;86;111;85;55;50;266;46;126;3;1;2
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tpas;68;138;170;30;108;100;164;193;209;53;140;40;57;62;50;34;143;116;130;73;41;45;165;26;133;72;87;77;87;175;105;141;59;122;242;253;260;129;192;87;214;54;88;38;168;72;48;104;86;51;138;105;250;56;72;75;127;79;212;57;119;1;3;2
tsu;31;102;356;8;31;34;349;236;158;119;106;84;18;29;46;87;112;141;132;150;54;10;80;18;131;10;61;59;31;175;233;89;125;16;429;144;217;214;147;150;102;61;25;75;163;82;60;117;107;4;274;100;32;36;132;155;32;24;281;79;106;4;0;2
uur;385;48;35;48;1;2;466;57;222;20;48;158;89;12;5;9;229;29;373;48;30;26;122;3;14;2;92;22;213;14;91;142;25;29;345;37;331;39;107;143;24;16;30;9;118;4;100;73;6;8;219;76;22;9;84;150;15;13;475;39;54;4;2;48
vin;0;4;13;5;217;435;5;378;5;254;10;2;1;148;114;69;14;154;3;187;2;15;39;16;291;189;9;134;5;217;29;62;390;82;39;558;70;380;24;34;291;334;2;56;144;82;1;19;185;169;16;2;280;284;5;3;138;218;7;0;364;1;1;4
vpr;161;208;130;31;3;39;331;102;108;120;142;15;36;3;85;45;139;92;154;126;10;13;256;1;86;7;103;50;185;17;21;287;120;28;491;106;302;145;152;211;60;56;59;22;171;75;137;114;18;1;182;266;51;25;136;170;47;31;217;13;176;6;0;0
xcb;1;53;7;1;528;74;18;293;17;200;6;0;11;126;71;101;35;156;35;176;1;1;109;1;354;27;36;105;13;246;6;93;398;30;229;234;110;362;50;22;259;368;0;51;162;78;3;7;251;59;15;2;330;160;7;7;59;263;23;0;318;1;0;5
ype;77;175;44;27;296;32;267;111;115;110;81;42;31;33;57;60;115;89;65;157;4;11;251;5;101;28;65;61;109;162;21;257;176;56;326;181;282;156;125;167;151;125;32;32;195;76;108;75;87;25;201;86;119;80;88;31;67;150;176;10;207;4;1;1
zin;492;8;7;9;0;0;1082;19;394;8;127;86;50;1;2;3;330;12;736;17;108;0;4;0;0;0;51;2;82;3;69;111;2;7;171;0;127;2;38;40;2;1;48;3;66;3;53;67;0;4;65;51;1;0;85;66;1;0;373;558;5;6;0;52

acides aminés DRNA[modifier | modifier le wikicode]

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a2777A;a27771;a27761;a27762;a6114;a6115;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
aae;605;626;261;232;252;214;352;115;160;427;671;356;362;62;112;75;286;482;284;433;6;
aba;619;440;247;315;211;227;423;155;240;482;537;438;568;75;171;66;320;534;360;386;6;
ade;623;376;226;276;172;175;524;139;198;532;555;409;710;52;135;78;362;559;290;336;6;
age;663;462;232;313;191;188;455;131;222;500;576;399;583;56;134;69;328;531;326;348;6;
amd;601;252;213;289;190;182;486;146;212;528;475;458;668;36;127;91;332;536;365;272;6;
amo;658;412;232;338;213;197;438;130;203;470;582;426;447;80;146;86;312;496;267;444;6;
apt;611;316;225;303;165;175;486;136;239;525;505;424;682;69;174;83;351;518;362;354;6;
axl;579;423;235;309;224;249;324;130;268;395;511;407;381;28;133;62;245;423;312;451;6;
bae;577;434;222;328;215;220;330;133;227;430;541;381;424;34;149;62;268;460;303;372;6;
bbd;591;532;294;370;244;330;317;128;241;431;563;422;440;41;155;75;252;466;308;499;6;
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bla;585;317;233;339;230;240;426;161;239;533;496;544;571;49;186;83;340;507;360;335;6;
bmf;582;373;242;325;183;212;463;126;227;498;517;466;656;51;200;78;325;504;337;402;6;
bmv;668;369;242;295;211;206;569;143;251;578;534;476;763;56;177;77;339;553;341;353;6;
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bvs;600;519;268;358;275;320;380;126;215;473;562;441;469;64;176;72;316;494;363;493;6;
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cbl;541;561;243;342;263;327;283;101;162;392;602;413;333;65;165;58;237;445;287;508;6;
cff;626;615;280;428;261;350;302;117;177;413;531;472;448;67;164;62;231;416;298;562;6;
cgq;595;312;208;319;210;236;398;128;225;532;515;483;584;33;167;87;306;511;365;352;6;
chp;645;474;257;401;232;241;357;156;213;437;540;399;422;82;151;71;280;464;318;479;6;
cje;648;670;298;369;244;344;269;123;202;400;601;401;458;75;149;57;215;386;265;526;6;
cmi;624;244;212;332;147;154;520;123;226;515;487;476;634;25;130;92;322;507;370;306;6;
cmn;650;467;278;414;221;220;341;147;236;437;543;389;465;77;143;70;277;488;307;436;6;
cta;654;458;273;402;221;214;349;138;241;439;549;382;487;82;144;70;277;487;301;438;6;
dal;603;494;248;310;200;215;362;132;237;473;565;436;524;88;212;64;301;524;339;381;6;
dba;623;391;262;337;206;196;414;140;196;489;520;421;524;91;167;63;308;486;318;388;6;
ddr;630;310;232;340;227;202;495;136;253;546;547;453;621;43;168;82;346;512;399;311;6;
din;603;370;248;346;213;230;386;145;248;478;515;402;505;82;176;58;282;459;313;425;6;
dpt;651;299;220;346;218;178;495;128;268;555;573;456;670;41;166;91;350;497;344;293;6;
dte;631;685;266;315;253;220;343;106;165;454;689;363;409;67;119;68;288;500;304;499;6;
dvl;649;359;235;319;192;187;476;143;206;496;499;459;561;92;184;78;339;491;399;350;6;
eal;641;402;211;301;216;222;399;126;247;502;526;445;570;61;191;72;303;493;339;376;6;
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eno;634;395;219;316;212;216;395;128;253;512;526;445;558;58;197;73;297;480;342;381;6;
fbt;631;498;298;308;257;313;401;146;274;483;595;461;531;54;165;76;311;507;368;458;6;
fnc;597;613;225;338;271;329;278;102;157;401;595;382;340;47;153;57;214;424;301;515;6;
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hhd;578;414;222;353;230;255;347;127;262;417;563;403;401;34;150;67;263;483;290;348;6;
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hmr;578;635;271;344;266;273;321;116;154;409;562;428;406;56;145;56;243;482;290;507;6;
hth;627;546;233;313;277;194;379;125;187;424;593;358;335;63;127;66;271;472;271;433;6;
ial;557;604;300;327;239;324;315;114;224;391;553;437;380;46;140;57;268;479;341;516;6;
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lfc;761;452;269;500;174;255;450;155;234;510;577;409;432;50;173;72;365;489;360;471;6;
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mcac;594;584;260;356;267;465;210;87;256;302;416;418;285;33;118;2;179;373;306;581;65;
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pae;663;365;227;297;191;227;426;139;249;519;504;436;637;64;165;73;295;519;310;352;6;
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pmh;640;517;232;456;196;390;300;108;235;402;473;427;332;63;109;75;258;435;303;474;6;
ppoy;593;383;210;319;208;221;379;143;232;453;528;407;465;43;155;71;285;492;335;384;6;
pub;596;676;310;414;201;387;258;112;194;375;515;436;348;71;123;59;238;375;319;556;6;
ret;604;375;236;330;192;213;460;122;221;504;510;475;664;51;190;76;329;505;337;395;6;
roa;605;295;205;329;193;195;442;137;215;536;499;497;615;38;142;93;319;548;351;316;6;
rpr;628;547;303;416;247;377;298;135;238;387;482;383;391;76;141;63;235;430;328;604;6;
rru;613;328;234;285;166;155;492;136;196;535;501;460;706;67;185;73;327;516;334;373;6;
saci;668;364;215;321;192;186;479;144;230;512;520;416;566;61;148;81;356;494;346;367;6;
salb;602;288;229;301;180;188;466;135;218;520;526;455;644;42;150;97;323;520;391;290;6;
say;591;204;176;251;181;141;481;138;241;435;463;360;498;44;127;104;321;493;305;284;6;
sbn;630;379;233;322;193;243;383;130;251;479;527;426;580;65;179;71;275;479;353;421;6;
sbw;539;619;298;355;247;384;292;126;203;350;397;310;296;64;135;67;214;347;254;629;6;
sbz;630;394;219;306;214;223;401;123;255;509;524;440;557;59;188;72;298;488;340;385;6;
sep;550;432;230;327;241;297;305;151;224;383;513;410;349;29;144;61;245;415;337;445;6;
sgr;588;303;229;299;177;196;452;136;214;514;512;448;648;42;157;96;330;536;392;286;6;
sho;589;295;227;296;185;184;457;137;215;518;529;439;662;42;152;97;329;510;388;302;6;
sma;601;312;232;314;180;187;443;132;223;519;532;439;648;40;150;98;328;526;385;286;6;
smf;580;649;255;362;279;367;275;104;159;416;611;422;316;47;159;54;208;440;317;574;6;
smk;572;359;251;333;180;212;473;131;225;522;497;487;664;51;201;76;343;490;330;402;6;
spi;534;384;245;309;223;236;323;128;228;401;472;428;477;23;168;68;243;449;353;391;6;
spl;620;406;229;327;200;252;364;128;251;470;544;443;559;62;191;72;282;484;346;420;6;
ssdc;580;558;269;356;241;387;303;114;187;351;357;314;293;72;136;60;225;308;269;655;6;
ssm;596;454;255;335;219;224;387;127;218;458;573;414;442;64;171;71;283;462;311;425;6;
sty;626;397;221;298;215;221;403;127;259;512;526;441;558;60;185;72;298;495;341;386;6;
sus;603;397;238;287;201;197;446;135;223;503;526;400;552;84;169;78;317;477;325;402;6;
synd;684;300;169;364;161;198;429;127;282;491;466;460;590;55;125;79;337;501;343;305;6;
tai;667;310;226;384;171;152;530;114;208;541;540;448;460;93;160;90;323;591;232;336;6;
tde;608;586;275;355;248;271;310;111;187;447;590;394;445;73;162;71;276;406;343;476;6;
thl;534;410;215;314;244;292;328;109;257;394;517;413;425;26;165;70;253;450;337;393;6;
tli;639;456;219;372;197;225;416;119;196;464;625;411;434;84;136;87;295;560;256;403;6;
tma;604;532;241;311;266;227;372;114;157;400;636;363;356;47;131;72;308;532;298;464;6;
tme;558;624;245;318;274;293;274;110;145;377;573;349;302;52;121;62;263;469;306;550;6;
tos;761;344;240;222;223;124;552;127;188;503;690;327;597;35;131;87;405;531;260;264;6;
tpas;614;357;262;383;259;203;482;164;262;427;495;389;547;126;168;72;289;549;353;388;6;
tsu;562;585;277;370;253;282;303;120;206;463;573;431;460;100;163;82;288;442;343;466;6;
uur;519;523;242;321;258;421;197;114;227;287;382;370;290;39;118;4;187;326;262;568;54;
vin;674;383;259;344;168;190;552;143;222;563;597;450;683;58;144;82;374;582;364;371;6;
vpr;572;433;228;326;231;280;373;153;202;456;597;447;479;81;171;75;270;524;384;406;6;
xcb;664;311;217;315;191;211;493;141;259;527;463;472;699;51;162;78;320;507;336;341;6;
ype;651;378;225;304;204;222;400;126;271;510;507;438;568;64;195;76;295;486;336;393;6;

Bactéries n'ayant pas  la polymérase 1 (a27771), remplacée par EC 6.1.1.9 (a6119);
a2777A;a6119;a27761;a27762;a6114;a6115;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
hcr;566;701;288;333;274;487;198;82;210;277;396;338;229;23;87;1;175;228;211;687;73;
rip;589;651;337;497;243;363;421;141;227;364;483;374;228;85;176;81;209;355;262;670;6;
ple;615;639;269;365;279;395;311;109;179;377;349;284;276;104;131;79;203;371;311;709;6;
zin;516;1101;402;269;342;753;112;53;85;189;171;129;81;51;66;3;124;117;152;936;58;
crp;587;861;527;359;351;644;113;72;91;192;192;168;80;91;62;44;99;185;169;867;6;

Bactéries dont EC 6.1.1.4 (a6114) est en 2 morceaux. ci-dessous le petit morceau (a61142);
a61142;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
aae;24;29;12;7;9;15;14;3;14;13;35;15;17;0;4;4;12;26;12;24;1;
hth;36;27;14;11;13;13;16;7;4;14;33;14;18;1;6;3;10;17;13;19;1;

Total acides aminés DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Total acides aminés DRNA
  • Sommation des résultats directs du chapitre précédent. A copier dans un tableur avec une largeur de colonne de 1.3 cm.
Total acides aminés DRNA;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp
aae;629;655;273;239;261;229;366;118;174;440;706;371;379;62;116;79;298;508;296;457;7
aba;619;440;247;315;211;227;423;155;240;482;537;438;568;75;171;66;320;534;360;386;6
ade;623;376;226;276;172;175;524;139;198;532;555;409;710;52;135;78;362;559;290;336;6
age;663;462;232;313;191;188;455;131;222;500;576;399;583;56;134;69;328;531;326;348;6
amd;601;252;213;289;190;182;486;146;212;528;475;458;668;36;127;91;332;536;365;272;6
amo;658;412;232;338;213;197;438;130;203;470;582;426;447;80;146;86;312;496;267;444;6
apt;611;316;225;303;165;175;486;136;239;525;505;424;682;69;174;83;351;518;362;354;6
axl;579;423;235;309;224;249;324;130;268;395;511;407;381;28;133;62;245;423;312;451;6
bae;577;434;222;328;215;220;330;133;227;430;541;381;424;34;149;62;268;460;303;372;6
bbd;591;532;294;370;244;330;317;128;241;431;563;422;440;41;155;75;252;466;308;499;6
bfl;656;499;262;409;294;442;322;153;289;379;348;381;330;77;163;72;231;410;303;671;6
bla;585;317;233;339;230;240;426;161;239;533;496;544;571;49;186;83;340;507;360;335;6
bmf;582;373;242;325;183;212;463;126;227;498;517;466;656;51;200;78;325;504;337;402;6
bmv;668;369;242;295;211;206;569;143;251;578;534;476;763;56;177;77;339;553;341;353;6
bsu;580;428;223;328;214;213;335;128;225;431;544;385;427;33;147;63;267;459;308;374;6
bvs;600;519;268;358;275;320;380;126;215;473;562;441;469;64;176;72;316;494;363;493;6
caa;610;393;225;354;191;252;377;128;245;471;540;457;566;61;131;79;320;438;363;454;6
cad;520;538;234;353;256;305;306;96;142;413;613;421;297;49;149;62;232;436;327;510;6
cbd;684;438;217;305;205;230;416;144;259;425;502;406;529;54;140;73;289;505;361;410;6
cbl;541;561;243;342;263;327;283;101;162;392;602;413;333;65;165;58;237;445;287;508;6
cff;626;615;280;428;261;350;302;117;177;413;531;472;448;67;164;62;231;416;298;562;6
cgq;595;312;208;319;210;236;398;128;225;532;515;483;584;33;167;87;306;511;365;352;6
chp;645;474;257;401;232;241;357;156;213;437;540;399;422;82;151;71;280;464;318;479;6
cje;648;670;298;369;244;344;269;123;202;400;601;401;458;75;149;57;215;386;265;526;6
cmi;624;244;212;332;147;154;520;123;226;515;487;476;634;25;130;92;322;507;370;306;6
cmn;650;467;278;414;221;220;341;147;236;437;543;389;465;77;143;70;277;488;307;436;6
crp;587;861;527;359;351;644;113;72;91;192;192;168;80;91;62;44;99;185;169;867;6
cta;654;458;273;402;221;214;349;138;241;439;549;382;487;82;144;70;277;487;301;438;6
dal;603;494;248;310;200;215;362;132;237;473;565;436;524;88;212;64;301;524;339;381;6
dba;623;391;262;337;206;196;414;140;196;489;520;421;524;91;167;63;308;486;318;388;6
ddr;630;310;232;340;227;202;495;136;253;546;547;453;621;43;168;82;346;512;399;311;6
din;603;370;248;346;213;230;386;145;248;478;515;402;505;82;176;58;282;459;313;425;6
dpt;651;299;220;346;218;178;495;128;268;555;573;456;670;41;166;91;350;497;344;293;6
dte;631;685;266;315;253;220;343;106;165;454;689;363;409;67;119;68;288;500;304;499;6
dvl;649;359;235;319;192;187;476;143;206;496;499;459;561;92;184;78;339;491;399;350;6
eal;641;402;211;301;216;222;399;126;247;502;526;445;570;61;191;72;303;493;339;376;6
eco;636;399;211;301;217;223;399;126;248;504;527;439;575;61;192;72;300;496;333;376;6
eno;634;395;219;316;212;216;395;128;253;512;526;445;558;58;197;73;297;480;342;381;6
fbt;631;498;298;308;257;313;401;146;274;483;595;461;531;54;165;76;311;507;368;458;6
fnc;597;613;225;338;271;329;278;102;157;401;595;382;340;47;153;57;214;424;301;515;6
gau;675;324;253;320;173;199;541;132;219;536;536;475;699;50;127;87;342;579;390;358;6
gva;604;367;249;384;221;284;415;147;242;505;512;511;587;59;176;84;311;516;356;340;6
hcr;566;701;288;333;274;487;198;82;210;277;396;338;229;23;87;68;175;228;211;687;6
hhd;578;414;222;353;230;255;347;127;262;417;563;403;401;34;150;67;263;483;290;348;6
hhl;579;442;190;268;225;257;279;113;260;384;581;433;373;54;119;55;229;419;290;418;6
hmr;578;635;271;344;266;273;321;116;154;409;562;428;406;56;145;56;243;482;290;507;6
hth;663;573;247;324;290;207;395;132;191;438;626;372;353;64;133;69;281;489;284;452;7
ial;557;604;300;327;239;324;315;114;224;391;553;437;380;46;140;57;268;479;341;516;6
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Contenu en GC des génomes DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Contenu en GC des génomes DRNA
  • Le contenu en GC (%GC) de 80 bactéries sont tirés des tableaux numériques de l'article "répétition des bases dans l'ADN des procaryotes". Pour la cyanobactérie synd voir dans cyanobactérie de la même annexe.
synd
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KEGG;effectif;%GC; 4T; 4A; 4C; 4G; 4T; 4A; 4C; 4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
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cta;1044459;41.3026265272261;3432;3408;298;331;57496;57848;33854;33988;5388;5499;1299;1382;0
dba;3942657;58.6469987117824;6013;5709;2349;2296;128342;128977;247250;245417;10055;9879;10289;10144;0
ddr;2819842;63.3881614643657;1141;1141;2325;2271;72453;72851;190167;190035;2681;2802;7741;7887;0
dpt;2147060;66.1626596368988;984;992;2416;2403;50298;50108;153924;153369;2162;2164;7415;7470;0
dvl;3462887;63.0119319515768;802;927;4317;4191;99406;98997;207175;208396;2448;2453;12405;12173;0
eal;4701875;49.6961743985112;9155;9178;1415;1391;213977;213634;210716;211439;16662;16491;5919;5988;0
eco;4641652;50.7907098593346;8441;8289;1278;1239;205758;205373;216669;215471;15523;15380;6067;6027;0
eno;4726582;55.0658594307684;6718;6616;2026;1761;175739;175064;247144;245935;13149;12986;7851;7838;0
fnc;2268272;27.1239075384257;15901;16899;188;205;150456;154238;44430;46164;22104;23105;909;1016;0
gau;4636964;64.2743614140632;821;831;2673;2453;114328;115447;290929;288988;2570;2662;10122;9745;0
gva;1617545;42.0163531873012;3613;3819;141;146;98250;98280;46326;46971;7958;8178;664;682;1
kpn;5315120;57.4785705684914;6826;6881;2566;2436;176067;174204;303726;304645;12619;12681;10259;10156;0
ksk;8783278;74.1973095947132;164;172;12884;12121;117011;118289;769376;762832;800;781;36895;35532;66
lat;1190853;36.321359563271;5612;5102;299;296;69592;68743;31730;32794;7633;7502;1024;1068;0
liv;2928879;37.1320221832312;13330;13151;393;397;182231;182030;85549;84245;20442;20144;2380;2231;0
ljf;1755993;34.4856727788778;7197;7391;139;123;119517;119828;45649;46581;11837;11856;1094;1109;0
lla;2365589;35.3293830838747;11874;12259;306;308;154900;154402;62832;64130;17897;17884;1642;1717;0
lpl;3308273;44.4668864993911;5986;6100;985;948;194243;193057;126982;125053;12535;12729;4041;4084;0
mcac;1017293;23.6631924135918;8400;8285;29;36;78405;77999;13198;13569;10401;10072;142;172;0
mts;3982034;70.2782487149088;104;89;4948;5132;63017;63298;264646;262789;456;464;15198;14915;21
opr;2303940;70.0248270354263;416;426;4669;4606;47540;47357;166529;168073;1395;1350;11408;11436;0
pac;2560265;60.0107410756308;697;698;1923;1929;78228;76965;154335;153541;2322;2196;7318;7468;0
pae;6264404;66.5557329955092;1354;1434;2481;2202;153530;156878;471856;459967;3401;3374;13053;11818;0
pgd;3776653;59.6245140869442;2205;2324;2835;2811;118904;119611;229006;228777;6450;6528;9786;9915;0
pgi;2343476;48.2879278473515;3967;3874;873;900;104950;104835;103058;103915;7764;7881;3403;3392;0
ple;358242;26.1736479809738;2182;2972;29;48;24576;25141;5582;7273;3131;3480;99;162;0
ppoy;5597590;45.5107644539882;11835;12067;1852;1923;278022;279031;228863;232494;22906;23777;7539;7524;0
ret;4381608;61.2722087416309;2000;1981;1456;1181;138606;141047;281098;266494;6563;6988;6900;5754;0
rip;574390;28.4825641114922;5149;4608;48;34;37848;37072;11363;11314;5367;4930;177;157;0
roa;8376953;67.3730787311657;304;315;5894;6137;175073;173980;576424;582208;1793;1897;23638;24137;67
rpr;1111523;29.0002995889424;5688;5488;60;46;75353;75109;20531;21121;9101;8657;374;348;0
rru;4352825;65.4479562123449;2105;2167;6143;6144;117691;117954;314819;315531;6056;6234;15234;15224;0
saci;9629675;62.2660577849201;4027;3918;12522;12591;311082;308165;613507;617296;10530;10237;32126;32651;0
salb;6841649;73.3211578544263;163;150;11612;11254;92662;94200;578179;575278;712;723;34189;33576;29
say;3551206;56.7620971579796;4756;4898;4114;3728;136493;138062;224664;220982;9802;10117;11598;11257;0
sbn;5347283;46.2833180888313;10050;9904;963;1056;279165;278792;207232;209063;19982;19825;5955;6005;0
sbz;4683551;51.3411511906244;9188;9107;1746;1661;197243;195799;225810;225551;16324;15916;6701;6366;0
sep;2499279;32.0951762488302;10030;9072;256;186;173063;168449;55041;52457;17327;16269;1229;1044;0
sgr;8545929;72.2274079272131;197;198;13111;12803;125513;127411;691994;689222;1042;1153;40312;40010;0
sho;9840102;72.0397308889684;248;219;12043;12293;144995;146783;806253;806814;1023;1058;38926;38906;0
sma;9025608;70.716554496938;288;338;10689;10658;147271;148799;697969;694405;1497;1590;33943;34035;0
smk;3820344;62.6668959653895;1275;1380;1438;1375;115653;117560;245820;242728;4939;4981;7019;6690;0
spi;1937111;38.3159251070279;7601;7936;274;296;114902;115665;59188;61681;11590;12071;1546;1675;0
spl;1796846;39.0916639489416;5598;5780;245;286;107498;109043;58113;58617;9461;9754;1430;1421;0
sty;4809037;52.0927162756286;9036;9129;1610;1679;198401;197326;233040;235497;16417;16153;6741;6819;0
sus;9965640;61.9024568417081;3706;3782;5063;4566;321828;322056;637709;633071;12614;12567;22278;21823;0
synd;2572069;59.0852733733037;1561;1578;2408;2369;89219;90093;155100;155007;3505;3630;7274;7056;0
tai;1848474;63.7925661924377;375;339;8098;7114;48029;46765;142542;137838;1116;1095;12183;11501;0
tde;2843201;37.8737556718642;18098;17974;618;525;158790;159051;100982;98334;22582;22554;3102;3017;0
tma;1860725;46.2477260207715;4488;4659;538;709;89126;90023;74178;78612;8868;8979;2144;2517;0
tme;1915238;31.3998573545429;13238;12800;490;431;123522;121538;50996;49107;17789;17210;1638;1550;0
tos;2072393;68.5534548707702;717;721;11907;12188;48268;48509;171568;172114;2802;2818;17743;17863;0
tpas;1139203;52.7868167482003;2304;2372;998;992;43195;42394;46858;47673;3742;3707;2611;2803;0
tsu;2731853;39.1632346249963;16370;17375;212;175;160078;161558;84833;85814;21396;22170;1279;1393;0
uur;751719;25.4996880483266;5422;5640;38;46;58304;58095;10982;11668;7387;7301;189;215;0
vin;4350553;68.9392589861565;388;361;3617;3620;88266;86551;320517;318241;1260;1271;14450;14284;0
xcb;5148708;64.9570338811212;1531;1476;1367;1328;137185;137234;344611;341465;3622;3618;7930;7928;0
ype;4653728;47.6361102324846;8789;8951;2595;2930;224229;225184;201213;204623;16816;16685;7641;8107;0
zin;208564;13.5401332099375;3112;3050;7;10;14475;14621;2251;2077;2574;2718;13;28;21
  • J'ai soumis le programme repete.pl pour les 30 autres bactéries dont les résultats sont ci-dessous:
KEGG;effectif;%GC; 4T; 4A; 4C; 4G; 4T; 4A; 4C; 4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
axl; 2569486; 35.7182720590811; 8179; 8531; 284; 328; 170932; 171483; 64149; 67845; 14575; 15230; 1450; 1592; 0
bbd; 4196595; 36.8131306452016; 17917; 18452; 633; 676; 252305; 254717; 130999; 131308; 29736; 30406; 3649; 3511; 0
bfl; 705557; 27.3831880344182; 3463; 3756; 64; 70; 48885; 48639; 13042; 14796; 4814; 5072; 303; 331; 0
bvs; 3076856; 51.6699189042321; 4455; 4947; 1933; 1709; 127405; 131768; 150963; 149272; 8475; 9052; 7525; 7031; 0
caa; 3750771; 53.6017794741401; 2758; 2619; 1585; 1728; 159815; 157925; 181725; 185832; 7542; 7149; 5835; 6135; 0
dal; 6517073; 54.4848567801159; 17587; 17686; 5674; 5421; 254602; 254345; 412164; 407704; 26656; 26671; 18214; 17436; 31T
din; 2928377; 56.1087250719426; 3500; 3527; 2322; 2399; 99019; 99060; 167348; 167454; 6769; 7046; 7566; 7837; 0
dte; 1541968; 34.9485851846472; 7576; 7913; 224; 214; 100704; 100372; 43668; 44782; 12371; 12390; 897; 943; 0
fbt; 6665617; 46.4695016230305; 16807; 16738; 2490; 2802; 300435; 302268; 308376; 311092; 30947; 30735; 10659; 11204; 0
hcr; 657101; 22.5303263881808; 6427; 6393; 56; 54; 50381; 49817; 9441; 9120; 7575; 7438; 164; 150; 0
hhd; 4150632; 41.8231247675053; 11508; 11601; 1386; 1420; 234076; 235189; 154591; 156132; 19851; 19935; 5276; 5757; 0
hhl; 2649255; 32.4558413591746; 8690; 8550; 652; 641; 187071; 188193; 67353; 67753; 16065; 16077; 2414; 2472; 0
hmr; 1694430; 37.4742538788855; 7900; 7853; 437; 467; 94543; 95109; 56139; 56577; 11775; 11770; 1953; 1865; 0
hth; 1743135; 44.0002638923549; 5049; 4910; 755; 757; 82142; 80624; 76333; 75300; 9204; 9097; 2386; 2477; 0
ial; 3658997; 33.9331242960844; 16086; 15710; 152; 182; 258926; 259364; 95175; 95611; 27336; 26860; 1268; 1295; 0
lfc; 2559538; 50.0475476433638; 7191; 7295; 2290; 2162; 109904; 110996; 135762; 134514; 10887; 11031; 6806; 6747; 0
mah; 4668296; 48.7459235661149; 11446; 11414; 1100; 1177; 234179; 234043; 209652; 212104; 18801; 18737; 5220; 5463; 0
mcu; 2146480; 55.4132812791174; 2251; 2171; 1942; 1833; 83793; 84090; 116972; 114286; 6080; 6320; 6318; 6468; 0
nis; 1877931; 39.6886254074298; 10895; 10719; 356; 345; 88490; 88367; 60256; 59148; 13902; 14266; 1770; 1716; 0
nse; 859006; 41.0843463258697; 2891; 2722; 187; 182; 46113; 46003; 28403; 27971; 4597; 4377; 808; 862; 0
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Contenu en GC des 111 génomes DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Contenu en GC des 111 génomes DRNA
  • Regroupement des contenus en GC du chapitre précédent. A copier dans un tableur avec une largeur de colonne de 1.3 cm.
KEGG;effectif;%GC; 4T; 4A; 4C; 4G; 4T; 4A; 4C; 4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
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ple;358242;26.1736479809738;2182;2972;29;48;24576;25141;5582;7273;3131;3480;99;162;0
pmh;1738790;31.1450491433698;10643;10443;273;266;120591;119911;42641;42436;13543;12907;1153;1083;0
ppoy;5597590;45.5107644539882;11835;12067;1852;1923;278022;279031;228863;232494;22906;23777;7539;7524;0
pub;1308759;29.6830814534991;8928;9156;117;122;88435;89149;28952;29599;10984;11228;610;623;0
ret;4381608;61.2722087416309;2000;1981;1456;1181;138606;141047;281098;266494;6563;6988;6900;5754;0
rip;574390;28.4825641114922;5149;4608;48;34;37848;37072;11363;11314;5367;4930;177;157;0
roa;8376953;67.3730787311657;304;315;5894;6137;175073;173980;576424;582208;1793;1897;23638;24137;67
rpr;1111523;29.0002995889424;5688;5488;60;46;75353;75109;20531;21121;9101;8657;374;348;0
rru;4352825;65.4479562123449;2105;2167;6143;6144;117691;117954;314819;315531;6056;6234;15234;15224;0
saci;9629675;62.2660577849201;4027;3918;12522;12591;311082;308165;613507;617296;10530;10237;32126;32651;0
salb;6841649;73.3211578544263;163;150;11612;11254;92662;94200;578179;575278;712;723;34189;33576;29
say;3551206;56.7620971579796;4756;4898;4114;3728;136493;138062;224664;220982;9802;10117;11598;11257;0
sbn;5347283;46.2833180888313;10050;9904;963;1056;279165;278792;207232;209063;19982;19825;5955;6005;0
sbw;708439;25.0696249077196;7139;7400;42;62;46706;46970;11878;12110;6380;6319;185;196;0
sbz;4683551;51.3411511906244;9188;9107;1746;1661;197243;195799;225810;225551;16324;15916;6701;6366;0
sep;2499279;32.0951762488302;10030;9072;256;186;173063;168449;55041;52457;17327;16269;1229;1044;0
sgr;8545929;72.2274079272131;197;198;13111;12803;125513;127411;691994;689222;1042;1153;40312;40010;0
sho;9840102;72.0397308889684;248;219;12043;12293;144995;146783;806253;806814;1023;1058;38926;38906;0
sma;9025608;70.716554496938;288;338;10689;10658;147271;148799;697969;694405;1497;1590;33943;34035;0
smf;1662578;26.3145548659973;10208;9579;113;145;115699;115699;31659;31086;14104;13858;672;721;0
smk;3820344;62.6668959653895;1275;1380;1438;1375;115653;117560;245820;242728;4939;4981;7019;6690;0
spi;1937111;38.3159251070279;7601;7936;274;296;114902;115665;59188;61681;11590;12071;1546;1675;0
spl;1796846;39.0916639489416;5598;5780;245;286;107498;109043;58113;58617;9461;9754;1430;1421;0
ssdc;459399;24.2405838933041;3920;4009;63;77;33018;32667;7856;8453;4306;4304;181;198;0
ssm;4653970;48.9651415887941;10632;10712;3064;2968;210582;212163;226905;226997;18487;18929;10861;10930;0
sty;4809037;52.0927162756286;9036;9129;1610;1679;198401;197326;233040;235497;16417;16153;6741;6819;0
sus;9965640;61.9024568417081;3706;3782;5063;4566;321828;322056;637709;633071;12614;12567;22278;21823;0
synd;2572069;59.0852733733037;1561;1578;2408;2369;89219;90093;155100;155007;3505;3630;7274;7056;0
synd;2572069;59.0852733733037;1561;1578;2408;2369;89219;90093;155100;155007;3505;3630;7274;7056;0
tai;1848474;63.7925661924377;375;339;8098;7114;48029;46765;142542;137838;1116;1095;12183;11501;0
tde;2843201;37.8737556718642;18098;17974;618;525;158790;159051;100982;98334;22582;22554;3102;3017;0
thl;2562720;36.0410813510645;13045;13182;374;404;157992;157174;69264;71676;18613;18707;1751;1852;0
tli;1967774;47.0576397492801;4485;4562;1240;1499;93405;94061;93059;98130;9109;8749;4439;4876;0
tma;1860725;46.2477260207715;4488;4659;538;709;89126;90023;74178;78612;8868;8979;2144;2517;0
tme;1915238;31.3998573545429;13238;12800;490;431;123522;121538;50996;49107;17789;17210;1638;1550;0
tos;2072393;68.5534548707702;717;721;11907;12188;48268;48509;171568;172114;2802;2818;17743;17863;0
tpas;1139203;52.7868167482003;2304;2372;998;992;43195;42394;46858;47673;3742;3707;2611;2803;0
tsu;2731853;39.1632346249963;16370;17375;212;175;160078;161558;84833;85814;21396;22170;1279;1393;0
uur;751719;25.4996880483266;5422;5640;38;46;58304;58095;10982;11668;7387;7301;189;215;0
vin;4350553;68.9392589861565;388;361;3617;3620;88266;86551;320517;318241;1260;1271;14450;14284;0
vpr;2132142;38.6292751608476;4705;4780;338;382;124745;125694;66818;68509;10180;9955;1718;1923;0
xcb;5148708;64.9570338811212;1531;1476;1367;1328;137185;137234;344611;341465;3622;3618;7930;7928;0
ype;4653728;47.6361102324846;8789;8951;2595;2930;224229;225184;201213;204623;16816;16685;7641;8107;0
zin;208564;13.5401332099375;3112;3050;7;10;14475;14621;2251;2077;2574;2718;13;28;21

Tableau des diagrammes des codons DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  1. récupération des contenus en GC (%GC) des résultats du chapitre précédent.
  2. Création de la colonne %AT (100-%GC)
  3. Somme de tous les codons (codons stops compris) d'une bactérie donnée, colonne aas. La colonne Trp isole les tga donnant du Trp, des tga donnant des stops.
  4. Moyenne des aas par bactérie: 6 550 aas par bactérie, avec un écart type de 304.
  5. Recalcul du codon: 6550*codon/aas.
  • Le tableau est suivi de la moyenne des codons.
6,549.649;304.215;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
aas;KEGG;%AT;%GC;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;Trp
5,710;zin;86.461;13.539;564.348;9.176;8.029;10.323;0.000;0.000;1241.107;21.794;451.937;9.176;145.675;98.646;57.352;1.147;2.294;3.441;378.526;13.765;844.228;19.500;123.881;0.000;4.588;0.000;0.000;0.000;58.499;2.294;94.058;3.441;79.146;127.322;2.294;8.029;196.145;0.000;145.675;2.294;43.588;45.882;2.294;1.147;55.058;3.441;75.705;3.441;60.794;76.852;0.000;4.588;74.558;58.499;1.147;0.000;97.499;75.705;1.147;0.000;427.849;640.053;5.735;6.882;0.000;0.000;59.647
5,760;crp;83.436;16.564;532.159;54.580;37.524;39.798;2.274;1.137;934.689;44.347;575.368;23.879;163.741;130.766;84.145;13.645;3.411;12.508;345.676;53.443;654.965;77.322;114.846;4.548;7.960;1.137;0.000;0.000;63.677;18.193;100.064;3.411;139.862;68.226;4.548;5.685;211.499;6.823;177.386;13.645;40.935;40.935;6.823;2.274;90.967;12.508;70.500;50.032;63.677;42.072;4.548;2.274;130.766;73.911;5.685;0.000;97.790;83.008;5.685;5.685;545.804;417.313;22.742;4.548;0.000;2.274;0.000
5,864;hcr;77.470;22.530;416.613;32.391;156.370;22.339;0.000;4.468;729.352;53.612;295.985;25.689;135.148;165.305;41.326;6.702;13.403;10.052;284.816;21.222;516.019;27.923;146.317;23.455;42.443;1.117;5.585;2.234;84.886;6.702;224.502;10.052;172.006;113.926;8.935;14.520;413.262;29.040;368.585;8.935;142.966;94.939;10.052;7.818;24.572;1.117;97.172;1.117;84.886;102.757;6.702;1.117;147.434;100.523;3.351;3.351;65.899;160.837;2.234;6.702;553.995;147.434;65.899;4.468;2.234;0.000;74.834
6,157;mcac;76.337;23.663;502.101;40.423;38.296;51.061;0.000;0.000;578.692;42.551;260.624;15.957;101.058;151.056;113.824;1.064;0.000;11.701;264.879;19.148;423.382;71.273;155.311;4.255;57.444;2.128;4.255;0.000;71.273;21.275;268.071;4.255;163.821;143.609;5.319;8.510;421.254;21.275;406.361;38.296;92.548;195.734;3.191;11.701;30.849;4.255;125.525;2.128;120.206;67.018;3.191;0.000;291.474;91.484;10.638;3.191;228.711;88.293;1.064;7.446;525.504;67.018;25.531;3.191;3.191;0.000;62.763
6,041;ssdc;75.759;24.241;503.069;40.115;65.052;16.263;1.084;3.253;538.847;66.136;278.639;13.010;182.146;112.757;54.210;13.010;11.926;11.926;250.450;10.842;400.070;19.516;102.999;36.863;164.798;9.758;11.926;2.168;119.262;4.337;182.146;20.600;136.609;192.987;18.431;32.526;329.597;57.463;324.176;16.263;114.925;140.946;40.115;21.684;68.305;9.758;147.451;65.052;133.357;86.736;18.431;5.421;181.061;126.851;16.263;9.758;148.535;107.336;11.926;23.852;470.543;215.756;23.852;6.505;0.000;0.000;0.000
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6,465;amd;28.707;71.293;0.000;11.144;7.092;1.013;399.159;190.462;3.039;252.260;1.013;214.776;3.039;3.039;2.026;157.029;87.126;40.524;5.065;187.422;1.013;183.370;0.000;5.065;30.393;0.000;281.640;175.265;1.013;146.899;0.000;214.776;9.118;62.812;379.910;83.074;94.218;387.002;18.236;445.761;13.170;13.170;341.412;308.993;3.039;33.432;128.663;92.191;2.026;0.000;269.483;64.838;7.092;2.026;178.304;355.596;8.105;1.013;148.925;211.737;3.039;0.000;272.522;0.000;1.013;5.065;0.000
6,559;sho;27.960;72.040;0.000;4.993;10.984;0.000;385.450;186.733;0.000;294.579;3.994;222.682;0.000;0.999;0.000;97.860;151.783;44.936;1.997;182.739;0.999;182.739;0.000;4.993;66.904;4.993;275.606;103.852;0.000;136.805;2.996;211.698;6.990;90.870;393.438;25.963;18.973;509.273;3.994;434.380;7.989;13.980;245.649;393.438;2.996;38.944;151.783;96.862;0.000;0.999;220.685;106.847;6.990;0.999;170.756;330.528;6.990;2.996;101.855;275.606;1.997;0.000;299.572;2.996;0.999;1.997;0.000
6,561;sgr;27.773;72.227;0.000;1.997;6.988;0.000;368.362;209.637;0.998;301.478;1.997;226.607;1.997;0.998;1.997;113.803;145.747;33.941;4.991;171.702;5.990;189.671;0.998;4.991;63.889;6.988;265.540;108.811;1.997;133.768;0.998;212.631;13.976;80.860;364.369;53.907;27.952;483.163;8.984;438.240;5.990;11.979;266.538;362.372;2.995;38.933;156.728;95.834;0.000;1.997;208.638;118.794;6.988;4.991;155.730;367.363;1.997;2.995;133.768;252.562;3.993;0.998;280.514;0.000;1.997;3.993;0.000
6,452;cmi;27.336;72.664;0.000;5.076;1.015;1.015;239.572;386.766;0.000;247.693;0.000;215.209;0.000;0.000;0.000;116.740;112.680;107.604;0.000;149.225;2.030;154.300;1.015;4.061;20.303;8.121;405.039;89.332;2.030;122.831;1.015;228.405;20.303;34.515;390.827;77.150;4.061;490.310;10.151;473.053;12.182;13.197;316.722;301.495;0.000;25.378;131.968;93.392;1.015;6.091;171.558;148.210;0.000;2.030;188.815;323.828;4.061;2.030;181.709;187.800;0.000;1.015;309.616;1.015;1.015;4.061;0.000
6,571;salb;26.679;73.321;0.000;1.994;3.987;0.000;353.846;240.217;0.000;287.064;0.997;227.259;0.997;0.000;0.997;115.623;143.532;38.873;0.000;179.415;1.994;185.396;0.000;4.984;49.838;1.994;287.064;120.607;2.990;131.571;0.997;216.295;6.977;82.730;383.749;44.854;11.961;512.330;2.990;450.531;9.968;8.971;218.288;404.681;3.987;37.877;149.513;96.685;0.000;4.984;204.334;112.633;2.990;1.994;126.587;386.739;0.997;1.994;76.750;309.989;1.994;0.000;287.064;0.000;0.000;5.981;0.000
6,532;ksk;25.802;74.198;0.000;6.016;3.008;0.000;401.081;200.540;0.000;259.700;1.003;216.584;1.003;0.000;0.000;134.362;137.370;44.119;0.000;188.508;1.003;180.486;0.000;1.003;25.068;5.014;324.875;117.316;1.003;135.365;1.003;206.557;4.011;47.127;428.154;27.073;19.051;492.327;2.005;436.175;2.005;3.008;199.538;470.267;4.011;40.108;147.397;100.270;2.005;1.003;244.659;98.265;2.005;0.000;156.421;371.000;1.003;1.003;40.108;328.886;2.005;0.000;280.757;0.000;1.003;5.014;0.000
6,733;ade;25.095;74.905;0.000;1.946;2.918;0.000;295.722;305.449;3.891;361.870;0.000;219.846;0.000;0.000;0.000;129.378;84.631;54.475;0.973;166.343;1.946;168.289;0.973;0.000;3.891;2.918;366.734;135.215;0.000;135.215;0.000;192.608;3.891;5.837;421.209;86.576;2.918;536.968;12.646;385.216;0.973;2.918;373.543;313.231;0.973;49.611;131.324;75.876;0.973;3.891;269.457;77.821;0.973;0.000;338.523;204.281;0.000;0.000;97.277;184.826;0.973;0.973;324.905;0.000;1.946;3.891;0.000

Moyenne des codons
6549,65;;;;120,01;80,61;96,78;29,62;180,40;103,96;247,04;202,47;122,76;124,84;68,57;50,17;38,30;58,22;65,81;54,74;115,69;106,81;133,07;128,41;59,74;20,47;102,54;24,49;131,82;44,14;58,93;69,55;88,56;131,88;88,32;142,22;168,89;53,68;295,60;225,80;216,76;201,79;91,42;108,46;125,83;163,86;26,61;31,02;154,26;71,35;58,46;64,69;101,38;61,39;131,76;83,70;137,27;117,91;68,42;65,02;70,68;121,08;168,45;83,68;181,22;3,31;1,05;1,66;2,27
304,22;;;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;Trp

Maximum et 75% DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Le nombre de codons est calculé d'après les équations des courbes de tendance pour caractériser chaque codon par un maximum de la courbe et, s'il n'existe pas (équation du second degré sans solution), par la valeur à 75% GC ou AT.

constantes des courbes DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: constantes des courbes DRNA
  • Ces constantes sont relevées à la main parce que le format de l'équation dans Libreoffice/calc est une image. Ces équations sont représentées dans les diagrammes.
codon;diagram;x3;x2;x;codon;diagram;x3;x2;x;codon;diagram;x3;x2;x;codon;diagram;x3;x2;x
ttt;%AT;0.00057;0.01185;-0.2492;tct;%AT;-0.00091;0.13691;-3.32039;tat;%AT;0.00031;0.02553;-0.17738;tgt;%AT;-0.0002;0.02954;-0.63061
ttc;%GC;-0.00075;0.11012;-0.95591;tcc;%GC;-0.0013;0.15161;-2.72647;tac;%GC;-0.0006;0.07371;0.14637;tgc;%GC;-0.00067;0.07391;-1.24162
tta;%AT;0.00219;-0.10807;0.97089;tca;%AT;-0.0003;0.06661;-1.92933;taa;%AT;-2E-05;0.00228;0.00351;tga;%GC;2E-05;-0.00178;0.05762
ttg;%AT;-0.00254;0.27112;-5.14699;tcg;%GC;-0.0002;0.0518;-0.92575;tag;%GC;2E-05;-0.00278;0.10348;tgg;%GC;0.00026;-0.04454;3.06654
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ctt;%AT;-0.00329;0.37605;-8.20089;cct;%AT;-0.00155;0.19004;-4.23067;cat;%AT;-0.00083;0.10415;-1.92709;cgt;%AT;-0.00184;0.16536;-1.10015
ctc;%GC;0.00016;0.0552;-1.18671;ccc;%GC;-0.00069;0.10805;-2.35507;cac;%GC;-0.0002;0.0378;0.09835;cgc;%GC;-0.00054;0.15436;-3.75165
cta;%AT;-0.00085;0.10907;-2.69606;cca;%AT;-0.00132;0.17482;-4.27036;caa;%AT;-0.00151;0.21511;-5.32276;cga;%AT;-0.0005;0.05334;-0.93631
ctg;%GC;-0.00462;0.5886;-13.46935;ccg;%GC;-0.00138;0.19524;-4.04617;cag;%GC;-0.00244;0.28701;-5.10584;cgg;%GC;0.00017;0.01656;-0.45048
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
att;%AT;-0.0001;0.10638;-2.33135;act;%AT;-0.00112;0.16189;-4.01772;aat;%AT;0.00332;-0.25026;5.41105;agt;%AT;-0.0005;0.07383;-1.84844
atc;%GC;-0.0022;0.26792;-3.7806;acc;%GC;-0.0020;0.26011;-5.36981;aac;%GC;-0.00109;0.1053;0.39031;agc;%GC;-0.0010;0.09531;-1.05602
ata;%AT;0.00209;-0.15088;3.01712;aca;%AT;-0.00135;0.18781;-4.77689;aaa;%AT;0.0020;-0.05462;0.91141;aga;%AT;-0.00057;0.11578;-3.47503
atg;%GC;0.00015;-0.0808;7.01628;acg;%GC;-0.00108;0.12467;-1.87083;aag;%GC;-0.00081;0.09348;1.73297;agg;%AT;-0.00073;0.07548;-1.29967
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;%AT;-0.00322;0.3937;-8.77864;gct;%AT;-0.0029;0.34298;-7.43331;gat;%AT;-0.00373;0.45452;-8.84242;ggt;%AT;-0.00189;0.19221;-1.70625
gtc;%GC;0.00051;0.02474;-0.34814;gcc;%GC;-0.00112;0.22101;-4.8768;gac;%GC;-0.00054;0.14156;-1.61835;ggc;%GC;-0.00077;0.18284;-3.7931
gta;%AT;-0.00225;0.28412;-6.81826;gca;%AT;-0.00215;0.25617;-5.40349;gaa;%AT;-0.0050;0.57426;-9.84916;gga;%AT;-0.00133;0.1823;-4.09334
gtg;%GC;-0.00267;0.3257;-6.34715;gcg;%GC;-0.00083;0.15096;-2.8306;gag;%GC;0.00137;-0.06858;4.28255;ggg;%GC;-0.00055;0.053;-0.04165

abscisse du maximum DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: abscisse du maximum DRNA
  • C'est la solution qui annule la dérivée de l'équation de degré 3. C'est une équation du second degré qui quelque fois n'a pas de solution. Mais quand il y en a 1 ou 2 solutions, une seule est valable et doit être supérieure à 50 et inférieur à 100 %GC ou %AT. J'ai éliminé les abscisses supérieures à 90% pour tenir compte des valeurs extrêmes trouvées chez les bactéries étudiées.
  • La fonction dans calc est: "=(-2*P345-RACINE(((2*P345)^2)-12*O345*Q345))/(6*O345)" où P345 désigne la cellule de la 2ème constante, O345 la 1ère et Q345 la 3ème.
codon;diagram;;abscis;75%;codon;diagram;;abscis;75%;codon;diagram;;abscis;75%;codon;diagram;;abscis;75%
ttt;%AT;;;75;tct;%AT;;86.189;75;tat;%AT;;;75;tgt;%AT;;;75
ttc;%GC;;;75;tcc;%GC;;67.372;75;tac;%GC;;82.881;75;tgc;%GC;;63.871;75
tta;%AT;;;75;tca;%AT;;;75;taa;%AT;;76.762;75;tga;%GC;;;75
ttg;%AT;;59.880;75;tcg;%GC;;;75;tag;%GC;;;75;tgg;%GC;;;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ctt;%AT;;63.015;75;cct;%AT;;68.445;75;cat;%AT;;73.062;75;cgt;%AT;;56.378;75
ctc;%GC;;;75;ccc;%GC;;;75;cac;%GC;;;75;cgc;%GC;;;75
cta;%AT;;70.561;75;cca;%AT;;73.651;75;caa;%AT;;80.347;75;cga;%AT;;60.864;75
ctg;%GC;;71.301;75;ccg;%GC;;82.468;75;cag;%GC;;68.189;75;cgg;%GC;;;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
att;%AT;;;75;act;%AT;;81.733;75;aat;%AT;;;75;agt;%AT;;;75
atc;%GC;;73.382;75;acc;%GC;;77.007;75;aac;%GC;;66.218;75;agc;%GC;;60.789;75
ata;%AT;;;75;aca;%AT;;77.533;75;aaa;%AT;;;75;aga;%AT;;;75
atg;%GC;;50.527;75;acg;%GC;;68.531;75;aag;%GC;;85.299;75;agg;%AT;;58.847;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;%AT;;68.183;75;gct;%AT;;65.876;75;gat;%AT;;69.938;75;ggt;%AT;;63.024;75
gtc;%GC;;;75;gcc;%GC;;;75;gac;%GC;;;75;ggc;%GC;;;75
gta;%AT;;69.689;75;gca;%AT;;66.912;75;gaa;%AT;;67.042;75;gga;%AT;;78.272;75
gtg;%GC;;70.013;75;gcg;%GC;;;75;gag;%GC;;;75;ggg;%GC;;63.847;75

maximum DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: maximum DRNA
  • Il est calculé avec l'équation du diagramme: "=P387*(O345*P387^2+P345*P387+Q345)" voir abscisse ci-dessus et P387 étant la cellule de l'abscisse (%AT ou %GC)
codon;diagram;abscis;max;75%;;diagram;abscis;max;75%;;diagram;abscis;max;75%;;diagram;abscis;max;75%
ttt;%AT;;;288;tct;%AT;86;148;137;tat;%AT;;;261;tgt;%AT;;;51
ttc;%GC;;;231;tcc;%GC;67;107;100;tac;%GC;83;177;172;tgc;%GC;64;48;40
tta;%AT;;;389;tca;%AT;;;120;taa;%AT;77;5;5;tga;%GC;;;3
ttg;%AT;60;119;67;tcg;%GC;;;138;tag;%GC;;;1;tgg;%GC;;;89
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ctt;%AT;63;153;112;cct;%AT;68;104;98;cat;%AT;73;91;91;cgt;%AT;56;134;71
ctc;%GC;;;289;ccc;%GC;;;140;cac;%GC;;;131;cgc;%GC;;;359
cta;%AT;71;54;53;cca;%AT;74;106;106;caa;%AT;80;178;174;cga;%AT;61;28;19
ctg;%GC;71;357;351;ccg;%GC;82;220;213;cag;%GC;68;213;202;cgg;%GC;;;131
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
att;%AT;;;369;act;%AT;82;142;137;aat;%AT;;;399;agt;%AT;;;78
atc;%GC;73;296;295;acc;%GC;77;238;238;aac;%GC;66;171;162;agc;%GC;61;75;56
ata;%AT;;;259;aca;%AT;78;129;129;aaa;%AT;;;622;aga;%AT;;;150
atg;%GC;51;168;135;acg;%GC;69;110;105;aag;%GC;85;325;314;agg;%AT;59;36;19
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;%AT;68;211;198;gct;%AT;66;170;148;gat;%AT;70;329;320;ggt;%AT;63;183;156
gtc;%GC;;;328;gcc;%GC;;;405;gac;%GC;;;447;ggc;%GC;;;419
gta;%AT;70;143;138;gca;%AT;67;141;129;gaa;%AT;67;420;391;gga;%AT;78;159;157
gtg;%GC;70;236;230;gcg;%GC;;;287;gag;%GC;;;513;ggg;%GC;64;70;63

Caractérisation des codons par les courbes et les coefficients de corrélation[modifier | modifier le wikicode]

Les queues. A partir du tableau original normé des 111 bactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Les queues. A partir du tableau original normé des 111 bactéries
  • Tableau partiel pour illustration. Les queues sont en orange. Voir le tableau original normé.
  • Légende:
  1. queue: nombre de bactéries ayant des effectifs faibles de leur codon (en rouge)
  2. moyenne queue: total des effectifs faibles divisé par le nombre de la queue
  3. moyenne codon: total du codon divisé par 111.
  4. %queue: total effectifs faibles de la queue divisé par (moyenne codon x 111) en %.
  • Tableau non formaté à mettre !!!!!!!!
  • Les queues au complet à copier dans un tableur avec une largeur de colonne de 1.3 cm.
moyenne queue;;;;1,7;3,7;3,6;3,0;3,8;3,1;1,1;-;2,1;-;2,8;1,5;1,9;5,6;4,8;-;3,2;-;2,9;-;1,8;-;-;4,1;6,6;3,6;1,3;-;2,2;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;2,1;-;-;;1,9;2,7;-;-;1,5;2,7;-;1,6;3,1;2,0;2,5;-;1,9;7,7;-;-;-;-;-
moyenne codon;;;;120;81;97;30;180;104;247;202;123;125;69;50;38;58;66;55;116;107;133;128;60;20;103;24;132;44;59;70;89;132;88;142;169;54;296;226;217;202;91;108;126;164;27;31;154;71;58;65;101;61;132;84;137;118;68;65;71;121;168;84;181;3;1;2;2
codon;;;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;Trp
queue;;;;35;6;5;20;12;12;8;0;12;0;19;19;16;4;4;1;11;0;15;0;31;2;1;10;19;20;10;1;12;2;0;0;1;0;1;2;0;1;2;2;1;2;19;0;0;*;19;8;1;0;4;13;1;4;14;18;4;1;9;31;0;-;-;-;-
%queue;;;;0,4;0,2;0,2;1,8;0,2;0,3;0,0;-;0,2;-;0,7;0,5;0,7;0,3;0,3;-;0,3;-;0,3;-;0,8;-;-;1,5;0,9;1,5;0,2;-;0,3;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;1,3;-;-;;0,6;0,3;-;-;0,0;0,4;-;0,0;0,6;0,6;0,1;-;0,1;2,6;-;-;-;-;-

Les queues. Les courbes à partir des équations de tendance[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Les queues. Les courbes à partir des équations de tendance
  • Tableau partiel pour illustration. Les queues sont en orange pour les valeurs définies au chapitre précédent. Les constantes des courbes sont là.
  • Tableau non formaté:le tableau complet à copier dans un tableur avec une largeur de colonne de 1.3 cm.
;;;x3;0,00219;-0,00254;-0,00329;-0,00085;-0,00462;0,00016;0,0020;-0,00081;0,00057;-0,00075;-0,00091;-0,0003;-0,0005;-0,0002;-0,0013;-0,0010;0,00031;-0,0006;0,00332;-0,00109;-0,00057;-0,0005;-0,00184;-0,00073;-0,00054;0,00017;-0,00083;-0,0002;-0,00151;-0,00244;-0,00133;-0,00189;-0,00077;-0,00055;-0,0050;0,00137;-0,00373;-0,00054;-0,00215;-0,0029;-0,00083;-0,00112;-0,0002;-0,00067;0,00015;0,00026;-0,00132;-0,00155;-0,00138;-0,00069;-0,00322;-0,00225;-0,00267;0,00051;-0,00112;-0,00135;-0,00108;-0,0020;-0,0001;0,00209;-0,0022;-0,00002;0,00002;0,00002
;;;x2;-0,10807;0,27112;0,37605;0,10907;0,5886;0,0552;-0,05462;0,09348;0,01185;0,11012;0,13691;0,06661;0,07383;0,0518;0,15161;0,09531;0,02553;0,07371;-0,25026;0,1053;0,11578;0,05334;0,16536;0,07548;0,15436;0,01656;0,10415;0,0378;0,21511;0,28701;0,1823;0,19221;0,18284;0,053;0,57426;-0,06858;0,45452;0,14156;0,25617;0,34298;0,15096;0,22101;0,02954;0,07391;-0,0808;-0,04454;0,17482;0,19004;0,19524;0,10805;0,3937;0,28412;0,3257;0,02474;0,16189;0,18781;0,12467;0,26011;0,10638;-0,15088;0,26792;0,00228;-0,00278;-0,00178
;;;x;0,97089;-5,14699;-8,20089;-2,69606;-13,46935;-1,18671;0,91141;1,73297;-0,2492;-0,95591;-3,32039;-1,92933;-1,84844;-0,92575;-2,72647;-1,05602;-0,17738;0,14637;5,41105;0,39031;-3,47503;-0,93631;-1,10015;-1,29967;-3,75165;-0,45048;-1,92709;0,09835;-5,32276;-5,10584;-4,09334;-1,70625;-3,7931;-0,04165;-9,84916;4,28255;-8,84242;-1,61835;-5,40349;-7,43331;-2,8306;-4,8768;-0,63061;-1,24162;7,01628;3,06654;-4,27036;-4,23067;-4,04617;-2,35507;-8,77864;-6,81826;-6,34715;-0,34814;-4,01772;-4,77689;-1,87083;-5,36981;-2,33135;3,01712;-3,7806;0,00351;0,10348;0,05762
aas;KEGG;%AT;%GC;tta;ttg*;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg*;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga*
5 710;zin;86,46;13,54;691,56;-59,96;-24,35;32,86;-85,94;-5,55;989,03;38,59;435,45;5,38;148,22;163,08;88,32;-3,53;-12,35;0,82;375,88;14,00;742,88;21,88;196,65;-5,38;-48,24;-19,95;-23,84;-2,64;75,49;7,73;171,87;-22,57;149,24;67,76;-19,75;7,79;222,54;48,81;222,39;2,70;58,18;46,87;-12,71;-28,29;62,89;-4,93;80,55;34,00;84,48;53,03;-22,42;-13,79;102,88;80,16;-32,85;1,09;138,93;118,40;-5,16;-29,86;509,65;483,81;-7,53;4,42;0,94;0,50
5 760;crp;83,44;16,56;600,71;-17,37;22,67;40,63;-82,62;-3,78;880,72;50,67;392,78;10,97;147,50;151,71;86,75;-2,03;-9,47;4,34;342,99;19,92;637,67;30,41;184,98;2,79;-9,38;-7,00;-22,24;-2,15;82,16;11,04;176,32;-16,92;155,04;97,93;-16,16;11,35;283,37;58,35;259,85;9,58;83,68;83,03;-9,24;-25,23;60,09;-3,33;94,73;39,76;94,00;69,68;-19,72;-12,50;138,00;102,13;-27,90;3,34;141,24;124,75;-1,69;-26,44;470,54;415,33;0,89;4,55;1,04;0,56
5 864;hcr;77,47;22,53;444,84;47,46;91,92;50,53;-57,54;3,11;691,28;77,23;316,83;25,78;141,35;129,41;81,38;3,16;0,66;13,72;283,61;33,85;460,84;49,79;160,64;15,12;51,70;12,91;-12,35;0,20;89,87;18,99;176,58;2,75;158,61;142,64;-1,45;19,68;368,05;77,34;308,59;29,22;119,19;134,24;3,36;-10,50;54,04;1,88;118,78;49,45;104,65;92,13;-7,84;-6,10;185,63;130,84;-8,19;10,55;139,61;129,42;8,78;-11,25;397,39;299,94;25,66;4,66;1,15;0,62
6 157;mcac;76,34;23,66;418,55;57,11;101,81;51,66;-50,38;4,95;658,76;82,62;303,59;29,10;139,55;125,22;80,05;4,46;3,15;15,79;273,13;36,79;431,58;53,77;155,86;16,93;61,12;15,90;-9,50;0,87;90,59;20,69;175,48;7,56;158,21;149,07;2,42;21,40;379,24;81,09;314,38;33,82;123,89;141,18;6,55;-6,49;52,83;3,13;122,77;51,07;105,56;94,97;-4,71;-4,37;191,70;134,28;-3,18;12,37;138,46;129,24;11,23;-7,26;384,11;280,80;31,41;4,66;1,16;0,63
6 041;ssdc;75,76;24,24;405,54;61,71;106,48;52,16;-46,46;5,95;642,59;85,40;296,98;30,85;138,56;123,09;79,34;5,16;4,48;16,87;267,89;38,31;417,18;55,82;153,40;17,80;65,67;17,34;-7,93;1,23;90,87;21,59;174,79;10,13;157,89;152,11;4,52;22,30;384,39;83,03;316,94;36,26;126,06;144,41;8,27;-4,30;52,20;3,79;124,74;51,87;105,89;96,25;-3,01;-3,43;194,45;135,81;-0,49;13,36;137,79;129,03;12,52;-5,10;377,42;271,38;34,45;4,66;1,16;0,64
6 132;sbw;74,93;25,07;387,32;67,97;112,75;52,77;-40,56;7,46;619,86;89,43;287,66;33,43;137,05;120,04;78,29;6,21;6,45;18,46;260,47;40,54;397,08;58,80;149,87;18,97;71,90;19,29;-5,55;1,79;91,18;22,89;173,65;13,94;157,29;156,20;7,69;23,60;391,12;85,85;320,15;39,89;128,89;148,67;10,84;-1,00;51,29;4,77;127,48;52,98;106,23;97,90;-0,47;-2,00;198,01;137,74;3,53;14,86;136,71;128,59;14,44;-1,87;367,90;258,21;38,94;4,65;1,16;0,64
5 709;uur;74,50;25,50;378,07;71,06;115,81;53,04;-37,36;8,29;608,28;91,54;282,90;34,79;136,24;118,46;77,72;6,77;7,50;19,29;256,67;41,71;386,92;60,36;148,03;19,55;75,00;20,26;-4,25;2,10;91,29;23,59;172,99;15,97;156,91;158,19;9,40;24,28;394,32;87,33;321,61;41,83;130,24;150,71;12,22;0,78;50,82;5,29;128,86;53,55;106,34;98,67;0,89;-1,24;199,67;138,62;5,68;15,67;136,10;128,30;15,45;-0,13;363,00;251,56;41,33;4,65;1,16;0,64
6 361;ple;73,83;26,17;363,87;75,67;120,33;53,41;-32,18;9,62;590,44;94,87;275,54;36,97;134,91;115,99;76,82;7,68;9,19;20,62;250,79;43,57;371,37;62,82;145,13;20,41;79,67;21,71;-2,13;2,60;91,41;24,68;171,87;19,23;156,24;161,15;12,17;25,36;398,94;89,67;323,61;44,94;132,18;153,68;14,45;3,68;50,07;6,12;130,98;54,41;106,42;99,76;3,10;0,01;202,04;139,83;9,14;16,98;135,08;127,76;17,08;2,68;355,38;241,37;45,14;4,64;1,16;0,65
6 600;smf;73,69;26,31;360,94;76,60;121,24;53,47;-31,07;9,91;586,76;95,57;274,02;37,43;134,62;115,48;76,62;7,88;9,55;20,90;249,57;43,96;368,18;63,34;144,53;20,58;80,62;22,00;-1,68;2,71;91,42;24,92;171,62;19,92;156,08;161,74;12,76;25,58;399,84;90,17;323,99;45,60;132,56;154,27;14,92;4,30;49,91;6,30;131,41;54,59;106,43;99,97;3,58;0,27;202,50;140,06;9,88;17,26;134,85;127,63;17,42;3,28;353,80;239,27;45,95;4,64;1,16;0,65
6 345;fnc;72,88;27,12;344,42;81,73;126,16;53,80;-24,52;11,62;565,90;99,62;265,38;40,12;132,94;112,53;75,49;9,02;11,65;22,52;242,64;46,23;350,20;66,32;141,04;21,53;85,89;23,61;1,03;3,36;91,45;26,26;170,10;23,97;155,11;164,96;16,27;26,89;404,63;93,04;325,86;49,47;134,58;157,42;17,72;7,97;49,00;7,33;133,86;55,60;106,36;101,06;6,35;1,85;204,89;141,21;14,20;18,94;133,51;126,82;19,42;6,80;344,76;227,48;50,66;4,62;1,16;0,65
6 697;bfl;72,62;27,38;339,23;83,29;127,65;53,88;-22,36;12,18;559,32;100,92;262,66;41,00;132,38;111,59;75,12;9,40;12,33;23,04;240,45;46,96;344,57;67,28;139,92;21,82;87,51;24,11;1,93;3,57;91,44;26,70;169,58;25,30;154,77;165,93;17,42;27,31;406,02;93,98;326,36;50,74;135,17;158,34;18,64;9,18;48,71;7,66;134,62;55,91;106,30;101,37;7,27;2,36;205,57;141,52;15,62;19,49;133,05;126,53;20,08;7,96;341,89;223,78;52,20;4,62;1,16;0,65
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7 207;bmv;31,85;68,15;-7,95;29,03;13,98;-2,69;353,32;226,14;39,53;295,88;22,50;208,91;3,73;-2,28;0,84;114,28;106,86;70,00;30,27;162,40;25,74;170,75;-11,65;8,13;73,26;11,59;290,32;100,02;17,46;115,65;-0,10;212,73;11,59;79,57;346,97;69,23;107,95;406,97;58,93;376,25;18,30;17,48;245,51;339,61;4,71;46,59;150,37;84,42;-1,32;7,96;194,24;122,93;15,74;-1,64;235,17;252,60;0,07;-5,24;109,68;224,90;29,46;10,57;290,35;1,78;0,47;1,99
6 617;tos;31,45;68,55;-8,24;27,27;11,67;-3,36;354,22;229,61;38,09;297,16;21,61;210,36;2,68;-2,89;0,27;115,63;106,77;69,46;29,31;163,14;25,92;170,55;-12,51;7,75;71,71;11,07;294,27;101,71;16,58;116,59;-1,62;212,70;10,19;77,64;351,17;69,03;103,29;412,66;55,41;380,36;16,54;15,23;248,00;343,50;4,41;46,37;149,59;84,67;-2,46;6,69;195,57;124,04;13,13;-3,42;235,47;256,71;-1,08;-6,48;109,70;226,05;27,84;10,67;291,16;1,74;0,47;2,03
7 209;vin;31,06;68,94;-8,48;25,58;9,49;-3,99;354,98;232,96;36,74;298,35;20,77;211,73;1,68;-3,45;-0,27;116,93;106,65;68,91;28,41;163,82;26,12;170,32;-13,32;7,40;70,22;10,58;298,05;103,35;15,75;117,48;-3,05;212,61;8,88;75,80;355,19;68,81;98,87;418,17;52,08;384,29;14,88;13,11;250,37;347,21;4,12;46,15;148,83;84,91;-3,54;5,49;196,82;125,09;10,67;-5,09;235,70;260,68;-2,17;-7,64;109,68;227,11;26,32;10,78;291,88;1,71;0,47;2,07
6 713;age;30,55;69,45;-8,76;23,38;6,63;-4,80;355,80;237,42;35,04;299,90;19,70;213,52;0,40;-4,19;-0,96;118,65;106,44;68,14;27,25;164,70;26,40;169,97;-14,35;6,92;68,26;9,93;303,07;105,53;14,67;118,66;-4,90;212,39;7,17;73,38;360,52;68,51;93,09;425,54;47,73;389,49;12,71;10,34;253,50;352,12;3,74;45,83;147,81;85,23;-4,93;3,93;198,42;126,46;7,45;-7,28;235,89;265,98;-3,58;-9,14;109,62;228,44;24,36;10,95;292,74;1,67;0,48;2,12
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6 487;mts;29,72;70,28;-9,11;19,84;2,07;-6,10;356,73;244,77;32,40;302,33;18,03;216,38;-1,64;-5,33;-2,06;121,46;105,96;66,77;25,42;166,08;26,92;169,26;-15,97;6,16;65,07;8,88;311,29;109,14;12,94;120,57;-7,82;211,78;4,46;69,46;369,21;67,93;83,80;437,79;40,77;398,00;9,24;5,91;258,57;360,08;3,15;45,22;146,08;85,77;-7,15;1,44;200,93;128,65;2,33;-10,74;235,95;274,75;-5,81;-11,52;109,40;230,45;21,27;11,26;293,94;1,59;0,48;2,20
6 581;sma;29,28;70,72;-9,25;17,99;-0,30;-6,76;357,01;248,71;31,08;303,58;17,18;217,86;-2,68;-5,91;-2,62;122,95;105,64;65,99;24,48;166,78;27,22;168,82;-16,79;5,77;63,38;8,34;315,66;111,08;12,04;121,57;-9,33;211,34;3,06;67,40;373,81;67,60;78,97;444,38;37,16;402,51;7,45;3,62;261,23;364,28;2,85;44,87;145,15;86,06;-8,29;0,15;202,21;129,78;-0,32;-12,52;235,85;279,46;-6,95;-12,73;109,22;231,43;19,69;11,45;294,46;1,56;0,49;2,25
6 465;amd;28,71;71,29;-9,38;15,58;-3,35;-7,62;357,14;253,94;29,41;305,17;16,10;219,79;-4,02;-6,64;-3,34;124,91;105,14;64,90;23,28;167,66;27,64;168,16;-17,83;5,25;61,16;7,62;321,42;113,65;10,87;122,89;-11,25;210,61;1,26;64,71;379,88;67,12;72,69;453,18;32,49;408,45;5,13;0,65;264,72;369,80;2,46;44,36;143,88;86,45;-9,75;-1,51;203,82;131,26;-3,74;-14,82;235,58;285,73;-8,42;-14,29;108,93;232,63;17,67;11,72;295,03;1,51;0,49;2,31
6 559;sho;27,96;72,04;-9,47;12,52;-7,23;-8,69;356,92;260,80;27,37;307,15;14,76;222,23;-5,70;-7,55;-4,24;127,47;104,37;63,38;21,78;168,76;28,22;167,19;-19,11;4,59;58,29;6,71;328,93;117,05;9,40;124,59;-13,66;209,45;-1,01;61,25;387,76;66,43;64,70;464,80;26,56;416,18;2,19;-3,09;269,22;376,93;1,96;43,64;142,20;86,97;-11,58;-3,60;205,82;133,12;-8,05;-17,70;234,98;293,99;-10,26;-16,25;108,45;234,02;15,14;12,09;295,57;1,44;0,50;2,39
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6 452;cmi;27,34;72,66;-9,48;10,01;-10,38;-9,56;356,39;266,62;25,77;308,73;13,69;224,23;-7,05;-8,28;-4,96;129,61;103,62;62,02;20,56;169,63;28,73;166,26;-20,12;4,05;55,91;5,96;335,24;119,93;8,19;126,00;-15,61;208,26;-2,84;58,38;394,36;65,80;58,15;474,71;21,73;422,67;-0,20;-6,14;272,95;382,87;1,57;42,97;140,75;87,41;-13,06;-5,30;207,40;134,65;-11,55;-20,03;234,26;301,01;-11,73;-17,82;107,96;235,05;13,11;12,42;295,85;1,39;0,51;2,46
6 571;salb;26,68;73,32;-9,43;7,42;-13,61;-10,44;355,48;272,81;24,18;310,33;12,61;226,29;-8,42;-9,00;-5,69;131,87;102,72;60,49;19,33;170,49;29,28;165,17;-21,13;3,49;53,41;5,19;341,91;123,01;6,96;127,49;-17,57;206,81;-4,71;55,40;401,32;65,08;51,41;485,34;16,77;429,51;-2,65;-9,26;276,85;389,10;1,16;42,21;139,19;87,88;-14,56;-7,04;208,98;136,22;-15,13;-22,40;233,30;308,51;-13,23;-19,40;107,35;235,99;11,05;12,79;295,96;1,34;0,53;2,54
6 532;ksk;25,80;74,20;-9,28;4,06;-17,76;-11,55;353,68;281,20;22,20;312,35;11,25;228,96;-10,16;-9,90;-6,61;134,90;101,34;58,30;17,75;171,57;30,04;163,53;-22,37;2,76;50,10;4,18;350,85;127,18;5,36;129,45;-20,07;204,54;-7,10;51,47;410,62;64,03;42,64;499,82;10,37;438,67;-5,81;-13,27;282,02;397,38;0,65;41,09;137,04;88,53;-16,47;-9,27;210,93;138,25;-19,71;-25,42;231,65;318,69;-15,13;-21,41;106,38;237,02;8,44;13,30;295,81;1,26;0,54;2,65
6 733;ade;25,09;74,91;-9,08;1,43;-20,98;-12,40;351,74;288,07;20,71;313,88;10,22;231,05;-11,49;-10,58;-7,32;137,35;100,06;56,40;16,53;172,37;30,66;162,06;-23,30;2,19;47,45;3,38;358,11;130,62;4,11;131,03;-21,97;202,42;-8,94;48,36;418,14;63,10;35,78;511,78;5,39;446,09;-8,25;-16,38;286,15;404,03;0,25;40,10;135,25;89,07;-17,93;-10,99;212,39;139,85;-23,25;-27,74;230,03;327,08;-16,57;-22,94;105,46;237,66;6,43;13,73;295,45;1,21;0,56;2,73

Les écarts. Moyenne des écarts, en %, par rapport à la courbe théorique. Les queues. Les moyennes des codons.[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Les écarts. Moyenne des écarts, en %, par rapport à la courbe théorique. Les queues. Les moyennes des codons.
  • Tableau partiel pour illustration. Pour repérer les queues, dans le tableau des calculs des écarts, il suffit de copier le format seul du tableau des courbes théoriques après avoir coloré le fond des cellules de queue. Les moyennes des codons sont celles calculées dans le tableau des diagrammes.
  • Totalité du tableau à copier dans un tableur. Largeur de colonne 1.3 cm.
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6 561;sgr;27,77;72,23;100,00;83,03;185,40;100,00;3,24;20,15;96,29;2,00;86,16;1,69;132,69;112,84;144,79;11,17;39,93;46,11;76,68;1,58;78,89;13,63;105,14;12,73;10,97;7,74;19,73;7,72;77,90;7,00;107,00;1,68;994,65;33,92;6,51;18,62;55,43;3,29;64,21;4,81;309,36;398,12;1,41;4,32;62,44;10,38;10,55;10,03;100,00;148,47;1,13;11,07;176,66;127,11;33,67;24,07;118,65;117,91;23,50;7,78;72,50;91,81;5,13;100,00;293,55;65,57
6 452;cmi;27,34;72,66;100,00;49,31;109,78;110,62;32,78;45,06;100,00;19,77;100,00;4,02;100,00;100,00;100,00;9,93;8,74;73,50;100,00;12,03;92,93;7,19;105,05;0,26;63,68;36,19;20,82;25,51;75,22;2,52;106,50;9,67;815,09;40,88;0,90;17,25;93,02;3,29;53,29;11,92;6073,05;314,85;16,04;21,25;100,00;40,94;6,24;6,85;107,77;214,85;17,28;10,07;100,00;110,13;19,40;7,58;134,61;111,40;68,31;20,10;100,00;91,83;4,65;27,03;97,45;64,94
6 571;salb;26,68;73,32;100,00;73,15;129,30;100,00;0,46;11,95;100,00;7,50;92,09;0,43;111,84;100,00;117,52;12,32;39,73;35,74;100,00;5,23;93,19;12,25;100,00;42,76;6,68;61,57;16,04;1,95;57,01;3,20;105,67;4,58;248,22;49,34;4,38;31,08;76,73;5,56;82,17;4,89;475,59;196,87;21,15;4,00;242,77;10,26;7,42;10,02;100,00;170,80;2,22;17,32;119,77;108,90;45,74;25,36;107,53;110,27;28,50;31,36;81,96;100,00;3,00;100,00;100,00;135,55
6 532;ksk;25,80;74,20;100,00;48,01;116,94;100,00;13,40;28,68;100,00;16,86;91,09;5,40;109,87;100,00;100,00;0,40;35,56;24,32;100,00;9,87;96,66;10,37;100,00;63,72;49,96;20,02;7,40;7,76;81,29;4,57;105,00;0,98;156,52;8,45;4,27;57,72;55,32;1,50;80,67;0,57;134,53;122,67;29,25;18,34;519,97;2,39;7,56;13,26;112,17;110,82;15,99;28,92;110,17;100,00;32,48;16,41;106,63;104,68;62,30;38,76;76,23;100,00;5,09;100,00;84,71;89,52
6 733;ade;25,09;74,91;100,00;35,68;113,91;100,00;15,93;6,03;81,21;15,29;100,00;4,85;100,00;100,00;100,00;5,81;15,42;3,41;94,11;3,50;93,65;3,84;104,17;100,00;91,80;13,71;2,41;3,52;100,00;3,20;100,00;4,85;143,54;87,93;0,73;37,21;91,84;4,92;134,73;13,65;111,78;117,82;30,54;22,47;290,41;23,71;2,90;14,81;105,42;135,42;26,87;44,35;104,18;100,00;47,17;37,54;100,00;100,00;7,76;22,23;84,88;92,91;9,97;100,00;248,20;42,30
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;Total sans queue;;;3601;4547;4752;4168;3618;4358;3137;2959;2870;2430;3384;3477;4121;4601;3941;4159;2198;2815;3320;2277;5082;7334;5664;9294;2616;5080;3004;2198;3482;2887;4296;3372;4690;4704;2954;3341;2599;2228;3166;3049;3721;2874;3400;3876;1145;1003;3633;3266;4154;6352;2858;4431;4163;3375;3649;3533;4014;3093;3104;6410;2827;4663;14289;11587
;bactéries sans queue;;;76;106;101;91;95;99;103;111;99;111;92;92;95;107;107;111;100;111;96;111;80;111;111;101;92;91;101;111;97;111;102;111;111;111;111;111;111;111;105;102;106;102;92;106;111;104;92;103;103;102;103;98;106;107;97;93;107;103;102;80;109;111;111;111
;écart (moyenne);;;47;43;47;46;38;44;30;27;29;22;37;38;43;43;37;37;22;25;35;21;64;66;51;92;28;56;30;20;36;26;42;30;42;42;27;30;23;20;30;30;35;28;37;37;10;10;39;32;40;62;28;45;39;32;38;38;38;30;30;80;26;42;129;104
;queue ;;;35;5;10;20;16;12;8;0;12;0;19;19;16;4;4;0;11;0;15;0;31;0;0;10;19;20;10;0;14;0;9;0;0;0;0;0;0;0;6;9;5;9;19;5;0;7;19;8;8;9;8;13;5;4;14;18;4;8;9;31;2;−;−;−
;Moyenne du codon;;;120;81;97;30;180;104;247;202;123;125;69;50;38;58;66;55;116;107;133;128;60;20;103;24;132;44;59;70;89;132;88;142;169;54;296;226;217;202;91;108;126;164;27;31;154;71;58;65;101;61;132;84;137;118;68;65;71;121;168;84;181;3;1;2
;codon;;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga

Les coefficients de corrélation[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Les coefficients de corrélation
  • Les valeurs présentées ici sont les coefficients de corrélation X 100. La corrélation entre 2 codons est celle de 2 colonnes du tableau des diagrammes normalisé. Pour obtenir les valeurs absolues il suffit de copier ce tableau (largeur de colonne 1.3 cm) et de remplacer le moins (-) par rien. Pour extraire le maximum d'une colonne il suffit de remplacer 100 par rien (format sans décimales et option de recherche 'cellule entière').
  • Légende:
  1. moyenne : moyenne des corrélations en valeurs absolues d'un codon.
  2. 74 : nombre de corrélations en valeurs absolues d'un codon supérieures à 0.74.
  3. 79 : nombre de corrélations en valeurs absolues d'un codon supérieures à 0.79.
  4. max : corrélation maximum parmi les valeurs absolues des corrélations d'un codon.
;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
;tta;100.00;8.50;12.70;53.92;-73.34;-64.25;84.42;-71.83;84.81;-82.42;70.92;81.48;77.95;-60.75;-72.21;-64.87;90.06;-79.22;90.98;-81.58;60.60;21.26;-8.03;-8.01;-69.89;-43.60;67.01;-79.76;81.31;-86.50;58.82;25.54;-74.15;-29.50;51.11;-69.35;66.34;-78.21;47.47;49.60;-65.94;-70.97;71.16;-69.97;-40.91;-61.98;62.30;57.64;-70.31;-55.36;55.80;57.45;-71.46;-64.69;74.79;66.81;-59.61;-76.32;84.97;62.14;-78.86;45.00;4.02;-46.08;tta
;ttg;8.50;100.00;31.08;26.41;-42.83;-39.91;10.81;-23.50;18.77;-29.16;33.49;18.62;25.67;-24.92;-21.06;-9.40;22.87;-27.03;8.91;-20.36;3.20;46.30;30.03;12.58;-38.74;-12.52;46.86;-33.08;46.06;-36.14;22.81;36.90;-40.92;8.93;31.61;-30.04;45.68;-38.49;36.03;52.10;-31.52;-33.19;27.72;-14.66;16.12;5.87;31.15;49.26;-29.40;-27.73;39.92;29.39;-18.52;-32.01;30.44;25.11;1.53;-34.16;25.09;-3.83;-23.18;17.68;7.80;-27.55;ttg
;ctt;12.70;31.08;100.00;41.18;-58.20;-39.48;34.68;-22.90;40.65;-48.70;44.12;41.56;40.48;-50.61;-29.01;-8.56;33.18;-30.01;19.26;-35.39;48.52;20.28;-0.61;37.13;-57.29;-40.44;44.98;-46.41;31.31;-41.46;62.02;25.01;-56.34;-11.43;57.65;-37.20;52.42;-51.90;63.50;54.25;-54.28;-52.41;33.52;-22.24;-2.54;-19.46;45.92;68.72;-53.03;-32.86;65.18;49.40;-46.82;-49.78;43.34;61.44;-35.34;-56.30;32.41;27.58;-49.31;22.39;12.50;-33.67;ctt
;cta;53.92;26.41;41.18;100.00;-66.25;-55.10;45.72;-41.12;52.05;-61.63;59.11;61.64;68.33;-55.70;-56.67;-39.06;53.50;-51.19;41.05;-49.94;58.10;25.77;4.49;19.67;-67.99;-43.71;54.42;-57.59;64.90;-66.63;56.23;43.13;-68.69;-16.03;55.48;-45.64;65.56;-64.23;61.00;63.55;-58.84;-64.66;60.10;-56.15;-13.09;-28.57;67.81;64.08;-65.46;-46.55;64.43;68.51;-57.43;-59.77;64.73;67.45;-46.21;-66.32;47.28;40.92;-61.82;36.77;9.23;-45.09;cta
;ctg;-73.34;-42.83;-58.20;-66.25;100.00;47.57;-67.84;49.34;-72.97;73.92;-69.56;-76.22;-76.16;55.71;68.47;56.70;-74.95;66.36;-69.12;73.49;-66.37;-38.30;10.90;-16.51;77.49;43.90;-70.05;75.62;-79.19;89.57;-75.88;-29.12;83.17;22.37;-59.29;59.34;-71.82;77.57;-64.30;-66.05;74.13;76.01;-67.06;62.39;34.55;44.29;-68.94;-77.43;79.31;50.39;-70.34;-64.56;74.83;61.84;-74.08;-79.19;42.92;87.67;-70.42;-54.75;75.05;-32.95;-18.71;44.95;ctg
;ctc;-64.25;-39.91;-39.48;-55.10;47.57;100.00;-68.68;74.24;-70.31;79.79;-71.27;-66.85;-65.93;72.37;56.13;39.42;-76.56;73.08;-61.75;58.26;-45.71;-17.71;-30.46;3.47;72.60;59.38;-74.63;78.58;-70.19;65.20;-49.26;-56.02;70.26;34.25;-70.54;78.28;-80.77;79.40;-67.48;-69.56;63.86;71.78;-62.37;51.87;-10.20;44.94;-65.51;-71.03;57.75;72.53;-72.74;-67.93;62.33;78.17;-72.21;-64.93;61.26;63.98;-72.09;-38.96;70.62;-59.42;9.63;58.89;ctc
;aaa;84.42;10.81;34.68;45.72;-67.84;-68.68;100.00;-78.31;92.94;-84.30;73.28;77.65;72.26;-69.84;-68.17;-52.17;91.32;-74.08;91.53;-71.47;67.42;13.88;-5.93;-0.35;-78.36;-58.06;61.16;-81.71;66.75;-81.54;63.55;30.92;-79.50;-38.10;60.36;-75.54;64.95;-83.56;54.67;45.76;-67.74;-78.57;72.70;-64.71;-39.08;-70.04;58.84;62.01;-69.57;-61.14;62.22;61.00;-74.90;-74.92;67.18;70.33;-64.20;-77.03;83.00;71.22;-76.28;49.30;-0.93;-49.08;aaa
;aag;-71.83;-23.50;-22.90;-41.12;49.34;74.24;-78.31;100.00;-72.63;79.66;-69.49;-67.97;-64.98;61.76;59.31;46.49;-76.72;76.67;-69.80;67.57;-40.21;-27.64;-31.22;24.12;64.91;44.26;-68.56;73.04;-73.86;67.95;-43.40;-46.48;67.80;22.02;-61.72;76.27;-68.38;73.13;-59.05;-54.10;48.76;70.39;-61.88;68.63;8.36;43.93;-61.47;-57.30;51.57;66.53;-60.27;-55.33;61.94;63.88;-66.99;-63.19;52.53;62.84;-77.44;-34.09;66.07;-52.09;10.79;47.70;aag
;ttt;84.81;18.77;40.65;52.05;-72.97;-70.31;92.94;-72.63;100.00;-90.20;76.79;78.92;76.90;-69.27;-67.58;-52.90;91.45;-75.52;90.54;-77.48;63.56;23.12;-7.50;7.92;-79.17;-51.66;68.16;-82.99;69.17;-81.60;64.94;26.96;-81.99;-27.80;55.43;-73.11;67.76;-86.59;56.82;50.11;-72.50;-77.37;80.18;-60.51;-39.95;-63.18;58.89;66.61;-75.74;-55.53;63.34;59.26;-72.05;-75.42;68.54;69.33;-62.60;-78.89;87.33;69.68;-82.53;44.09;4.37;-46.50;ttt
;ttc;-82.42;-29.16;-48.70;-61.63;73.92;79.79;-84.30;79.66;-90.20;100.00;-78.17;-79.39;-83.40;76.25;69.59;50.40;-88.73;81.67;-78.58;81.96;-64.59;-32.48;-5.89;-10.40;84.93;52.33;-79.27;86.64;-81.36;82.61;-67.74;-41.70;86.71;20.50;-70.65;78.31;-82.88;91.28;-72.99;-66.12;73.33;83.39;-79.25;67.35;23.36;55.41;-70.29;-78.50;77.80;61.70;-75.70;-71.71;72.15;81.59;-77.65;-76.46;63.77;81.31;-84.59;-59.62;88.54;-49.05;-5.97;54.12;ttc
;tct;70.92;33.49;44.12;59.11;-69.56;-71.27;73.28;-69.49;76.79;-78.17;100.00;69.54;63.92;-71.59;-56.34;-57.89;74.78;-70.41;68.61;-68.84;60.32;33.65;17.74;3.56;-77.94;-58.45;73.92;-77.53;70.18;-73.08;69.13;41.60;-81.74;-26.18;61.86;-71.51;74.91;-83.42;67.42;71.24;-67.17;-83.37;82.11;-59.58;-14.94;-39.61;69.53;82.34;-71.96;-66.25;73.01;67.36;-70.05;-74.46;78.77;69.21;-59.61;-78.55;75.33;49.46;-73.46;42.45;-1.78;-45.22;tct
;tca;81.48;18.62;41.56;61.64;-76.22;-66.85;77.65;-67.97;78.92;-79.39;69.54;100.00;74.84;-67.40;-74.27;-58.98;81.44;-73.08;78.67;-70.52;67.79;16.28;-1.13;0.20;-76.48;-53.00;66.42;-77.58;79.46;-83.35;66.94;37.79;-79.27;-37.13;63.82;-73.57;74.70;-79.02;65.37;57.82;-71.65;-76.23;62.36;-71.22;-28.47;-61.52;74.31;66.80;-73.91;-61.79;74.35;58.08;-74.94;-69.96;77.20;82.27;-61.26;-81.29;81.65;53.64;-78.08;46.48;7.90;-52.03;tca
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;tcc;-72.21;-21.06;-29.01;-56.67;68.47;56.13;-68.17;59.31;-67.58;69.59;-56.34;-74.27;-69.72;41.66;100.00;39.06;-74.35;64.91;-66.36;63.64;-55.63;-14.61;-1.93;15.84;55.40;49.88;-60.77;69.51;-71.58;74.57;-50.96;-33.04;63.95;35.93;-60.48;67.70;-66.48;71.38;-55.75;-51.64;49.89;65.93;-56.47;65.28;26.12;51.50;-59.98;-57.87;57.84;58.42;-57.04;-58.53;59.19;65.13;-68.15;-66.14;39.62;75.92;-67.16;-43.81;61.61;-44.89;4.66;43.96;tcc
;agc;-64.87;-9.40;-8.56;-39.06;56.70;39.42;-52.17;46.49;-52.90;50.40;-57.89;-58.98;-43.90;30.53;39.06;100.00;-59.33;55.16;-57.70;52.10;-43.73;-16.93;-5.34;11.08;51.79;29.35;-47.10;51.78;-55.62;61.70;-42.93;-27.74;53.84;26.05;-37.97;49.55;-48.29;52.85;-41.18;-39.72;37.15;55.80;-52.10;61.53;18.57;33.45;-53.50;-40.90;39.65;53.61;-48.97;-38.91;59.92;33.94;-53.61;-50.20;31.26;54.43;-58.25;-35.20;53.08;-21.11;-7.55;23.10;agc
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;tac;-79.22;-27.03;-30.01;-51.19;66.36;73.08;-74.08;76.67;-75.52;81.67;-70.41;-73.08;-74.24;51.69;64.91;55.16;-88.25;100.00;-76.89;82.94;-52.30;-33.80;-10.82;13.67;67.25;46.31;-85.27;91.59;-76.88;75.66;-54.05;-34.04;69.69;24.20;-60.30;74.98;-82.59;84.38;-57.82;-57.82;60.52;68.27;-66.74;55.94;8.10;55.50;-57.70;-63.93;56.88;65.57;-63.01;-57.56;69.47;64.01;-68.52;-66.32;51.05;72.78;-76.69;-45.19;66.42;-47.62;2.15;50.63;tac
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;aac;-81.58;-20.36;-35.39;-49.94;73.49;58.26;-71.47;67.57;-77.48;81.96;-68.84;-70.52;-76.79;55.84;63.64;52.10;-82.38;82.94;-80.05;100.00;-60.91;-37.55;15.22;-2.99;64.29;30.08;-77.31;82.53;-72.88;78.50;-64.03;-9.37;71.99;0.53;-50.65;59.96;-71.01;79.87;-51.65;-49.86;63.65;63.25;-67.09;57.80;34.48;49.66;-53.68;-64.66;67.40;43.99;-53.66;-52.41;58.91;59.37;-66.27;-68.36;52.11;76.87;-74.20;-55.60;78.48;-31.64;-12.44;38.85;aac
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;cga;21.26;46.30;20.28;25.77;-38.30;-17.71;13.88;-27.64;23.12;-32.48;33.65;16.28;30.68;-13.72;-14.61;-16.93;24.59;-33.80;14.72;-37.55;6.41;100.00;6.41;2.97;-32.76;-0.62;45.80;-28.09;42.30;-26.08;35.33;5.27;-37.78;22.29;18.66;-20.72;36.04;-35.08;25.06;32.56;-26.16;-28.95;29.43;-17.76;-2.40;0.99;20.52;35.55;-25.16;-14.85;23.38;17.43;-22.67;-15.74;20.25;24.24;-1.55;-29.63;33.84;-4.81;-21.26;-5.11;19.12;-7.50;cga
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;cct;57.64;49.26;68.72;64.08;-77.43;-71.03;62.01;-57.30;66.61;-78.50;82.34;66.80;70.19;-73.45;-57.87;-40.90;68.20;-63.93;53.96;-64.66;59.77;35.55;16.74;17.07;-81.43;-58.58;74.12;-74.22;71.46;-71.99;73.25;47.77;-83.92;-21.52;72.95;-66.74;82.50;-82.91;78.70;85.36;-77.62;-80.48;69.00;-55.23;-7.89;-37.66;69.62;100.00;-80.14;-58.31;81.31;75.97;-67.03;-77.25;77.31;77.15;-55.32;-79.18;66.92;42.77;-76.59;44.59;6.18;-53.80;cct
;ccg;-70.31;-29.40;-53.03;-65.46;79.31;57.75;-69.57;51.57;-75.74;77.80;-71.96;-73.91;-74.55;77.63;57.84;39.65;-70.74;56.88;-66.29;67.40;-66.22;-25.16;6.19;-26.09;80.03;49.61;-59.18;69.46;-70.76;79.78;-70.24;-35.96;84.38;15.16;-62.00;58.96;-69.29;77.99;-65.50;-66.95;89.00;69.09;-69.11;57.65;28.61;49.67;-74.20;-80.14;100.00;30.87;-70.43;-67.06;63.93;75.01;-74.57;-73.44;67.40;74.34;-70.35;-58.16;80.15;-42.09;-15.48;53.96;ccg
;ccc;-55.36;-27.73;-32.86;-46.55;50.39;72.53;-61.14;66.53;-55.53;61.70;-66.25;-61.79;-57.04;48.63;58.42;53.61;-66.02;65.57;-54.72;43.99;-41.49;-14.85;-38.50;24.25;60.60;66.39;-64.89;66.96;-62.82;58.74;-41.06;-61.03;58.11;57.11;-61.11;72.02;-72.38;67.20;-68.89;-64.05;34.02;79.31;-54.48;59.65;-4.60;41.70;-69.36;-58.31;30.87;100.00;-67.99;-59.15;68.22;59.25;-68.64;-60.73;38.09;65.49;-61.79;-27.30;48.90;-47.90;18.99;39.69;ccc
;gtt;55.80;39.92;65.18;64.43;-70.34;-72.74;62.22;-60.27;63.34;-75.70;73.01;74.35;66.79;-75.13;-57.04;-48.97;65.52;-63.01;49.65;-53.66;56.82;23.38;26.71;12.16;-81.70;-63.01;68.59;-73.30;71.28;-70.13;65.26;61.51;-81.58;-31.62;80.74;-74.87;84.97;-79.79;83.47;83.99;-68.20;-83.65;59.74;-57.75;1.30;-44.64;81.01;81.31;-70.43;-67.99;100.00;66.76;-75.85;-76.75;82.11;76.15;-58.21;-75.89;69.71;33.33;-72.27;50.81;3.54;-57.77;gtt
;gta;57.45;29.39;49.40;68.51;-64.56;-67.93;61.00;-55.33;59.26;-71.71;67.36;58.08;69.74;-68.03;-58.53;-38.91;67.80;-57.56;49.61;-52.41;63.20;17.43;15.17;16.77;-77.07;-60.95;63.83;-68.42;64.99;-69.36;65.50;53.39;-77.83;-29.08;72.43;-59.47;75.01;-75.69;74.03;67.00;-67.21;-77.31;65.52;-56.89;-6.91;-34.29;66.68;75.97;-67.06;-59.15;66.76;100.00;-67.24;-77.58;71.75;75.97;-52.55;-73.58;53.52;51.52;-70.35;48.28;-0.42;-52.97;gta
;gtg;-71.46;-18.52;-46.82;-57.43;74.83;62.33;-74.90;61.94;-72.05;72.15;-70.05;-74.94;-67.69;59.28;59.19;59.92;-76.77;69.47;-69.13;58.91;-61.64;-22.67;-5.65;1.96;75.41;62.20;-63.45;74.23;-69.50;77.13;-65.25;-45.06;74.77;49.52;-62.79;68.16;-69.06;72.36;-63.87;-63.20;68.67;74.43;-62.63;64.64;17.10;49.61;-68.01;-67.03;63.93;68.22;-75.85;-67.24;100.00;52.55;-74.54;-73.72;57.96;71.06;-70.55;-50.28;64.94;-48.83;1.90;49.70;gtg
;gtc;-64.69;-32.01;-49.78;-59.77;61.84;78.17;-74.92;63.88;-75.42;81.59;-74.46;-69.96;-70.59;80.94;65.13;33.94;-76.49;64.01;-64.77;59.37;-58.11;-15.74;-21.42;-11.46;79.55;65.05;-67.84;78.11;-67.95;70.86;-62.11;-53.26;83.09;26.67;-76.05;75.88;-81.38;87.07;-76.82;-69.49;70.86;83.98;-68.65;52.56;10.80;56.42;-70.77;-77.25;75.01;59.25;-76.75;-77.58;52.55;100.00;-75.21;-72.30;61.78;78.40;-74.13;-50.94;76.69;-53.11;-1.53;59.54;gtc
;act;74.79;30.44;43.34;64.73;-74.08;-72.21;67.18;-66.99;68.54;-77.65;78.77;77.20;75.30;-72.96;-68.15;-53.61;73.12;-68.52;65.94;-66.27;60.03;20.25;20.55;-4.65;-76.41;-59.75;69.07;-74.03;80.01;-78.92;63.44;56.11;-80.16;-36.15;69.68;-72.82;80.96;-77.75;74.13;81.91;-70.03;-81.50;66.48;-67.04;-9.23;-43.51;83.27;77.31;-74.57;-68.64;82.11;71.75;-74.54;-75.21;100.00;69.02;-66.15;-78.58;75.15;41.00;-77.06;51.84;-3.65;-53.67;act
;aca;66.81;25.11;61.44;67.45;-79.19;-64.93;70.33;-63.19;69.33;-76.46;69.21;82.27;72.82;-69.30;-66.14;-50.20;74.52;-66.32;62.75;-68.36;67.85;24.24;3.95;8.63;-77.34;-56.22;69.70;-75.89;73.20;-81.18;73.25;39.71;-80.50;-30.21;75.34;-69.09;75.37;-79.13;76.62;65.58;-74.15;-77.86;63.51;-66.10;-21.49;-48.03;74.92;77.15;-73.44;-60.73;76.15;75.97;-73.72;-72.30;69.02;100.00;-54.79;-85.32;69.86;50.68;-76.19;42.81;8.96;-49.84;aca
;acg;-59.61;1.53;-35.34;-46.21;42.92;61.26;-64.20;52.53;-62.60;63.77;-59.61;-61.26;-54.87;70.88;39.62;31.26;-61.19;51.05;-60.07;52.11;-57.48;-1.55;3.43;-12.50;63.59;46.30;-41.58;56.15;-48.23;57.34;-49.81;-32.32;61.57;24.20;-47.10;48.41;-53.30;60.80;-48.15;-48.22;73.17;49.84;-56.12;44.04;17.12;44.44;-57.87;-55.32;67.40;38.09;-58.21;-52.55;57.96;61.78;-66.15;-54.79;100.00;41.94;-57.86;-51.11;63.07;-40.47;0.47;42.48;acg
;acc;-76.32;-34.16;-56.30;-66.32;87.67;63.98;-77.03;62.84;-78.89;81.31;-78.55;-81.29;-77.91;66.99;75.92;54.43;-81.97;72.78;-73.42;76.87;-70.13;-29.63;0.29;-13.58;81.08;55.52;-76.71;84.34;-78.28;86.38;-76.62;-34.08;85.62;25.20;-70.61;71.80;-80.23;87.34;-71.99;-67.92;66.58;89.03;-71.17;64.86;29.62;54.42;-72.27;-79.18;74.34;65.49;-75.89;-73.58;71.06;78.40;-78.58;-85.32;41.94;100.00;-76.99;-58.20;81.63;-41.96;-8.70;48.70;acc
;att;84.97;25.09;32.41;47.28;-70.42;-72.09;83.00;-77.44;87.33;-84.59;75.33;81.65;72.24;-66.41;-67.16;-58.25;85.57;-76.69;84.85;-74.20;45.53;33.84;15.32;-13.37;-72.85;-50.66;72.96;-79.84;82.56;-78.69;56.74;38.43;-78.79;-30.90;60.01;-79.09;74.70;-83.89;60.07;62.12;-68.68;-76.89;67.39;-63.95;-30.32;-65.69;67.32;66.92;-70.35;-61.79;69.71;53.52;-70.55;-74.13;75.15;69.86;-57.86;-76.99;100.00;37.84;-75.43;51.61;-1.72;-51.44;att
;ata;62.14;-3.83;27.58;40.92;-54.75;-38.96;71.22;-34.09;69.68;-59.62;49.46;53.64;54.38;-46.67;-43.81;-35.20;66.91;-45.19;69.32;-55.60;75.97;-4.81;-43.75;43.32;-61.85;-38.26;34.08;-58.23;30.36;-61.00;62.49;1.49;-59.63;-19.77;30.54;-38.33;35.14;-56.49;32.25;15.66;-56.95;-53.33;64.78;-37.76;-45.19;-40.02;32.01;42.77;-58.16;-27.30;33.33;51.52;-50.28;-50.94;41.00;50.68;-51.11;-58.20;37.84;100.00;-71.17;14.51;16.02;-20.95;ata
;atc;-78.86;-23.18;-49.31;-61.82;75.05;70.62;-76.28;66.07;-82.53;88.54;-73.46;-78.08;-76.98;72.88;61.61;53.08;-79.38;66.42;-74.43;78.48;-72.28;-21.26;11.08;-29.40;82.02;44.93;-65.54;76.09;-70.89;79.49;-75.46;-29.46;84.30;13.89;-63.44;66.15;-71.26;79.82;-67.25;-61.96;75.55;78.74;-72.66;62.49;35.07;43.78;-66.31;-76.59;80.15;48.90;-72.27;-70.35;64.94;76.69;-77.06;-76.19;63.07;81.63;-75.43;-71.17;100.00;-35.89;-16.16;44.34;atc
;taa;45.00;17.68;22.39;36.77;-32.95;-59.42;49.30;-52.09;44.09;-49.05;42.45;46.48;36.78;-53.93;-44.89;-21.11;48.72;-47.62;40.84;-31.64;17.60;-5.11;41.63;-14.50;-47.38;-44.30;44.03;-50.53;50.94;-43.83;19.01;52.88;-46.16;-25.71;58.25;-60.17;52.11;-51.81;44.00;47.29;-37.49;-49.90;33.08;-40.76;8.03;-37.93;54.42;44.59;-42.09;-47.90;50.81;48.28;-48.83;-53.11;51.84;42.81;-40.47;-41.96;51.61;14.51;-35.89;100.00;-48.15;-80.24;taa
;tag;4.02;7.80;12.50;9.23;-18.71;9.63;-0.93;10.79;4.37;-5.97;-1.78;7.90;10.18;-5.05;4.66;-7.55;3.89;2.15;2.06;-12.44;16.12;19.12;-33.42;28.41;-6.13;8.88;-1.48;0.44;6.23;-13.84;22.25;-23.30;-9.90;20.03;-2.97;11.08;0.73;-2.58;7.69;-0.73;-12.86;-4.18;3.35;2.80;-10.18;-6.34;-4.77;6.18;-15.48;18.99;3.54;-0.42;1.90;-1.53;-3.65;8.96;0.47;-8.70;-1.72;16.02;-16.16;-48.15;100.00;-11.17;tag
;tga;-46.08;-27.55;-33.67;-45.09;44.95;58.89;-49.08;47.70;-46.50;54.12;-45.22;-52.03;-44.03;60.32;43.96;23.10;-52.04;50.63;-40.76;38.85;-26.65;-7.50;-27.98;0.29;52.72;44.10;-47.06;54.02;-57.04;53.23;-32.21;-45.02;54.01;15.47;-62.47;57.89;-58.58;57.50;-54.69;-52.76;47.27;55.56;-37.10;37.11;-10.15;43.44;-54.86;-53.80;53.96;39.69;-57.77;-52.97;49.70;59.54;-53.67;-49.84;42.48;48.70;-51.44;-20.95;44.34;-80.24;-11.17;100.00;tga
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Moyenne ;;61.22;26.59;39.24;51.49;61.95;59.99;62.66;56.77;63.71;67.78;62.53;63.55;62.31;58.24;54.77;42.62;66.22;60.10;58.87;57.57;53.21;22.41;18.22;13.48;66.59;48.54;60.03;66.19;63.32;66.27;55.96;39.56;68.58;26.82;58.17;61.70;65.77;69.45;59.18;56.78;59.46;66.88;57.82;53.28;19.47;43.21;60.23;63.00;61.28;53.86;62.65;58.39;60.14;62.95;64.09;63.05;48.35;66.03;63.21;44.32;63.79;41.99;9.28;44.79;
;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
 74;;18;0;0;0;20;9;20;8;22;34;16;27;20;8;4;0;31;17;13;14;2;0;0;0;29;1;14;30;21;29;6;0;33;1;8;17;28;37;13;7;9;33;8;0;0;0;12;21;17;1;19;10;12;24;25;21;0;30;23;1;26;1;0;1;
 79;;13;0;0;0;6;4;11;1;15;25;7;12;7;3;0;0;20;8;10;8;1;0;0;0;17;0;6;19;12;21;2;0;28;0;4;6;21;27;6;4;3;17;5;0;0;0;3;11;7;1;11;0;0;7;10;6;0;17;13;0;11;1;0;1;
max;;90.98;52.10;68.72;68.69;89.57;80.77;92.94;79.66;92.94;91.28;83.42;83.35;83.40;80.94;75.92;64.87;92.36;91.59;92.05;82.94;82.93;46.30;69.88;43.32;95.68;74.87;90.01;92.36;88.14;89.57;82.93;69.88;95.68;74.87;86.37;86.37;91.48;92.27;83.47;85.36;89.00;89.03;82.11;73.30;55.16;71.53;83.27;85.36;89.00;79.31;84.97;77.83;77.13;87.07;83.27;85.32;73.17;89.03;87.33;75.97;88.54;80.24;48.15;80.24;

Tableau synthétique des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des abscisses et maxima des courbes de tendance.[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableau des abscisses et maxima des courbes de tendance.
- (*): ttg et agg, sont reportés en %AT et tga en %GC.
- (75) abscisse sans maximum, valeur de max à 75.
- (75) abscisse supérieure à 75 pour le maximum, valeur de max à 75.
  • Tableau non formaté du 18.2.17
;abscis;max;;;abscis;max;;;abscis;max;;;abscis;max
ttt;75;288;;tct;75;137;;tat;75;261;;tgt;75;51
ttc;75;231;;tcc;67;107;;tac;75;172;;tgc;64;48
tta;75;389;;tca;75;120;;taa;75;5;;tga*;75;3
ttg*;60;119;;tcg;75;138;;tag;75;1;;tgg;75;89
;;;;;;;;;;;;;;
ctt;63;153;;cct;68;104;;cat;73;91;;cgt;56;134
ctc;75;289;;ccc;75;140;;cac;75;131;;cgc;75;359
cta;71;54;;cca;74;106;;caa;75;174;;cga;61;28
ctg;71;357;;ccg;75;213;;cag;68;213;;cgg;75;131
;;;;;;;;;;;;;;
att;75;369;;act;75;137;;aat;75;399;;agt;75;78
atc;73;296;;acc;75;238;;aac;66;171;;agc;61;75
ata;75;259;;aca;75;129;;aaa;75;622;;aga;75;150
atg;51;168;;acg;69;110;;aag;75;314;;agg*;59;36
;;;;;;;;;;;;;;
gtt;68;211;;gct;66;170;;gat;70;329;;ggt;63;183
gtc;75;328;;gcc;75;405;;gac;75;447;;ggc;75;419
gta;70;143;;gca;67;141;;gaa;67;420;;gga;75;157
gtg;70;236;;gcg;75;287;;gag;75;513;;ggg;64;70
Caractérisation par les diagrammes et les coefficients de corrélation[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Caractérisation par les diagrammes et les coefficients de corrélation
  • Voir l'article pour une définition des paramètres plus élaborée.
  1. Le paramètre R2 est le coefficient de détermination des courbes de tendance. Pour comparaison avec le paramètre écart.
  2. Le paramètre queue a été déterminé à partir des courbes calculées à partir des coefficients du polynôme de degré 3 du diagramme de chaque codon. Voir le tableau de ces calculs. Il est exprimé ici en nombre de bactéries dont les effectifs des codons sont nulles ou très faibles au début des abscisses, voir le tableau de la 1ère détermination de ces queues avec des effectifs qui ne dépassent pas 3% du total. Sur 32 queues de longueur supérieure à 4, 5 seulement ont des effectifs qui dépassent 1% du total.
  3. Le paramètre écart est l'équivalent du R2 mais calculé pour les effectifs sans la queue du codon. C'est la moyenne des différences, en valeur absolue et en % par rapport à la valeur théorique, entre cette valeur théorique et l'effectif compté du codon. Quand une différence est très élevée à cause d'un effectif théorique très faible, elle est ignorée et la queue rallongée. Voir le tableau de ces calculs.
  4. Le paramètre abscis est l'abscisse du maximum de la courbe de tendance. Il est exprimé en %GC ou %AT. Voir le tableau de ces calculs. Pour les courbes sans maximum l'abscisse 75% (AT ou GC) est utilisée pour comparaison. Quand l'abscisse du maximum dépasse 75% elle est seulement indiquée sous la forme 75/xx où xx est l'abscisse en question.
  5. Le paramètre moyen, pour moyenne, est la moyenne du codon sur les 111 bactéries. C'est la somme des effectifs d'un codon divisé par 111.
  6. La colonne %: c'est le pourcentage d'un codon dans la constitution de son acide aminé.
  7. Le paramètre max est l'ordonnée de l'abscisse abscis. C'est le maximum de la courbe ou la valeur pour l'abscisse 75% quand ce maximum n'existe pas ou si son abscisse est supérieure à 75%.
  8. La colonne %moy c'est le rapport max/moyen dans le but de normaliser les courbes.
  9. La colonne cor 79 correspond au nombre de corrélations supérieures à 0.79 pour un codon donné avec les autres codons (l'identité exclue).
  10. La colonne cor tot correspond à la moyenne des corrélations d'un codon avec les autres codons. Cette moyenne est reportée en fin du tableau des corrélations.
  • Tableaux non formatés du 13.3.17
codon;R2;écart;queue;Moyen.;%;abscis;max;%moy.;Cor 79;cor tot;;codon;R2;écart;queue;Moyen.;%;abscis;max;%moy.;Cor 79;cor tot
atg;985;10;0;154;−;51;168;109;0;19.5;;act;891;38;14;68;21;75/82;137;200;10;64.1
tgg;970;10;7*;71;−;75;89;125;0;43.2;;acc;932;30;8;121;37;75;238;196;17;66.0
;;;;;;;;;;;;aca;884;38;18;65;20;75/78;129;198;6;63.0
tat;967;22;11;116;52;75;261;226;20;66.2;;acg;832;38;4;71;22;69;110;155;0;48.4
tac;927;25;0;107;48;75/83;172;161;8;60.1;;;;;;325;;;;;;
;;;;222;;;;;;;;gct;911;30;9;108;22;66;170;156;4;56.8
cat;914;30;10;59;46;73;91;155;6;60.0;;gcc;931;28;9;164;33;75;405;247;17;66.9
cac;962;20;0;70;54;75;131;189;19;66.2;;gca;929;30;6;91;19;67;141;155;6;59.2
;;;;;128;;;;;;;gcg;882;35;5;126;26;75;287;228;3;59.5
caa;880;36;14;89;40;75/80;174;196;12;63.3;;;;;;490;;;;;;
cag;964;26;0;132;60;68;213;161;21;66.3;;gtt;944;28;8;132;28;68;211;160;11;62.7
;;;;220;;;;;;;;gtc;916;32;4;118;25;75;328;278;7;62.9
aat;966;35;15;133;51;75;399;300;10;58.9;;gta;888;45;13;84;18;70;143;171;0;58.4
aac;951;21;0;128;49;66;171;133;8;57.6;;gtg;907;39;5;137;29;70;236;172;0;60.1
;;;;261;;;;;;;;;;;;471;;;;;;
aaa;957;30;8;247;55;75;622;252;11;62.7;;ggt;900;30;0;142;31;63;183;129;0;39.6
aag;918;27;0;202;45;75/85;314;155;1;56.8;;ggc;956;42;0;169;37;75;419;248;28;68.6
;;;;450;;;;;;;;gga;847;42;9;88;19;75/78;157;178;2;56.0
gat;965;23;0;217;52;70;329;152;21;65.8;;ggg;710;42;0;54;12;64;70;131;0;26.8
gac;970;20;0;202;48;75;447;222;27;69.4;;;;;;453;;;;;;
;;;;419;;;;;;;;tta;925;47;35;120;20;75;389;324;13;61.2
gaa;951;27;0;296;57;67;420;142;4;58.2;;ttg*;765;43;5;81;13;60;119;147;0;26.6
gag;924;30;0;226;43;75;513;227;6;61.7;;;;;;;;;;;;
;;;;;521;;;;;;;ctt;805;47;10;97;16;63;153;158;0;39.2
ttt;947;29;12;123;50;75;288;235;15;63.7;;ctc;839;44;12;104;17;75;289;278;4;60.0
ttc;963;22;0;125;50;75;231;185;25;67.8;;cta;756;46;20;30;5;71;54;183;0;51.5
;;;;248;;;;;;;;ctg;878;38;16;180;30;71;357;198;6;61.9
tgt;850;37;19;27;46;75;51;193;5;57.8;;;;;;611;;;;;;
tgc;874;37;5;31;54;64;48;154;0;53.3;;agt;876;43;16;38;11;75/86;78;205;7;62.3
;;;;58;;;;;;;;agc;857;37;0;55;16;61;75;136;0;42.6
att;913;30;9;168;39;75;369;219;13;63.2;;;;;;;;;;;;
atc;938;26;2;181;42;73;296;163;11;63.8;;tct;876;37;19;69;20;75;137;200;7;62.5
ata;691;80;31;84;19;75;259;310;0;44.3;;tcc;868;37;4;66;20;67;107;162;0;54.8
;;;;433;;;;;;;;tca;893;38;19;50;15;75;120;240;12;63.5
;;;;;;;;;;;;tcg;853;43;4;58;17;75;138;236;3;58.2
tga*;727;104;−;2;−;75;3;180;1;44.8;;;;;;336;;;;;;
taa;835;42;−;3;−;75/77;5;151;1;42.0;;aga;715;64;31;60;16;75;150;251;1;53.2
tag;488;129;−;1;−;75;1;95;0;9.3;;agg*;308;92;10;24;6;59;36;148;0;13.5
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
cct;941;32;8;65;23;68;104;160;11;63.0;;cgt;736;51;0;103;27;56;134;131;0;18.2
ccc;735;62;9;61;21;75;140;228;1;53.9;;cgc;938;28;19;132;34;75;359;272;17;66.6
cca;851;39;19;58;20;74;106;182;3;60.2;;cga;571;66;0;20;5;61;28;136;0;22.4
ccg;885;40;8;101;35;75/82;213;210;7;61.3;;cgg;699;56;20;44;12;75;131;297;0;48.5
;;;;286;;;;;;;;;;;;383;;;;;;
Diagramme corcodon[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Diagramme corcodon
  • moyenne du codon en fonction de sa corrélation moyenne ( cor tot). La corrélation moyenne est donnée au bas de la matrice des corrélations entre codons. La moyenne des codons se trouve au bas du tableau des diagrammes étendus des codons. Voir le diagramme.
;cor tot;moyen;;;cor tot;moyen;;;cor tot;moyen;;;cor tot;moyen
tag;9.3;1.1;;cta;51.5;29.6;;ctc;60.0;104.0;;att;63.2;168.5
agg*;13.5;24.5;;aga;53.2;59.7;;cat;60.0;58.9;;caa;63.3;88.6
cgt;18.2;102.5;;tgc;53.3;31.0;;tac;60.1;106.8;;tca;63.5;50.2
atg;19.5;154.3;;ccc;53.9;61.4;;gtg;60.1;137.3;;ttt;63.7;122.8
cga;22.4;20.5;;tcc;54.8;65.8;;cca;60.2;58.5;;atc;63.8;181.2
ttg*;26.6;80.6;;gga;56.0;88.3;;tta;61.2;120.0;;act;64.1;68.4
ggg;26.8;53.7;;aag;56.8;202.5;;ccg;61.3;101.4;;gat;65.8;216.8
ctt;39.2;96.8;;gct;56.8;108.5;;gag;61.7;225.8;;acc;66.0;121.1
ggt;39.6;142.2;;aac;57.6;128.4;;ctg;61.9;180.4;;cac;66.2;69.5
taa;42.0;3.3;;tgt;57.8;26.6;;agt;62.3;38.3;;tat;66.2;115.7
agc;42.6;54.7;;gaa;58.2;295.6;;tct;62.5;68.6;;cag;66.3;131.9
tgg;43.2;71.4;;tcg;58.2;58.2;;gtt;62.7;131.8;;cgc;66.6;131.8
ata;44.3;83.7;;gta;58.4;83.7;;aaa;62.7;247.0;;gcc;66.9;163.9
tga*;44.8;1.7;;aat;58.9;133.1;;gtc;62.9;117.9;;ttc;67.8;124.8
acg;48.4;70.7;;gca;59.2;91.4;;cct;63.0;64.7;;ggc;68.6;168.9
cgg;48.5;44.1;;gcg;59.5;125.8;;aca;63.0;65.0;;gac;69.4;201.8

Tableaux des parallèles. Diagramme / coefficient de corrélation[modifier | modifier le wikicode]

  • Voir l'article pour la définition des paramètres pour l'établissement des matrices du paramètre diag. Ces paramètres sont donnés avant la matrice pour être utilisés dans un tableur.
  1. écart: C'est la moyenne des différences, en valeur absolue et en % par rapport à la valeur théorique, entre cette valeur théorique et l'effectif compté du codon. Voir le tableau de ces calculs.
  2. q3: C'est la cotation du paramètre queue, nombre de bactéries, en continu, ayant des effectifs faibles ou nuls. Le tableau des cotations pour les paramètres q3 et a3 donne la correspondance entre le %AT ou le %GC et le rang de la dernière bactérie de la queue avant le décollage de la courbe. Voir le tableau de ces calculs.
  3. a3: Cotation du paramètre abscis, abscisse du maximum de la courbe de tendance. Il est exprimé en %GC ou %AT. Voir le tableau de ces calculs. Le tableau des cotations pour les paramètres q3 et a3 donne la correspondance entre a3 et abscis.
  4. moyen.: pour moyenne, est la moyenne des effectifs du codon sur les 111 bactéries. En tant que moyenne ce paramètre n'a pas de sens biologique, car que veut dire l'absence d'un codon pour une bactérie donnée? Par contre la somme des effectifs correspond en mathématique à l'intégrale d'une courbe continue.C'est une caractéristique mathématique du diagramme. Voir calculs.
cor 79: nombre de coefficients du codon supérieurs à 79; pour illustration. Voir le tableau des coefficients.
cor tot: corrélation moyenne, moyenne des valeurs absolues des coefficients (multipliés par 100) du codon; pour illustration. Voir calculs.
Matrice de calcul du paramètre diag %AT (diagramme)[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Matrice de calcul du paramètre diag %AT (diagramme)
  • Le paramètre diag est la somme des différences entre 2 codons, en valeur absolue et en %, des paramètres e, q3, a3 et moyen. Ici écart=e, queue=q3 et abscis=a3 (Voir l'introduction). Son calcul est le suivant:
diag = 200*(abs((e1-e2)/(e1+e2))+abs((q31-q32)/(q31+q32))+abs((a31-a32)/(a31+a32))+abs((moyen1-moyen2)/(moyen1+moyen2))).
La matrice de calcul de diag est une matrice symétrique dont la diagonale est nulle.
codon;aaa;aat;aca;act;aga;agg*;agt;ata;att;caa;cat;cca;cct;cga;cgt;cta;ctt;gaa;gat;gca;gct;gga;ggt;gta;gtt;taa;tat;tca;tct;tgt;tta;ttg*;ttt;;
écart;30;35;38;38;64;92;43;80;30;36;30;39;32;66;51;46;47;27;23;30;30;42;30;45;28;42;22;38;37;37;47;43;29;;
q3;11;17;20;17;35;14;20;35;11;17;14;23;11;5;5;23;14;5;5;8;11;11;5;17;11;5;14;23;23;23;38;8;14;;
Moyen.;247;133;65;68;60;24;38;84;168;89;59;58;65;20;103;30;97;296;217;91;108;88;142;84;132;3;116;50;69;27;120;81;123;;
a3;5;5;11;8;5;32;5;5;5;11;17;17;23;29;35;20;26;23;20;23;23;11;26;20;23;14;5;5;5;5;5;29;5;;
Cor 79;11;10;6;10;1;0;7;0;13;12;6;3;11;0;0;0;0;4;21;6;4;2;0;0;11;1;20;12;7;5;13;0;15;;
cor tot;62,7;58,9;63,0;64,1;53,2;13,5;62,3;44,3;63,2;63,3;60,0;60,2;63,0;22,4;18,2;51,5;39,2;58,2;65,8;59,2;56,8;56,0;39,6;58,4;62,7;42,0;66,2;63,5;62,5;57,8;61,2;26,6;63,7;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;aaa;aat;aca;act;aga;agg*;agt;ata;att;caa;cat;cca;cct;cga;cgt;cta;ctt;gaa;gat;gca;gct;gga;ggt;gta;gtt;taa;tat;tca;tct;tgt;tta;ttg*;ttt;;
aaa;0;116;272;223;297;434;239;293;38;229;258;329;250;459;358;388;290;235;234;253;208;202;265;301;199;396;129;225;203;251;223;308;96;;aaa
aat;116;0;169;119;204;394;149;194;79;119;221;230;249;459;323;305;217;340;315;251;206;178;264;192;194;413;78;129;100;170;118;284;45;;aat
aca;272;169;0;54;188;307;140;226;244;53;112;71;147;368;298;165;177;354;333;213;203;99;298;117;228;335;220;115;98;176;218;209;199;;aca
act;223;119;54;0;180;318;133;208;195;62;130;123;162;385;305;214;182;365;345;220;208;111;306;124;233;356;169;107;79;166;200;215;148;;act
aga;297;204;188;180;0;352;136;56;270;239;269;199;308;393;375;261;298;493;476;367;363;258;438;256;387;464;247;110;108;171;104;335;229;;aga
agg*;434;394;307;318;352;0;297;355;420;318;246;272;244;155;284;181;205;407;419;304;285;309;357;243;301;400;399;347;375;288;435;244;384;;agg*
agt;239;149;140;133;136;297;0;188;219;189;224;174;269;363;377;165;265;451;440;332;319;215;406;215;341;386;201;55;87;66;174;299;180;;agt
ata;293;194;226;208;56;355;188;0;261;226;321;254;345;432;365;311;288;491;468;354;350;247;427;245;375;492;232;163;135;219;95;331;217;;ata
att;38;79;244;195;270;420;219;261;0;196;232;303;222;447;324;371;256;272;246;220;174;170;228;269;162;394;93;200;174;235;187;277;60;;att
caa;229;119;53;62;239;318;189;226;196;0;121;123;157;383;263;212;136;317;293;163;152;59;253;87;178;334;169;166;133;215;209;189;148;;caa
cat;258;221;112;130;269;246;224;321;232;121;0;78;70;320;271;174;136;269;249;129;114;141;222;112;137;327;204;198;194;255;315;174;182;;cat
cca;329;230;71;123;199;272;174;254;303;123;78;0;133;327;278;97;157;331;311;198;188;161;280;95;213;333;280;129;132;191;245;189;259;;cca
cct;250;249;147;162;308;244;269;345;222;157;70;133;0;272;208;195;115;221;227;71;56;130;166;118;82;332;245;242;220;298;338;107;223;;cct
cga;459;459;368;385;393;155;363;432;447;383;320;327;272;0;178;238;269;282;298;271;310;334;235;305;326;259;476;408;435;352;469;208;457;;cga
cgt;358;323;298;305;375;284;377;365;324;263;271;278;208;178;0;304;138;201;200;150;174;213;113;196;200;293;336;377;351;428;327;106;318;;cgt
cta;388;305;165;214;261;181;165;311;371;212;174;97;195;238;304;0;184;359;345;254;241;237;326;127;260;332;357;191;221;152;293;233;336;;cta
ctt;290;217;177;182;298;205;265;288;256;136;136;157;115;269;138;184;0;264;264;116;92;125;176;64;118;353;226;269;243;322;250;93;207;;ctt
gaa;235;340;354;365;493;407;451;491;272;317;269;331;221;282;201;359;264;0;58;164;179;299;96;287;156;289;330;434;414;457;423;230;314;;gaa
gat;234;315;333;345;476;419;440;468;246;293;249;311;227;298;200;345;264;58;0;167;180;274;94;261;155;286;282;420;397;450;399;233;291;;gat
gca;253;251;213;220;367;304;332;354;220;163;129;198;71;271;150;254;116;164;167;0;49;139;103;135;76;314;238;306;274;355;330;71;216;;gca
gct;208;206;203;208;363;285;319;350;174;152;114;188;56;310;174;241;92;179;180;49;0;125;116;123;27;345;190;296;265;341;294;120;168;;gct
gga;202;178;99;111;258;309;215;247;170;59;141;161;130;334;213;237;125;299;274;139;125;0;235;113;151;285;189;212;184;266;227;133;169;;gga
ggt;265;264;298;306;438;357;406;427;228;253;222;280;166;235;113;326;176;96;94;103;116;235;0;226;104;283;283;382;353;421;350;147;250;;ggt
gta;301;192;117;124;256;243;215;245;269;87;112;95;118;305;196;127;64;287;261;135;123;113;226;0;149;336;241;218;190;274;237;118;221;;gta
gtt;199;194;228;233;387;301;341;375;162;178;137;213;82;326;200;260;118;156;155;76;27;151;104;149;0;355;189;320;290;360;300;146;164;;gtt
taa;396;413;335;356;464;400;386;492;394;334;327;333;332;259;293;332;353;289;286;314;345;285;283;336;355;0;441;409;418;392;449;302;416;;taa
tat;129;78;220;169;247;399;201;232;93;169;204;280;245;476;336;357;226;330;282;238;190;189;283;241;189;441;0;181;150;225;169;296;33;;tat
tca;225;129;115;107;110;347;55;163;200;166;198;129;242;408;377;191;269;434;420;306;296;212;382;218;320;409;181;0;34;64;154;297;159;;tca
tct;203;100;98;79;108;375;87;135;174;133;194;132;220;435;351;221;243;414;397;274;265;184;353;190;290;418;150;34;0;89;129;269;129;;tct
tgt;251;170;176;166;171;288;66;219;235;215;255;191;298;352;428;152;322;457;450;355;341;266;421;274;360;392;225;64;89;0;201;354;202;;tgt
tta;223;118;218;200;104;435;174;95;187;209;315;245;338;469;327;293;250;423;399;330;294;227;350;237;300;449;169;154;129;201;0;321;143;;tta
ttg*;308;284;209;215;335;244;299;331;277;189;174;189;107;208;106;233;93;230;233;71;120;133;147;118;146;302;296;297;269;354;321;0;276;;ttg*
ttt;96;45;199;148;229;384;180;217;60;148;182;259;223;457;318;336;207;314;291;216;168;169;250;221;164;416;33;159;129;202;143;276;0;;ttt
Matrice de calcul du paramètre diag %GC (diagramme)[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Matrice de calcul du paramètre diag %GC (diagramme)
  • Le paramètre diag est la somme des différences entre 2 codons, en valeur absolue et en %, des paramètres e, q3, a3 et moyen. Ici écart=e, queue=q3 et abscis=a3 (Voir l'introduction). Son calcul est le suivant:
diag = 200*(abs((e1-e2)/(e1+e2))+abs((q31-q32)/(q31+q32))+abs((a31-a32)/(a31+a32))+abs((moyen1-moyen2)/(moyen1+moyen2))).
La matrice de calcul de diag est une matrice symétrique dont la diagonale est nulle.
codon;aac;aag;acc;acg;agc;atc;atg;cac;cag;ccc;ccg;cgc;cgg;ctc;ctg;gac;gag;gcc;gcg;ggc;ggg;gtc;gtg;tac;tag;tcc;tcg;tga*;tgc;tgg;ttc;;
écart;21;27;30;38;37;26;10;20;26;62;40;28;56;44;38;20;30;28;35;42;42;32;39;25;129;37;43;104;37;10;22;;
q3;5;5;11;8;5;5;5;5;5;11;11;23;23;14;20;5;5;11;8;5;5;8;8;5;5;8;8;5;8;5;5;;
Moyen.;128;202;121;71;55;181;154;70;132;61;101;132;44;104;180;202;226;164;126;169;54;118;137;107;1;66;58;2;31;71;125;;
a3;14;5;5;11;17;5;29;5;11;5;5;5;5;5;8;5;5;5;5;5;14;5;8;5;5;11;5;5;14;5;5;;
Cor 79;8;1;17;0;0;11;0;19;21;1;7;17;0;4;6;27;6;17;3;28;0;7;0;8;0;0;3;1;0;0;25;;
cor tot;57,6;56,8;66,0;48,4;42,6;63,8;19,5;66,2;66,3;53,9;61,3;66,6;48,5;60,0;61,9;69,4;61,7;66,9;59,5;68,6;26,8;62,9;60,1;60,1;9,3;54,8;58,2;44,8;53,3;43,2;67,8;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;aac;aag;acc;acg;agc;atc;atg;cac;cag;ccc;ccg;cgc;cgg;ctc;ctg;gac;gag;gcc;gcg;ggc;ggg;gtc;gtg;tac;tag;tcc;tcg;tga*;tgc;tgg;ttc;;
aac;0;166;213;187;158;152;154;158;50;341;258;258;414;283;268;141;188;225;195;191;152;192;170;134;436;192;287;424;225;224;104;;aac
aag;166;0;137;251;258;14;257;127;120;262;182;177;328;208;213;29;23;102;120;63;256;116;169;67;329;255;204;315;319;190;67;;aag
acc;213;137;0;181;282;129;338;170;173;135;47;85;224;77;167;165;136;36;51;142;281;39;117;104;396;186;137;380;264;229;109;;acc
acg;187;251;181;0;115;245;324;185;143;170;149;260;257;184;206;278;248;214;138;215;110;142;100;201;425;9;108;406;105;240;229;;acg
agc;158;258;282;115;0;253;261;195;162;245;251;348;298;282;301;284;253;312;240;223;34;246;209;212;411;109;175;392;123;254;240;;agc
atc;152;14;129;245;253;0;243;116;107;256;175;169;323;201;205;36;37;93;112;55;251;108;161;54;331;249;198;317;316;179;54;;atc
atg;154;257;338;324;261;243;0;280;192;445;376;379;518;399;364;232;277;315;317;272;288;315;288;262;509;329;400;501;361;221;234;;atg
cac;158;127;170;185;195;116;280;0;164;191;181;226;269;210;318;99;147;191;160;156;193;143;224;67;341;187;138;327;277;72;67;;cac
cag;50;120;173;143;162;107;192;164;0;305;219;213;376;245;220;143;142;180;156;147;156;152;122;99;405;147;248;390;228;226;98;;cag
ccc;341;262;135;170;245;256;445;191;305;0;92;218;114;110;251;284;259;166;156;207;221;160;199;213;338;165;74;315;244;236;239;;ccc
ccg;258;182;47;149;251;175;376;181;219;92;0;131;181;35;166;208;180;83;67;130;236;71;110;126;375;158;92;357;242;233;155;;ccg
cgc;258;177;85;260;348;169;379;226;213;218;131;0;165;115;120;205;187;93;122;192;347;118;179;161;453;264;215;438;340;287;160;;cgc
cgg;414;328;224;257;298;323;518;269;376;114;181;165;0;153;219;351;323;252;238;273;270;243;280;287;398;252;150;375;268;317;311;;cgg
ctc;283;208;77;184;282;201;399;210;245;110;35;115;153;0;150;233;206;113;96;146;257;100;140;151;389;192;113;370;276;260;180;;ctc
ctg;268;213;167;206;301;205;364;318;220;251;166;120;219;150;0;239;212;144;176;183;293;193;116;258;472;214;246;456;286;372;257;;ctg
gac;141;29;165;278;284;36;232;99;143;284;208;205;351;233;239;0;51;129;147;89;282;143;195;85;344;282;229;332;346;166;56;;gac
gag;188;23;136;248;253;37;277;147;142;259;180;187;323;206;212;51;0;113;118;62;252;114;168;89;322;251;199;308;312;207;89;;gag
gcc;225;102;36;214;312;93;315;191;180;166;83;93;252;113;144;129;113;0;80;118;311;75;128;128;401;219;168;386;289;252;127;;gcc
gcg;195;120;51;138;240;112;317;160;156;156;67;122;238;96;176;147;118;80;0;94;240;17;66;95;357;142;94;340;220;215;93;;gcg
ggc;191;63;142;215;223;55;272;156;147;207;130;192;273;146;183;89;62;118;94;0;199;111;120;95;299;223;145;281;293;207;93;;ggc
ggg;152;256;281;110;34;251;288;193;156;221;236;347;270;257;293;282;252;311;240;199;0;245;196;211;388;104;150;367;114;249;238;;ggg
gtc;192;116;39;142;246;108;315;143;152;160;71;118;243;100;193;143;114;75;17;111;245;0;83;78;364;147;99;348;226;202;88;;gtc
gtg;170;169;117;100;209;161;288;224;122;199;110;179;280;140;116;195;168;128;66;120;196;83;0;160;396;108;136;378;188;277;159;;gtg
tac;134;67;104;201;212;54;262;67;99;213;126;161;287;151;258;85;89;128;95;95;211;78;160;0;330;206;157;316;287;130;30;;tac
tag;436;329;396;425;411;331;509;341;405;338;375;453;398;389;472;344;322;401;357;299;388;364;396;330;0;426;339;66;439;366;339;;tag
tcc;192;255;186;9;109;249;329;187;147;165;158;264;252;192;214;282;251;219;142;223;104;147;108;206;426;0;103;407;97;246;234;;tcc
tcg;287;204;137;108;175;198;400;138;248;74;92;215;150;113;246;229;199;168;94;145;150;99;136;157;339;103;0;318;172;193;184;;tcg
tga*;424;315;380;406;392;317;501;327;390;315;357;438;375;370;456;332;308;386;340;281;367;348;378;316;66;407;318;0;417;357;325;;tga*
tgc;225;319;264;105;123;316;361;277;228;244;242;340;268;276;286;346;312;289;220;293;114;226;188;287;439;97;172;417;0;336;311;;tgc
tgg;224;190;229;240;254;179;221;72;226;236;233;287;317;260;372;166;207;252;215;207;249;202;277;130;366;246;193;357;336;0;132;;tgg
ttc;104;67;109;229;240;54;234;67;98;239;155;160;311;180;257;56;89;127;93;93;238;88;159;30;339;234;184;325;311;132;0;;ttc
Paramètres q3 a3[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Paramètres q3 a3
  • Légende: voir caractérisation des codons et tableaux des parallèles.
  • Notes pour les diagrammes %AT: */86 abscisse optimale, 86 abscisse maximale, ttg* et agg* reportés en %AT au lieu de en %GC.
  • Notes pour les diagrammes %GC: */85 abscisse optimale non considérée pour les calculs, 75 abscisse maximale, tga* reporté en %GC au lieu de en %AT.
  • Tableaux non formatés du 13.3.17
codon;queue;rang;q3;écart;abscis;a3;Moyen.;Cor 79;cor tot;;codon;queue;rang;q3;écart;abscis;a3;Moyen.;Cor 79;cor tot
aaa;29.3;8;11;30;86;5;247;11;62.7;;aac;13.5;0;5;21;66;14;128;8;57.6
aat;32.6;15;17;35;86;5;133;10;58.9;;aag;13.5;0;5;27;*/85;5;202;1;56.8
aca;34.6;18;20;38;78;11;65;6;63.0;;acc;26.2;8;11;30;75;5;121;17;66.0
act;31.9;14;17;38;82;8;68;10;64.1;;acg;23.7;4;8;38;69;11;71;0;48.4
aga;40.9;31;35;64;86;5;60;1;53.2;;agc;13.5;0;5;37;61;17;55;0;42.6
agg*;30.0;10;14;92;59;32;24;0;13.5;;atc;16.6;2;5;26;73;5;181;11;63.8
agt;33.4;16;20;43;*/86;5;38;7;62.3;;atg;13.5;0;5;10;51;29;154;0;19.5
ata;40.9;31;35;80;86;5;84;0;44.3;;cac;13.5;0;5;20;75;5;70;19;66.2
att;29.7;9;11;30;86;5;168;13;63.2;;cag;13.5;0;5;26;68;11;132;21;66.3
caa;31.9;14;17;36;80;11;89;12;63.3;;ccc;26.3;9;11;62;75;5;61;1;53.9
cat;30.0;10;14;30;73;17;59;6;60.0;;ccg;26.2;8;11;40;*/82;5;101;7;61.3
cca;35.0;19;23;39;74;17;58;3;60.2;;cgc;31.4;19;23;28;75;5;132;17;66.6
cct;29.3;8;11;32;68;23;65;11;63.0;;cgg;32.1;20;23;56;75;5;44;0;48.5
cga;25.1;0;5;66;61;29;20;0;22.4;;ctc;28.3;12;14;44;75;5;104;4;60.0
cgt;25.1;0;5;51;56;35;103;0;18.2;;ctg;29.9;16;20;38;71;8;180;6;61.9
cta;35.7;20;23;46;71;20;30;0;51.5;;gac;13.5;0;5;20;75;5;202;27;69.4
ctt;30.0;10;14;47;63;26;97;0;39.2;;gag;13.5;0;5;30;75;5;226;6;61.7
gaa;25.1;0;5;27;67;23;296;4;58.2;;gcc;26.3;9;11;28;75;5;164;17;66.9
gat;25.1;0;5;23;70;20;217;21;65.8;;gcg;24.2;5;8;35;75;5;126;3;59.5
gca;28.0;6;8;30;67;23;91;6;59.2;;ggc;13.5;0;5;42;75;5;169;28;68.6
gct;29.7;9;11;30;66;23;108;4;56.8;;ggg;13.5;0;5;42;64;14;54;0;26.8
gga;29.7;9;11;42;78;11;88;2;56.0;;gtc;23.7;4;8;32;75;5;118;7;62.9
ggt;25.1;0;5;30;63;26;142;0;39.6;;gtg;24.2;5;8;39;70;8;137;0;60.1
gta;31.4;13;17;45;70;20;84;0;58.4;;tac;13.5;0;5;25;*/83;5;107;8;60.1
gtt;29.3;8;11;28;68;23;132;11;62.7;;tag;13.5;0;5;129;75;5;1;0;9.3
taa;25.1;0;5;42;77;14;3;1;42.0;;tcc;23.7;4;8;37;67;11;66;0;54.8
tat;30.6;11;14;22;86;5;116;20;66.2;;tcg;23.7;4;8;43;75;5;58;3;58.2
tca;35.0;19;23;38;86;5;50;12;63.5;;tga*;13.5;0;5;104;75;5;2;1;44.8
tct;35.0;19;23;37;86;5;69;7;62.5;;tgc;24.2;5;8;37;64;14;31;0;53.3
tgt;35.0;19;23;37;86;5;27;5;57.8;;tgg;13.5;0;5;10;75;5;71;0;43.2
tta;42.8;35;38;47;86;5;120;13;61.2;;ttc;13.5;0;5;22;75;5;125;25;67.8
ttg*;27.8;5;8;43;60;29;81;0;26.6;;;;;;;;;;;
ttt;31.1;12;14;29;86;5;123;15;63.7;;*/85;optimal non considéré pour les calculs;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;75;max;;tga*;%GC au lieu de %AT;;;;;
*/86;optimal;;ttg*;agg*;%AT au lieu de %GC;;;;;;;;;;;;;;;
86;max;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tableaux des parallèles %AT[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableaux des parallèles %AT
  • Ces 30 parallèles sont faits pour les couples dont le paramètre diag est inférieur à 100. Le paramètre cor est tiré du tableau des corrélations et les autres paramètres sont ceux du tableau synthétique.
  • Légende: voir caractérisation des codons et tableaux des parallèles.
  • diag/cor la 1ère ligne indique la valeur de diag la 2ème, la corrélation entre les 2 codons du parallèle.
  • Nota: ici l’abscisse du maximum peut aller jusqu'à 86% AT car les bactéries peuvent atteindre ce taux. Quand la courbe de tendance n'a pas de maximum c'est ce taux qui est indiqué. Si le maximum a exactement 86% alors c'est indiqué sous la forme */86.
  • Les 2 tableaux non formatés du 15.3.17
codon;écart;queue;Moyen.;abscis;Cor 79;cor tot;diag/cor;;codon;écart;queue;Moyen.;abscis;Cor 79;cor tot;diag/cor
;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;28;8;132;68;11;62.7;27;;tca;38;19;50;86;12;63.5;64
gct;30;9;108;66;4;56.8;84;;tgt;37;19;27;86;5;57.8;62
;;;;;;;;;;;;;;;;
tat;22;11;116;86;20;66.2;33;;gta;45;13;84;70;0;58.4;64
ttt;29;12;123;86;15;63.7;91;;ctt;47;10;97;63;0;39.2;49
;;;;;;;;;;;;;;;;
tct;37;19;69;86;7;62.5;34;;tgt;37;19;27;86;5;57.8;66
tca;38;19;50;86;12;63.5;70;;agt;43;16;38;86;7;62.3;72
;;;;;;;;;;;;;;;;
att;30;9;168;86;13;63.2;38;;cct;32;8;65;68;11;63.0;70
aaa;30;8;247;86;11;62.7;83;;cat;30;10;59;73;6;60.0;74
;;;;;;;;;;;;;;;;
ttt;29;12;123;86;15;63.7;45;;ttg*;43;5;81;60;0;26.6;71
aat;35;15;133;86;10;58.9;91;;gca;30;6;91;67;6;59.2;36
;;;;;;;;;;;;;;;;
gct;30;9;108;66;4;56.8;49;;gca;30;6;91;67;6;59.2;71
gca;30;6;91;67;6;59.2;75;;cct;32;8;65;68;11;63.0;79
;;;;;;;;;;;;;;;;
aca;38;18;65;78;6;63.0;53;;cca;39;19;58;74;3;60.2;71
caa;36;14;89;80;12;63.3;73;;aca;38;18;65;78;6;63.0;75
;;;;;;;;;;;;;;;;
aca;38;18;65;78;6;63.0;54;;gtt;28;8;132;68;11;62.7;76
act;38;14;68;82;10;64.1;69;;gca;30;6;91;67;6;59.2;83
;;;;;;;;;;;;;;;;
tca;38;19;50;86;12;63.5;55;;cca;39;19;58;74;3;60.2;78
agt;43;16;38;86;7;62.3;75;;cat;30;10;59;73;6;60.0;62
;;;;;;;;;;;;;;;;
gct;30;9;108;66;4;56.8;56;;tat;22;11;116;86;20;66.2;78
cct;32;8;65;68;11;63.0;85;;aat;35;15;133;86;10;58.9;92
;;;;;;;;;;;;;;;;
aga;64;31;60;86;1;53.2;56;;tct;37;19;69;86;7;62.5;79
ata;80;31;84;86;0;44.3;76;;act;38;14;68;82;10;64.1;79
;;;;;;;;;;;;;;;;
gaa;27;0;296;67;4;58.2;58;;att;30;9;168;86;13;63.2;79
gat;23;0;217;70;21;65.8;79;;aat;35;15;133;86;10;58.9;85
;;;;;;;;;;;;;;;;
caa;36;14;89;80;12;63.3;59;;gtt;28;8;132;68;11;62.7;82
gga;42;9;88;78;2;56.0;56;;cct;32;8;65;68;11;63.0;81
;;;;;;;;;;;;;;;;
att;30;9;168;86;13;63.2;60;;gta;45;13;84;70;0;58.4;87
ttt;29;12;123;86;15;63.7;87;;caa;36;14;89;80;12;63.3;65
;;;;;;;;;;;;;;;;
act;38;14;68;82;10;64.1;62;;ata;80;31;84;86;0;44.3;95
caa;36;14;89;80;12;63.3;80;;tta;47;35;120;86;13;61.2;62
Tableaux des parallèles %GC[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableaux des parallèles %GC
  • Ces 30 parallèles sont faits pour les couples dont le paramètre diag est inférieur à 100. Le paramètre cor est tiré du tableau des corrélations et les autres paramètres sont ceux du tableau synthétique.
  • Légende: voir caractérisation des codons et tableaux des parallèles.
  • diag/cor la 1ère ligne indique la valeur de diag la 2ème, la corrélation entre les 2 codons du parallèle.
  • Nota: ici l’abscisse du maximum peut aller jusqu'à 75% GC car les bactéries peuvent atteindre ce taux. Quand la courbe de tendance n'a pas de maximum c'est ce taux qui est indiqué. Si le maximum a une abscisse supérieure à 75% alors cette abscisse est indiquée sous la forme */xx où xx est l'abscisse en question. Cela reste une caractéristique de la courbe même si biologiquement cette abscisse n'est pas atteinte.
  • Tableaux non formatés du 15.3.17
codon;écart;queue;Moyen.;abscis;Cor 79;cor tot;diag/cor;;codon;écart;queue;Moyen.;abscis;Cor 79;cor tot;diag/cor
;;;;;;;;;;;;;;;;
tcc;37;4;66;67;0;54.8;9;;gag;30;0;226;75;6;61.7;51
acg;38;4;71;69;0;48.4;40;;gac;20;0;202;75;27;69.4;81
;;;;;;;;;;;;;;;;
aag;27;0;202;75/85;1;56.8;14;;ttc;22;0;125;75;25;67.8;54
atc;26;2;181;73;11;63.8;66;;atc;26;2;181;73;11;63.8;89
;;;;;;;;;;;;;;;;
gtc;32;4;118;75;7;62.9;17;;tac;25;0;107;75/83;8;60.1;54
gcg;35;5;126;75;3;59.5;71;;atc;26;2;181;73;11;63.8;66
;;;;;;;;;;;;;;;;
gag;30;0;226;75;6;61.7;23;;ggc;42;0;169;75;28;68.6;55
aag;27;0;202;75/85;1;56.8;76;;atc;26;2;181;73;11;63.8;84
;;;;;;;;;;;;;;;;
gac;20;0;202;75;27;69.4;29;;ttc;22;0;125;75;25;67.8;56
aag;27;0;202;75/85;1;56.8;73;;gac;20;0;202;75;27;69.4;91
;;;;;;;;;;;;;;;;
ttc;22;0;125;75;25;67.8;30;;ggc;42;0;169;75;28;68.6;62
tac;25;0;107;75/83;8;60.1;82;;gag;30;0;226;75;6;61.7;73
;;;;;;;;;;;;;;;;
agc;37;0;55;61;0;42.6;34;;ggc;42;0;169;75;28;68.6;63
ggg;42;0;54;64;0;26.8;26;;aag;27;0;202;75/85;1;56.8;68
;;;;;;;;;;;;;;;;
ctc;44;12;104;75;4;60.0;35;;tga*;104;−;2;75;1;44.8;66
ccg;40;8;101;75/82;7;61.3;58;;tag;129;−;1;75;0;9.3;11
;;;;;;;;;;;;;;;;
gac;20;0;202;75;27;69.4;36;;gtg;39;5;137;70;0;60.1;66
atc;26;2;181;73;11;63.8;80;;gcg;35;5;126;75;3;59.5;69
;;;;;;;;;;;;;;;;
gcc;28;9;164;75;17;66.9;36;;tac;25;0;107;75/83;8;60.1;67
acc;30;8;121;75;17;66.0;89;;aag;27;0;202;75/85;1;56.8;77
;;;;;;;;;;;;;;;;
gag;30;0;226;75;6;61.7;37;;tac;25;0;107;75/83;8;60.1;67
atc;26;2;181;73;11;63.8;66;;cac;20;0;70;75;19;66.2;92
;;;;;;;;;;;;;;;;
gtc;32;4;118;75;7;62.9;39;;ttc;22;0;125;75;25;67.8;67
acc;30;8;121;75;17;66.0;78;;cac;20;0;70;75;19;66.2;87
;;;;;;;;;;;;;;;;
ccg;40;8;101;75/82;7;61.3;47;;gcg;35;5;126;75;3;59.5;67
acc;30;8;121;75;17;66.0;74;;ccg;40;8;101;75/82;7;61.3;89
;;;;;;;;;;;;;;;;
aac;21;0;128;66;8;57.6;50;;ttc;22;0;125;75;25;67.8;67
cag;26;0;132;68;21;66.3;79;;aag;27;0;202;75/85;1;56.8;80
;;;;;;;;;;;;;;;;
gcg;35;5;126;75;3;59.5;51;;gtc;32;4;118;75;7;62.9;71
acc;30;8;121;75;17;66.0;67;;ccg;40;8;101;75/82;7;61.3;75
Diagramme diagcor-gc[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Diagramme diagcor-gc
  • Tableau numérique. Voir le diagramme
aac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag
68;166;77;213;52;187;52;158;78;152;34;154;83;158;79;50;44;341;67;258;64;258;30;414;58;283;73;268;80;141
82;104;63;137;53;251;46;258;66;14;8;257;73;127;68;120;67;262;52;182;65;177;44;328;74;208;49;213;73;29
80;67;50;224;42;181;54;282;82;129;30;338;84;170;86;173;65;135;74;47;81;85;56;224;64;77;88;167;87;165
81;109;44;190;58;225;31;115;63;245;17;324;56;185;57;143;38;170;67;149;64;260;46;257;61;184;43;206;61;278
64;229;54;229;69;319;39;424;53;253;19;261;52;195;62;162;54;245;40;251;52;348;29;298;39;282;57;301;53;284
50;240;44;240;65;264;48;315;56;287;35;243;76;116;79;107;49;256;80;175;82;169;45;323;71;201;75;205;80;36
89;54;33;254;44;105;49;380;62;204;64;192;10;280;31;192;-5;445;29;376;20;379;-2;518;-10;399;35;364;19;232
23;234;44;179;62;123;42;406;67;137;59;255;-12;436;83;164;67;191;69;181;80;226;60;269;79;210;76;318;92;99
87;67;26;221;62;316;23;392;71;108;76;186;11;329;83;134;59;305;80;219;82;213;49;376;65;245;90;220;84;143
83;98;61;72;29;361;44;317;31;175;40;9;-9;396;77;67;59;170;31;92;61;218;66;114;73;110;50;251;67;284
62;239;55;226;58;277;-10;501;73;198;39;109;0;425;73;104;62;169;59;192;80;131;50;181;58;35;79;166;78;208
78;155;42;236;72;228;54;327;14;400;62;249;-8;411;51;201;71;117;64;116;1;152;54;165;73;115;77;120;87;205
85;160;50;233;60;244;53;390;65;138;26;329;-16;331;55;212;58;100;78;39;22;256;72;191;59;153;44;219;60;351
52;311;49;287;58;242;40;315;65;248;70;187;-10;509;66;54;60;209;62;142;25;281;68;63;64;195;48;150;79;233
80;180;50;317;63;340;54;357;49;74;75;147;0;341;8;262;65;161;34;246;24;110;86;142;49;120;63;225;78;239
74;257;45;260;42;268;53;438;78;92;58;165;-14;405;92;67;17;288;77;108;26;34;62;215;67;51;70;102;60;188
91;56;44;372;52;276;44;375;80;215;58;158;19;338;76;99;74;224;11;315;14;251;54;223;73;138;89;36;76;23
78;89;61;166;62;286;59;370;52;150;55;264;-15;375;66;213;77;122;78;143;1;288;84;55;37;240;50;214;72;136
83;127;57;207;62;346;45;456;72;113;50;252;-6;453;57;126;68;199;71;152;29;193;26;272;76;112;56;312;48;248
73;93;52;252;56;312;58;332;56;246;56;192;9;398;67;161;64;110;59;160;29;156;81;156;21;317;79;93;50;253
87;93;47;215;67;289;58;308;77;229;68;214;10;389;46;287;75;179;75;71;57;221;85;147;73;160;17;315;66;37
20;238;50;207;51;220;56;386;62;199;71;282;-19;472;73;151;62;280;80;118;15;236;58;207;76;156;79;191;-3;277
82;88;37;249;68;293;47;340;75;168;68;251;-3;344;66;258;62;140;65;243;19;347;84;130;34;156;78;180;81;147
72;159;56;202;30;114;54;281;73;94;66;219;11;322;84;85;75;116;78;100;75;270;96;192;89;67;79;166;71;142
82;30;50;277;53;226;15;367;79;145;50;142;-4;401;75;89;72;195;62;193;34;257;54;273;80;122;69;83;72;259
-6;339;55;130;65;188;60;348;16;150;64;223;-13;357;68;128;68;168;87;143;22;293;70;146;52;238;87;93;59;180
70;234;-6;366;56;287;50;378;81;99;36;104;-10;299;61;95;74;128;76;114;25;282;83;183;64;96;67;252;70;187
76;184;52;246;3;439;51;316;59;136;65;147;20;388;70;95;69;66;84;75;45;252;90;89;74;176;72;113;66;323
54;325;46;193;65;97;-11;66;52;157;59;108;-2;364;24;211;75;120;71;17;35;311;73;62;76;147;76;144;78;206
67;311;43;357;56;172;44;407;-5;339;65;206;2;396;64;78;50;196;83;111;23;240;88;118;59;118;87;129;59;212
55;132;34;336;37;417;60;318;42;103;5;426;2;330;69;160;53;83;27;245;16;199;82;94;60;80;78;113;81;51
  • Paramètre diag voir diag gc
  • Coefficients de corrélations gc:
;aac;aag;acc;acg;agc;atc;atg;cac;cag;ccc;ccg;cgc;cgg;ctc;ctg;gac;gag;gcc;gcg;ggc;ggg;gtc;gtg;tac;tag;tcc;tcg;tga;tgc;tgg;ttc
aac;100.0;67.6;76.9;52.1;52.1;78.5;34.5;82.5;78.5;44.0;67.4;64.3;30.1;58.3;73.5;79.9;60.0;63.3;63.7;72.0;0.5;59.4;58.9;82.9;-12.4;63.6;55.8;38.8;57.8;49.7;82.0
aag;67.6;100.0;62.8;52.5;46.5;66.1;8.4;73.0;67.9;66.5;51.6;64.9;44.3;74.2;49.3;73.1;76.3;70.4;48.8;67.8;22.0;63.9;61.9;76.7;10.8;59.3;61.8;47.7;68.6;43.9;79.7
acc;76.9;62.8;100.0;41.9;54.4;81.6;29.6;84.3;86.4;65.5;74.3;81.1;55.5;64.0;87.7;87.3;71.8;89.0;66.6;85.6;25.2;78.4;71.1;72.8;-8.7;75.9;67.0;48.7;64.9;54.4;81.3
acg;52.1;52.5;41.9;100.0;31.3;63.1;17.1;56.2;57.3;38.1;67.4;63.6;46.3;61.3;42.9;60.8;48.4;49.8;73.2;61.6;24.2;61.8;58.0;51.0;0.5;39.6;70.9;42.5;44.0;44.4;63.8
agc;52.1;46.5;54.4;31.3;100.0;53.1;18.6;51.8;61.7;53.6;39.7;51.8;29.4;39.4;56.7;52.9;49.6;55.8;37.1;53.8;26.1;33.9;59.9;55.2;-7.6;39.1;30.5;23.1;61.5;33.5;50.4
atc;78.5;66.1;81.6;63.1;53.1;100.0;35.1;76.1;79.5;48.9;80.1;82.0;44.9;70.6;75.0;79.8;66.2;78.7;75.5;84.3;13.9;76.7;64.9;66.4;-16.2;61.6;72.9;44.3;62.5;43.8;88.5
atg;34.5;8.4;29.6;17.1;18.6;35.1;100.0;10.2;31.3;-4.6;28.6;19.9;-1.7;-10.2;34.6;19.2;-2.6;16.7;21.2;26.3;1.3;10.8;17.1;8.1;-10.2;26.1;14.0;-10.2;29.2;25.7;23.4
cac;82.5;73.0;84.3;56.2;51.8;76.1;10.2;100.0;83.4;67.0;69.5;79.7;59.9;78.6;75.6;92.3;81.0;79.0;72.7;81.4;29.5;78.1;74.2;91.6;0.4;69.5;65.0;54.0;58.5;60.7;86.6
cag;78.5;67.9;86.4;57.3;61.7;79.5;31.3;83.4;100.0;58.7;79.8;81.5;49.4;65.2;89.6;83.9;70.8;77.9;75.8;84.9;29.1;70.9;77.1;75.7;-13.8;74.6;64.9;53.2;72.0;54.9;82.6
ccc;44.0;66.5;65.5;38.1;53.6;48.9;-4.6;67.0;58.7;100.0;30.9;60.6;66.4;72.5;50.4;67.2;72.0;79.3;34.0;58.1;57.1;59.2;68.2;65.6;19.0;58.4;48.6;39.7;59.7;41.7;61.7
ccg;67.4;51.6;74.3;67.4;39.7;80.1;28.6;69.5;79.8;30.9;100.0;80.0;49.6;57.7;79.3;78.0;59.0;69.1;89.0;84.4;15.2;75.0;63.9;56.9;-15.5;57.8;77.6;54.0;57.7;49.7;77.8
cgc;64.3;64.9;81.1;63.6;51.8;82.0;19.9;79.7;81.5;60.6;80.0;100.0;53.8;72.6;77.5;87.4;69.6;86.6;79.5;95.7;19.4;79.5;75.4;67.2;-6.1;55.4;80.1;52.7;62.8;49.4;84.9
cgg;30.1;44.3;55.5;46.3;29.4;44.9;-1.7;59.9;49.4;66.4;49.6;53.8;100.0;59.4;43.9;59.7;66.0;67.2;52.1;54.5;74.9;65.0;62.2;46.3;8.9;49.9;52.0;44.1;42.1;49.9;52.3
ctc;58.3;74.2;64.0;61.3;39.4;70.6;-10.2;78.6;65.2;72.5;57.7;72.6;59.4;100.0;47.6;79.4;78.3;71.8;63.9;70.3;34.3;78.2;62.3;73.1;9.6;56.1;72.4;58.9;51.9;44.9;79.8
ctg;73.5;49.3;87.7;42.9;56.7;75.0;34.6;75.6;89.6;50.4;79.3;77.5;43.9;47.6;100.0;77.6;59.3;76.0;74.1;83.2;22.4;61.8;74.8;66.4;-18.7;68.5;55.7;45.0;62.4;44.3;73.9
gac;79.9;73.1;87.3;60.8;52.9;79.8;19.2;92.3;83.9;67.2;78.0;87.4;59.7;79.4;77.6;100.0;80.8;87.1;76.2;90.5;24.5;87.1;72.4;84.4;-2.6;71.4;76.6;57.5;62.3;61.4;91.3
gag;60.0;76.3;71.8;48.4;49.6;66.2;-2.6;81.0;70.8;72.0;59.0;69.6;66.0;78.3;59.3;80.8;100.0;78.5;59.3;72.6;45.0;75.9;68.2;75.0;11.1;67.7;62.0;57.9;56.3;57.0;78.3
gcc;63.3;70.4;89.0;49.8;55.8;78.7;16.7;79.0;77.9;79.3;69.1;86.6;67.2;71.8;76.0;87.1;78.5;100.0;60.0;88.2;34.8;84.0;74.4;68.3;-4.2;65.9;74.8;55.6;66.6;52.3;83.4
gcg;63.7;48.8;66.6;73.2;37.1;75.5;21.2;72.7;75.8;34.0;89.0;79.5;52.1;63.9;74.1;76.2;59.3;60.0;100.0;82.1;23.4;70.9;68.7;60.5;-12.9;49.9;73.1;47.3;51.1;47.0;73.3
ggc;72.0;67.8;85.6;61.6;53.8;84.3;26.3;81.4;84.9;58.1;84.4;95.7;54.5;70.3;83.2;90.5;72.6;88.2;82.1;100.0;15.6;83.1;74.8;69.7;-9.9;64.0;79.1;54.0;68.2;50.0;86.7
ggg;0.5;22.0;25.2;24.2;26.1;13.9;1.3;29.5;29.1;57.1;15.2;19.4;74.9;34.3;22.4;24.5;45.0;34.8;23.4;15.6;100.0;26.7;49.5;24.2;20.0;35.9;16.1;15.5;30.1;36.7;20.5
gtc;59.4;63.9;78.4;61.8;33.9;76.7;10.8;78.1;70.9;59.2;75.0;79.5;65.0;78.2;61.8;87.1;75.9;84.0;70.9;83.1;26.7;100.0;52.5;64.0;-1.5;65.1;80.9;59.5;52.6;56.4;81.6
gtg;58.9;61.9;71.1;58.0;59.9;64.9;17.1;74.2;77.1;68.2;63.9;75.4;62.2;62.3;74.8;72.4;68.2;74.4;68.7;74.8;49.5;52.5;100.0;69.5;1.9;59.2;59.3;49.7;64.6;49.6;72.1
tac;82.9;76.7;72.8;51.0;55.2;66.4;8.1;91.6;75.7;65.6;56.9;67.2;46.3;73.1;66.4;84.4;75.0;68.3;60.5;69.7;24.2;64.0;69.5;100.0;2.2;64.9;51.7;50.6;55.9;55.5;81.7
tag;-12.4;10.8;-8.7;0.5;-7.6;-16.2;-10.2;0.4;-13.8;19.0;-15.5;-6.1;8.9;9.6;-18.7;-2.6;11.1;-4.2;-12.9;-9.9;20.0;-1.5;1.9;2.2;100.0;4.7;-5.1;-11.2;2.8;-6.3;-6.0
tcc;63.6;59.3;75.9;39.6;39.1;61.6;26.1;69.5;74.6;58.4;57.8;55.4;49.9;56.1;68.5;71.4;67.7;65.9;49.9;64.0;35.9;65.1;59.2;64.9;4.7;100.0;41.7;44.0;65.3;51.5;69.6
tcg;55.8;61.8;67.0;70.9;30.5;72.9;14.0;65.0;64.9;48.6;77.6;80.1;52.0;72.4;55.7;76.6;62.0;74.8;73.1;79.1;16.1;80.9;59.3;51.7;-5.1;41.7;100.0;60.3;55.8;46.2;76.3
tga;38.8;47.7;48.7;42.5;23.1;44.3;-10.2;54.0;53.2;39.7;54.0;52.7;44.1;58.9;45.0;57.5;57.9;55.6;47.3;54.0;15.5;59.5;49.7;50.6;-11.2;44.0;60.3;100.0;37.1;43.4;54.1
tgc;57.8;68.6;64.9;44.0;61.5;62.5;29.2;58.5;72.0;59.7;57.7;62.8;42.1;51.9;62.4;62.3;56.3;66.6;51.1;68.2;30.1;52.6;64.6;55.9;2.8;65.3;55.8;37.1;100.0;34.1;67.3
tgg;49.7;43.9;54.4;44.4;33.5;43.8;25.7;60.7;54.9;41.7;49.7;49.4;49.9;44.9;44.3;61.4;57.0;52.3;47.0;50.0;36.7;56.4;49.6;55.5;-6.3;51.5;46.2;43.4;34.1;100.0;55.4
ttc;82.0;79.7;81.3;63.8;50.4;88.5;23.4;86.6;82.6;61.7;77.8;84.9;52.3;79.8;73.9;91.3;78.3;83.4;73.3;86.7;20.5;81.6;72.1;81.7;-6.0;69.6;76.3;54.1;67.3;55.4;100.0
Diagramme diagcor-at[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Diagramme diagcor-at
  • Tableau numérique. Voir le diagramme.
aaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag
92;116;70;272;67;223;67;297;0;434;72;239;71;293;83;38;67;229;61;258;59;329;62;250;14;459;-6;358;46;388;35;290
93;96;63;169;66;119;59;204;-6;394;73;149;69;194;85;79;68;119;62;221;53;230;54;249;15;459;-13;323;41;305;19;217
91;45;11;308;69;54;68;188;9;307;73;140;51;226;70;244;73;53;70;112;75;71;77;147;24;368;4;298;67;165;61;177
69;199;9;284;84;223;60;180;-5;318;75;133;41;208;75;195;80;62;69;130;83;123;77;162;20;385;21;305;65;214;43;182
69;148;25;209;91;118;73;251;33;352;66;136;76;56;46;270;48;239;46;269;53;199;60;308;6;393;-45;375;58;261;49;298
64;229;30;215;67;218;69;170;73;203;5;297;43;355;-13;420;-8;318;0;246;-3;272;17;244;3;155;-39;284;20;181;37;205
8;384;3;335;75;200;64;176;69;100;78;225;54;188;72;219;80;189;71;224;68;174;70;269;31;363;-5;377;68;165;40;265
77;180;13;244;61;104;66;166;69;98;79;129;91;129;38;261;30;226;34;321;32;254;43;345;-5;432;-44;365;41;311;28;288
70;217;26;299;-8;435;62;171;79;79;82;115;92;78;49;396;83;196;73;232;67;303;67;222;34;447;15;324;47;371;32;256
87;60;-4;331;78;174;14;288;60;108;77;107;75;220;41;413;62;199;81;121;76;123;71;157;42;383;21;263;65;212;31;136
69;148;25;277;62;95;72;66;4;375;68;110;73;169;43;335;50;194;61;301;62;78;74;70;46;320;24;271;54;174;45;136
68;182;46;189;85;187;65;219;64;87;0;347;64;247;52;356;76;228;50;192;31;265;70;133;21;327;30;278;68;97;46;157
59;259;47;174;81;209;67;235;49;135;75;55;-4;399;18;464;82;233;76;117;20;264;64;202;36;272;17;208;64;195;69;115
67;223;31;189;67;315;62;215;75;174;54;163;81;201;-15;400;57;387;72;124;40;298;56;178;46;208;6;178;26;238;20;269
23;457;49;107;62;245;66;255;70;133;82;200;67;232;37;386;12;301;63;256;56;306;73;99;40;206;55;253;4;304;-1;138
-7;318;46;208;58;338;58;191;74;194;79;166;86;93;15;492;67;341;17;243;12;438;63;111;66;203;44;251;65;234;41;184
52;336;30;106;21;469;69;298;70;132;66;198;78;169;52;394;33;375;70;215;-12;357;83;258;82;208;77;213;61;315;60;235
41;207;26;233;-8;327;29;352;82;220;74;129;78;204;51;334;70;162;52;245;38;406;32;309;39;363;74;220;75;333;43;340
55;314;31;93;54;293;4;428;34;435;67;242;62;280;44;327;71;178;54;269;1;427;66;215;-4;285;52;367;81;345;75;354
68;291;32;230;13;250;60;152;18;351;16;408;68;245;54;333;69;137;65;87;38;228;62;247;63;319;8;304;58;476;70;365
57;216;46;233;51;423;34;322;59;221;-1;377;25;476;45;332;81;213;64;112;50;253;57;170;16;350;65;332;2;419;59;493
50;168;36;71;66;399;50;457;44;243;62;191;0;336;-5;259;81;82;67;95;42;222;56;59;62;174;32;354;80;440;3;407
65;169;52;120;47;330;64;450;62;414;42;269;53;357;42;293;23;326;76;118;67;280;56;141;72;152;60;220;35;468;61;451
27;250;23;133;50;294;59;355;75;397;64;434;33;226;37;332;27;200;17;305;48;166;52;161;66;114;66;163;75;246;31;491
59;221;37;147;59;227;51;341;67;274;75;420;63;330;22;353;64;260;15;196;5;235;73;130;77;188;69;129;83;293;60;272
63;164;29;118;26;350;62;266;71;265;65;306;79;282;58;289;65;118;69;127;70;113;35;334;85;56;82;198;87;249;68;317
44;416;40;146;57;237;36;421;69;184;58;296;60;238;52;286;81;156;49;64;43;326;-26;213;33;310;79;71;77;311;68;269
91;33;18;302;56;300;66;274;42;353;67;212;56;190;44;314;85;155;72;287;25;176;56;237;42;174;25;271;83;227;72;331
79;159;23;296;45;449;60;360;67;190;38;382;65;189;47;345;83;76;75;261;51;96;62;125;64;241;32;150;36;298;73;221
77;129;19;297;90;169;33;392;73;290;58;218;34;283;19;285;84;27;74;135;59;94;66;299;54;92;61;254;25;200;19;282
80;202;33;269;81;154;76;225;42;418;74;320;68;241;53;283;65;151;67;123;67;103;63;274;70;179;63;116;66;345;24;201
85;143;28;354;71;129;62;64;75;150;46;409;66;189;48;336;62;104;66;113;64;116;56;139;81;180;79;164;52;264;55;359
19;276;8;321;71;201;82;89;70;34;81;181;49;441;51;355;67;149;53;226;7;235;54;125;75;49;81;167;79;58;58;264
  • Paramètre diag, voir diag at
  • Coefficients de corrélations at:
cor;aaa;aat;aca;act;aga;agg;agt;ata;att;caa;cat;cca;cct;cga;cgt;cta;ctt;gaa;gat;gca;gct;gga;ggt;gta;gtt;taa;tat;tca;tct;tgt;tta;ttg;ttt
aaa;100.0;91.5;70.3;67.2;67.4;-0.3;72.3;71.2;83.0;66.8;61.2;58.8;62.0;13.9;-5.9;45.7;34.7;60.4;65.0;54.7;45.8;63.6;30.9;61.0;62.2;49.3;91.3;77.6;73.3;72.7;84.4;10.8;92.9
aat;91.5;100.0;62.8;65.9;59.1;-6.4;72.8;69.3;84.9;68.3;62.0;53.1;54.0;14.7;-12.9;41.1;19.3;43.5;61.2;44.1;39.6;56.1;20.2;49.6;49.7;40.8;92.0;78.7;68.6;68.6;91.0;8.9;90.5
aca;70.3;62.8;100.0;69.0;67.8;8.6;72.8;50.7;69.9;73.2;69.7;74.9;77.1;24.2;3.9;67.5;61.4;75.3;75.4;76.6;65.6;73.3;39.7;76.0;76.2;42.8;74.5;82.3;69.2;63.5;66.8;25.1;69.3
act;67.2;65.9;69.0;100.0;60.0;-4.7;75.3;41.0;75.1;80.0;69.1;83.3;77.3;20.3;20.6;64.7;43.3;69.7;81.0;74.1;81.9;63.4;56.1;71.7;82.1;51.8;73.1;77.2;78.8;66.5;74.8;30.4;68.5
aga;67.4;59.1;67.8;60.0;100.0;33.4;66.4;76.0;45.5;47.8;45.8;53.1;59.8;6.4;-44.6;58.1;48.5;58.7;58.2;52.1;38.5;82.9;11.7;63.2;56.8;17.6;64.4;67.8;60.3;61.5;60.6;3.2;63.6
agg;-0.3;-6.4;8.6;-4.7;33.4;100.0;5.0;43.3;-13.4;-8.0;-0.4;-2.9;17.1;3.0;-38.7;19.7;37.1;2.7;2.2;7.6;-3.6;31.9;-12.0;16.8;12.2;-14.5;-3.8;0.2;3.6;13.9;-8.0;12.6;7.9
agt;72.3;72.8;72.8;75.3;66.4;5.0;100.0;54.4;72.2;79.7;70.9;68.0;70.2;30.7;-4.8;68.3;40.5;60.9;80.3;64.9;62.7;65.8;38.0;69.7;66.8;36.8;81.4;74.8;63.9;71.9;77.9;25.7;76.9
ata;71.2;69.3;50.7;41.0;76.0;43.3;54.4;100.0;37.8;30.4;34.1;32.0;42.8;-4.8;-43.8;40.9;27.6;30.5;35.1;32.3;15.7;62.5;1.5;51.5;33.3;14.5;66.9;53.6;49.5;64.8;62.1;-3.8;69.7
att;83.0;84.9;69.9;75.1;45.5;-13.4;72.2;37.8;100.0;82.6;73.0;67.3;66.9;33.8;15.3;47.3;32.4;60.0;74.7;60.1;62.1;56.7;38.4;53.5;69.7;51.6;85.6;81.7;75.3;67.4;85.0;25.1;87.3
caa;66.8;68.3;73.2;80.0;47.8;-8.0;79.7;30.4;82.6;100.0;80.5;76.2;71.5;42.3;21.2;64.9;31.3;67.9;82.6;66.3;72.3;55.8;50.0;65.0;71.3;50.9;77.9;79.5;70.2;61.9;81.3;46.1;69.2
cat;61.2;62.0;69.7;69.1;45.8;-0.4;70.9;34.1;73.0;80.5;100.0;62.4;74.1;45.8;24.0;54.4;45.0;67.5;86.6;68.6;66.5;55.8;41.9;63.8;68.6;44.0;78.3;66.4;73.9;66.5;67.0;46.9;68.2
cca;58.8;53.1;74.9;83.3;53.1;-2.9;68.0;32.0;67.3;76.2;62.4;100.0;69.6;20.5;29.6;67.8;45.9;71.6;76.9;81.7;77.3;52.4;66.6;66.7;81.0;54.4;62.3;74.3;69.5;57.8;62.3;31.2;58.9
cct;62.0;54.0;77.1;77.3;59.8;17.1;70.2;42.8;66.9;71.5;74.1;69.6;100.0;35.5;16.7;64.1;68.7;73.0;82.5;78.7;85.4;73.3;47.8;76.0;81.3;44.6;68.2;66.8;82.3;69.0;57.6;49.3;66.6
cga;13.9;14.7;24.2;20.3;6.4;3.0;30.7;-4.8;33.8;42.3;45.8;20.5;35.5;100.0;6.4;25.8;20.3;18.7;36.0;25.1;32.6;35.3;5.3;17.4;23.4;-5.1;24.6;16.3;33.6;29.4;21.3;46.3;23.1
cgt;-5.9;-12.9;3.9;20.6;-44.6;-38.7;-4.8;-43.8;15.3;21.2;24.0;29.6;16.7;6.4;100.0;4.5;-0.6;23.9;25.3;31.7;41.6;-26.4;69.9;15.2;26.7;41.6;0.1;-1.1;17.7;4.0;-8.0;30.0;-7.5
cta;45.7;41.1;67.5;64.7;58.1;19.7;68.3;40.9;47.3;64.9;54.4;67.8;64.1;25.8;4.5;100.0;41.2;55.5;65.6;61.0;63.5;56.2;43.1;68.5;64.4;36.8;53.5;61.6;59.1;60.1;53.9;26.4;52.1
ctt;34.7;19.3;61.4;43.3;48.5;37.1;40.5;27.6;32.4;31.3;45.0;45.9;68.7;20.3;-0.6;41.2;100.0;57.6;52.4;63.5;54.2;62.0;25.0;49.4;65.2;22.4;33.2;41.6;44.1;33.5;12.7;31.1;40.7
gaa;60.4;43.5;75.3;69.7;58.7;2.7;60.9;30.5;60.0;67.9;67.5;71.6;73.0;18.7;23.9;55.5;57.6;100.0;79.4;79.1;70.1;65.6;51.2;72.4;80.7;58.2;63.1;63.8;61.9;49.7;51.1;31.6;55.4
gat;65.0;61.2;75.4;81.0;58.2;2.2;80.3;35.1;74.7;82.6;86.6;76.9;82.5;36.0;25.3;65.6;52.4;79.4;100.0;81.4;81.4;63.3;58.9;75.0;85.0;52.1;78.8;74.7;74.9;64.4;66.3;45.7;67.8
gca;54.7;44.1;76.6;74.1;52.1;7.6;64.9;32.3;60.1;66.3;68.6;81.7;78.7;25.1;31.7;61.0;63.5;79.1;81.4;100.0;75.5;56.2;67.3;74.0;83.5;44.0;59.6;65.4;67.4;59.3;47.5;36.0;56.8
gct;45.8;39.6;65.6;81.9;38.5;-3.6;62.7;15.7;62.1;72.3;66.5;77.3;85.4;32.6;41.6;63.5;54.2;70.1;81.4;75.5;100.0;53.7;64.5;67.0;84.0;47.3;55.5;57.8;71.2;51.4;49.6;52.1;50.1
gga;63.6;56.1;73.3;63.4;82.9;31.9;65.8;62.5;56.7;55.8;55.8;52.4;73.3;35.3;-26.4;56.2;62.0;65.6;63.3;56.2;53.7;100.0;6.7;65.5;65.3;19.0;65.3;66.9;69.1;61.9;58.8;22.8;64.9
ggt;30.9;20.2;39.7;56.1;11.7;-12.0;38.0;1.5;38.4;50.0;41.9;66.6;47.8;5.3;69.9;43.1;25.0;51.2;58.9;67.3;64.5;6.7;100.0;53.4;61.5;52.9;33.8;37.8;41.6;36.2;25.5;36.9;27.0
gta;61.0;49.6;76.0;71.7;63.2;16.8;69.7;51.5;53.5;65.0;63.8;66.7;76.0;17.4;15.2;68.5;49.4;72.4;75.0;74.0;67.0;65.5;53.4;100.0;66.8;48.3;67.8;58.1;67.4;65.5;57.5;29.4;59.3
gtt;62.2;49.7;76.2;82.1;56.8;12.2;66.8;33.3;69.7;71.3;68.6;81.0;81.3;23.4;26.7;64.4;65.2;80.7;85.0;83.5;84.0;65.3;61.5;66.8;100.0;50.8;65.5;74.4;73.0;59.7;55.8;39.9;63.3
taa;49.3;40.8;42.8;51.8;17.6;-14.5;36.8;14.5;51.6;50.9;44.0;54.4;44.6;-5.1;41.6;36.8;22.4;58.2;52.1;44.0;47.3;19.0;52.9;48.3;50.8;100.0;48.7;46.5;42.5;33.1;45.0;17.7;44.1
tat;91.3;92.0;74.5;73.1;64.4;-3.8;81.4;66.9;85.6;77.9;78.3;62.3;68.2;24.6;0.1;53.5;33.2;63.1;78.8;59.6;55.5;65.3;33.8;67.8;65.5;48.7;100.0;81.4;74.8;75.6;90.1;22.9;91.4
tca;77.6;78.7;82.3;77.2;67.8;0.2;74.8;53.6;81.7;79.5;66.4;74.3;66.8;16.3;-1.1;61.6;41.6;63.8;74.7;65.4;57.8;66.9;37.8;58.1;74.4;46.5;81.4;100.0;69.5;62.4;81.5;18.6;78.9
tct;73.3;68.6;69.2;78.8;60.3;3.6;63.9;49.5;75.3;70.2;73.9;69.5;82.3;33.6;17.7;59.1;44.1;61.9;74.9;67.4;71.2;69.1;41.6;67.4;73.0;42.5;74.8;69.5;100.0;82.1;70.9;33.5;76.8
tgt;72.7;68.6;63.5;66.5;61.5;13.9;71.9;64.8;67.4;61.9;66.5;57.8;69.0;29.4;4.0;60.1;33.5;49.7;64.4;59.3;51.4;61.9;36.2;65.5;59.7;33.1;75.6;62.4;82.1;100.0;71.2;27.7;80.2
tta;84.4;91.0;66.8;74.8;60.6;-8.0;77.9;62.1;85.0;81.3;67.0;62.3;57.6;21.3;-8.0;53.9;12.7;51.1;66.3;47.5;49.6;58.8;25.5;57.5;55.8;45.0;90.1;81.5;70.9;71.2;100.0;8.5;84.8
ttg;10.8;8.9;25.1;30.4;3.2;12.6;25.7;-3.8;25.1;46.1;46.9;31.2;49.3;46.3;30.0;26.4;31.1;31.6;45.7;36.0;52.1;22.8;36.9;29.4;39.9;17.7;22.9;18.6;33.5;27.7;8.5;100.0;18.8
ttt;92.9;90.5;69.3;68.5;63.6;7.9;76.9;69.7;87.3;69.2;68.2;58.9;66.6;23.1;-7.5;52.1;40.7;55.4;67.8;56.8;50.1;64.9;27.0;59.3;63.3;44.1;91.4;78.9;76.8;80.2;84.8;18.8;100.0

Caractérisation des aas par les courbes et les coefficients de corrélation[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des diagrammes aas DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Tableau des diagrammes aas DRNA
  • Chaque acide aminé est la somme de ses codons du tableau des diagrammes des codons.
  • Les diagrammes issus de ce tableau.
6550;304;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
aas;KEGG;%AT;%GC;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
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6,672;saci;37.7;62.3;555.621;59.881;408.371;510.464;211.057;502.611;141.359;360.270;357.325;655.750;145.286;182.589;349.472;225.782;470.216;315.113;339.655;484.941;79.515;188.479
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6,720;dvl;37.0;63.0;546.779;89.668;447.364;486.350;229.043;483.426;139.375;341.128;349.899;632.548;179.336;182.260;330.406;200.778;463.933;310.913;388.885;478.553;76.023;187.133
6,859;ddr;36.6;63.4;592.992;41.061;432.569;522.329;221.536;521.375;129.866;296.973;296.019;601.586;160.423;192.889;330.395;241.589;472.675;324.665;381.004;488.908;78.302;216.762
6,582;tai;36.2;63.8;457.739;92.543;445.798;537.346;224.889;538.341;113.440;334.349;308.476;663.722;159.214;151.253;321.412;206.978;527.395;382.113;230.860;588.095;89.558;170.160
7,021;gau;35.7;64.3;652.073;46.643;443.111;500.016;236.015;500.016;123.138;333.966;302.248;629.684;118.474;185.640;319.040;204.298;504.680;298.517;363.818;540.129;81.159;161.386
6,764;xcb;35.0;65.0;676.849;49.384;457.042;448.328;210.123;510.299;136.532;330.194;301.144;642.958;156.866;204.313;309.859;250.792;477.377;305.018;325.352;490.933;75.528;184.947
6,688;rru;34.6;65.4;691.395;65.614;450.484;490.636;229.159;523.933;133.187;365.284;321.215;600.319;181.173;151.794;320.236;191.945;481.822;279.104;327.091;505.326;71.490;162.566
6,845;dpt;33.8;66.2;641.091;39.231;436.324;548.276;210.507;531.053;122.477;280.357;286.099;622.910;158.837;170.320;334.898;256.436;473.642;331.071;329.157;475.555;87.073;208.594
6,664;pae;33.4;66.6;626.069;62.902;428.518;495.352;223.105;510.094;136.615;345.960;358.737;651.623;162.169;223.105;289.938;244.727;418.690;291.904;304.681;510.094;71.747;187.723
6,576;roa;32.6;67.4;612.536;37.848;495.008;497.000;204.179;533.852;136.451;314.734;293.818;602.576;141.431;194.219;317.722;214.138;440.229;327.682;349.593;545.804;92.627;192.227
7,207;bmv;31.9;68.1;693.407;50.892;432.584;485.294;219.927;525.281;129.957;320.803;335.343;607.072;160.856;187.211;308.080;228.106;517.101;268.093;309.897;502.561;69.977;191.755
6,617;tos;31.4;68.6;590.923;34.644;323.672;682.977;237.557;497.880;125.707;261.313;340.499;753.254;129.667;122.738;400.878;186.086;546.381;219.740;257.354;525.595;86.114;220.730
7,209;vin;31.1;68.9;620.531;52.695;408.842;542.397;235.311;511.507;129.921;337.068;347.970;612.354;130.829;172.622;339.793;201.695;501.513;312.537;330.708;528.769;74.500;152.634
6,713;age;30.6;69.4;568.814;54.637;389.291;561.984;226.355;487.833;127.812;339.532;450.758;646.867;130.739;183.425;320.019;216.598;443.928;305.384;318.067;518.079;67.321;186.352
6,646;opr;30.0;70.0;614.953;35.478;406.027;622.837;232.579;498.664;131.072;284.810;319.303;678.026;132.057;148.811;349.853;194.144;541.041;226.666;281.854;532.171;94.608;218.782
6,487;mts;29.7;70.3;668.393;27.261;494.732;475.549;232.221;524.012;112.072;310.975;299.868;619.930;127.217;176.690;314.004;235.250;440.211;322.081;379.631;515.935;87.840;179.719
6,581;sma;29.3;70.7;644.913;39.809;436.909;529.466;230.895;516.528;131.371;284.638;310.514;598.137;149.285;186.109;326.437;221.938;440.890;312.504;383.166;523.494;97.533;179.142
6,465;amd;28.7;71.3;676.746;36.471;463.997;481.219;215.789;534.913;147.912;275.561;255.300;608.869;128.663;184.383;336.347;214.776;492.363;292.784;369.779;543.018;92.191;192.488
6,559;sho;28.0;72.0;661.056;41.940;438.374;528.246;226.676;517.261;136.805;301.569;294.579;588.160;151.783;183.738;328.531;214.693;456.348;295.578;387.447;509.273;96.862;184.736
6,561;sgr;27.8;72.2;646.879;41.927;447.225;511.114;228.604;513.111;135.765;285.505;302.476;586.983;156.728;195.661;329.429;213.630;451.218;298.483;391.322;535.073;95.834;176.694
6,452;cmi;27.3;72.7;643.595;25.378;483.204;494.371;215.209;522.794;124.862;310.631;247.693;633.444;131.968;156.331;326.873;229.420;527.870;337.025;375.600;514.673;93.392;149.225
6,571;salb;26.7;73.3;641.907;41.864;453.522;524.291;228.256;518.310;134.561;289.058;287.064;600.044;149.513;187.389;321.950;217.292;464.486;300.022;389.730;518.310;96.685;179.415
6,532;ksk;25.8;74.2;674.818;44.119;438.181;511.378;217.586;506.364;136.367;282.762;259.700;610.645;147.397;181.489;345.932;207.559;473.275;316.854;371.000;529.427;100.270;188.508
6,733;ade;25.1;74.9;690.665;50.584;397.862;539.886;219.846;517.513;135.215;326.850;365.761;606.035;131.324;170.234;352.142;192.608;509.731;268.484;282.103;543.777;75.876;167.316
;;Moyenne;;489.562;57.628;418.549;521.403;247.595;453.108;128.477;433.359;449.512;611.379;154.256;261.483;285.912;220.434;383.199;335.807;325.198;470.634;73.624;222.499
;;Max;;693.41;121.45;525.52;693.99;599.25;538.34;162.29;1073.64;1262.90;753.25;206.81;863.73;400.88;302.06;546.38;496.36;391.32;588.10;116.56;399.12
;;min;;90.97;21.48;147.97;196.15;171.03;216.79;60.79;261.31;228.63;543.31;70.50;122.74;112.57;97.50;128.47;219.74;174.35;134.20;50.03;149.22
;;sans zin ni crp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;Max;;693.41;121.45;525.52;693.99;326.42;538.34;162.29;767.33;782.96;753.25;206.81;543.94;400.88;302.06;546.38;496.36;391.32;588.10;116.56;306.04
;;min;;220.84;21.48;292.42;340.34;171.03;309.39;91.59;261.31;228.63;543.31;97.17;122.74;190.42;148.45;221.15;219.74;230.86;254.66;53.59;149.22

Courbes à partir des équations de tendance[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Courbes à partir des équations de tendance
  • Calculs: (x3/100000)*GC^3+x2*GC^2+x*GC+cte.
  • Ces constantes sont relevées à partir des diagrammes des aas.
x3;358;-129;400;931;-394;185;96;-892;-781;-100;-10;-816;109;83;157;127;303;553;26;-206
x2;-0.57849;0.16783;-0.63756;-1.4373;0.64072;-0.32993;-0.16141;1.4541;1.2957;0.14754;-0.04329;1.3475;-0.20295;-0.174;-0.26066;-0.17896;-0.46813;-0.88415;-0.02951;0.33194
x;36.621;-6.8189;33.275;70.122;-34.309;21.534;8.8177;-81.101;-74.904;-6.4651;5.2984;-74.738;14.038;11.001;18.23;6.082;23.712;47.17;1.4131;-18.906
cte;-315.43;145.47;-138.18;-539.3;836.99;-10.255;-23.863;1922.6;1883.1;691.18;24.346;1605.9;-30.062;13.33;-56.1;314.31;-62.377;-347.39;43.687;584.11
%GC;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
13.54;83.22;80.71;205.39;169.71;480.15;225.40;68.31;1068.99;1087.11;628.21;87.90;820.78;125.50;132.44;146.83;367.00;180.37;142.89;58.05;383.88
16.56;148.72;72.71;256.25;270.18;426.58;264.32;82.27;937.65;962.38;620.03;99.78;700.55;151.74;151.59;181.48;371.72;215.72;216.49;60.18;352.66
22.53;256.95;62.28;333.63;417.45;344.18;328.59;103.85;731.48;763.88;608.98;120.60;512.72;195.66;182.35;240.27;375.02;268.89;329.80;63.52;303.09
23.66;274.65;61.00;345.21;438.56;331.69;339.08;107.13;699.52;732.67;607.56;124.16;483.77;202.92;187.22;250.13;374.85;276.74;347.00;64.05;295.31
24.24;283.35;60.42;350.77;448.54;325.69;344.22;108.71;684.05;717.50;606.91;125.92;469.78;206.50;189.58;255.00;374.67;280.50;355.28;64.30;291.52
25.07;295.48;59.68;358.34;462.00;317.48;351.39;110.88;662.77;696.56;606.07;128.39;450.56;211.49;192.84;261.83;374.32;285.60;366.60;64.66;286.31
25.50;301.60;59.33;362.08;468.57;313.41;355.00;111.95;652.15;686.08;605.68;129.65;441.00;214.01;194.47;265.30;374.09;288.12;372.22;64.84;283.70
26.17;310.97;58.84;367.70;478.35;307.28;360.52;113.57;636.10;670.18;605.11;131.58;426.54;217.88;196.95;270.63;373.67;291.88;380.68;65.12;279.73
26.31;312.89;58.74;368.84;480.31;306.04;361.65;113.89;632.83;666.94;605.00;131.97;423.60;218.67;197.45;271.73;373.57;292.65;382.40;65.18;278.92
27.12;323.72;58.25;375.13;491.04;299.15;368.02;115.71;614.61;648.82;604.41;134.22;407.24;223.14;200.27;277.93;372.96;296.84;391.92;65.49;274.41
27.38;327.10;58.10;377.06;494.28;297.04;370.01;116.27;608.98;643.19;604.24;134.92;402.19;224.54;201.14;279.88;372.74;298.13;394.85;65.59;273.01
28.31;338.91;57.67;383.62;505.17;289.81;376.93;118.19;589.62;623.79;603.71;137.38;384.87;229.43;204.15;286.71;371.88;302.48;404.87;65.94;268.17
28.48;341.05;57.60;384.78;507.06;288.53;378.18;118.53;586.17;620.32;603.62;137.83;381.79;230.32;204.69;287.95;371.70;303.24;406.64;66.00;267.31
29.00;347.39;57.41;388.16;512.53;284.78;381.88;119.52;576.01;610.08;603.38;139.15;372.73;232.94;206.27;291.65;371.16;305.47;411.84;66.19;264.75
29.68;355.52;57.20;392.39;519.24;280.08;386.63;120.76;563.17;597.08;603.12;140.86;361.30;236.32;208.27;296.42;370.38;308.25;418.38;66.43;261.51
29.93;358.46;57.14;393.88;521.57;278.41;388.34;121.21;558.60;592.44;603.03;141.48;357.23;237.54;208.99;298.15;370.08;309.23;420.69;66.52;260.35
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54.15;539.75;63.52;429.31;521.57;232.30;482.12;132.75;378.42;386.27;614.93;168.44;214.37;308.07;230.62;416.01;320.56;330.07;492.39;74.96;206.59
54.48;541.60;63.51;429.12;520.35;232.44;482.82;132.68;377.71;385.16;615.17;168.34;214.17;308.62;230.43;417.30;319.84;329.96;492.42;75.13;206.22
55.07;544.78;63.49;428.79;518.30;232.68;484.00;132.55;376.49;383.27;615.58;168.14;213.84;309.56;230.09;419.51;318.63;329.79;492.47;75.43;205.59
55.41;546.68;63.46;428.60;517.10;232.83;484.71;132.47;375.76;382.14;615.81;168.00;213.64;310.11;229.87;420.83;317.91;329.69;492.51;75.62;205.22
56.11;550.51;63.36;428.24;514.79;233.10;486.09;132.31;374.27;379.88;616.27;167.68;213.24;311.21;229.41;423.48;316.50;329.53;492.61;76.00;204.45
56.76;554.12;63.23;427.94;512.73;233.34;487.38;132.16;372.83;377.73;616.69;167.33;212.84;312.22;228.95;425.97;315.20;329.42;492.75;76.37;203.71
57.16;556.32;63.13;427.77;511.55;233.47;488.15;132.07;371.93;376.42;616.93;167.09;212.58;312.82;228.65;427.48;314.43;329.37;492.86;76.60;203.26
57.48;558.12;63.04;427.65;510.62;233.57;488.78;132.00;371.19;375.35;617.12;166.88;212.36;313.31;228.41;428.71;313.82;329.34;492.96;76.79;202.89
58.38;563.22;62.71;427.35;508.20;233.80;490.53;131.81;368.98;372.26;617.63;166.22;211.66;314.66;227.68;432.18;312.13;329.32;493.33;77.34;201.82
58.65;564.72;62.60;427.29;507.56;233.85;491.04;131.75;368.31;371.34;617.77;166.02;211.44;315.05;227.46;433.19;311.65;329.34;493.46;77.51;201.50
59.09;567.23;62.39;427.20;506.54;233.92;491.88;131.66;367.15;369.78;617.99;165.65;211.03;315.70;227.09;434.89;310.87;329.38;493.71;77.79;200.95
59.62;570.35;62.10;427.13;505.41;233.98;492.92;131.55;365.66;367.82;618.25;165.16;210.48;316.49;226.61;436.98;309.93;329.47;494.07;78.14;200.26
60.01;572.61;61.88;427.10;504.68;234.00;493.66;131.48;364.55;366.38;618.42;164.80;210.05;317.05;226.26;438.49;309.28;329.56;494.36;78.40;199.76
60.49;575.44;61.57;427.11;503.87;234.00;494.58;131.40;363.10;364.54;618.63;164.31;209.46;317.75;225.82;440.37;308.48;329.70;494.77;78.73;199.12
61.27;580.12;61.00;427.20;502.81;233.92;496.09;131.27;360.57;361.43;618.92;163.46;208.36;318.88;225.07;443.45;307.24;330.02;495.55;79.29;198.03
61.90;583.97;60.48;427.37;502.19;233.78;497.32;131.18;358.37;358.80;619.13;162.73;207.35;319.79;224.45;445.97;306.29;330.35;496.31;79.75;197.11
62.27;586.22;60.15;427.50;501.94;233.66;498.03;131.14;357.02;357.23;619.24;162.28;206.70;320.32;224.08;447.43;305.76;330.58;496.79;80.03;196.56
62.67;588.73;59.77;427.68;501.76;233.51;498.82;131.09;355.48;355.44;619.34;161.76;205.93;320.89;223.67;449.05;305.20;330.86;497.37;80.34;195.94
63.01;590.91;59.42;427.86;501.68;233.35;499.51;131.06;354.09;353.86;619.42;161.31;205.22;321.39;223.31;450.45;304.73;331.12;497.91;80.61;195.39
63.39;593.32;59.02;428.10;501.68;233.15;500.26;131.03;352.52;352.09;619.50;160.79;204.40;321.94;222.92;451.99;304.23;331.44;498.54;80.91;194.77
63.79;595.94;58.57;428.39;501.79;232.90;501.07;131.00;350.75;350.12;619.56;160.22;203.45;322.52;222.49;453.66;303.72;331.82;499.27;81.24;194.09
64.27;599.10;57.99;428.78;502.06;232.55;502.05;130.98;348.53;347.69;619.63;159.50;202.22;323.22;221.97;455.67;303.13;332.32;500.22;81.64;193.26
64.96;603.68;57.11;429.46;502.74;231.97;503.47;130.97;345.17;344.09;619.68;158.45;200.31;324.22;221.23;458.54;302.35;333.11;501.70;82.22;192.02
65.45;607.04;56.43;430.02;503.45;231.47;504.50;130.98;342.60;341.36;619.69;157.65;198.79;324.95;220.69;460.63;301.84;333.76;502.88;82.66;191.09
66.16;612.04;55.37;430.97;504.81;230.64;506.03;131.01;338.59;337.19;619.66;156.44;196.36;326.01;219.89;463.72;301.14;334.80;504.77;83.30;189.67
66.56;614.84;54.75;431.56;505.73;230.12;506.89;131.04;336.25;334.79;619.62;155.74;194.90;326.60;219.45;465.44;300.79;335.44;505.91;83.67;188.86
67.37;620.82;53.36;432.95;508.08;228.89;508.72;131.13;331.05;329.52;619.49;154.23;191.60;327.84;218.52;469.07;300.14;336.89;508.48;84.45;187.09
68.15;626.67;51.93;434.48;510.86;227.53;510.51;131.26;325.69;324.17;619.30;152.72;188.08;329.05;217.63;472.59;299.61;338.45;511.22;85.23;185.31
68.55;629.78;51.14;435.36;512.53;226.74;511.46;131.35;322.72;321.25;619.18;151.91;186.11;329.68;217.16;474.45;299.37;339.33;512.76;85.64;184.34
68.94;632.81;50.35;436.26;514.26;225.94;512.39;131.44;319.78;318.36;619.04;151.11;184.11;330.29;216.72;476.24;299.18;340.22;514.31;86.04;183.39
69.45;636.88;49.27;437.53;516.78;224.80;513.64;131.58;315.70;314.40;618.83;150.02;181.33;331.11;216.13;478.64;298.95;341.47;516.47;86.58;182.08
70.02;641.58;47.99;439.10;519.94;223.41;515.08;131.76;310.84;309.71;618.56;148.76;177.96;332.05;215.46;481.40;298.75;342.98;519.08;87.21;180.55
70.28;643.69;47.40;439.83;521.44;222.75;515.73;131.84;308.62;307.58;618.42;148.19;176.40;332.47;215.17;482.62;298.68;343.68;520.29;87.49;179.85
70.72;647.39;46.35;441.15;524.19;221.56;516.87;132.01;304.64;303.78;618.17;147.18;173.59;333.21;214.66;484.76;298.58;344.95;522.46;87.99;178.62
71.29;652.35;44.91;443.01;528.13;219.88;518.40;132.25;299.16;298.58;617.80;145.82;169.67;334.19;214.00;487.62;298.51;346.71;525.49;88.65;176.93
72.04;658.98;42.94;445.65;533.78;217.51;520.46;132.60;291.59;291.46;617.26;143.99;164.20;335.49;213.14;491.40;298.51;349.18;529.71;89.54;174.64
72.23;660.67;42.43;446.35;535.30;216.87;520.98;132.70;289.61;289.61;617.11;143.52;162.75;335.82;212.92;492.36;298.53;349.83;530.83;89.77;174.04
72.66;664.68;41.20;448.04;538.99;215.34;522.23;132.94;284.87;285.18;616.75;142.41;159.27;336.61;212.42;494.63;298.59;351.40;533.51;90.31;172.63
73.32;670.85;39.27;450.76;544.97;212.87;524.16;133.33;277.38;278.23;616.15;140.69;153.71;337.81;211.68;498.09;298.76;353.90;537.77;91.14;170.41
74.20;679.36;36.54;454.71;553.78;209.28;526.84;133.92;266.70;268.38;615.26;138.30;145.70;339.47;210.70;502.83;299.12;357.50;543.90;92.28;167.29
74.91;686.48;34.20;458.19;561.60;206.12;529.10;134.46;257.49;259.93;614.45;136.30;138.71;340.85;209.91;506.75;299.53;360.64;549.24;93.23;164.63

Moyenne des écarts par rapport à la courbe théorique[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Moyenne des écarts par rapport à la courbe théorique
  • calculs: ABS(100*(effectif-théorique)/théorique). effectif, théorique
  • Légende: Moy, moyenne des écarts en %; 20, nombre des écarts supérieurs à 20%; ecartt, écart-type.
;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
;11.64;27.52;27.96;15.57;3.97;3.82;11.01;0.43;16.17;5.78;13.87;5.23;13.33;26.38;12.50;15.93;3.33;6.08;8.67;2.19
;38.83;42.32;25.45;19.19;40.48;17.40;0.49;5.14;1.73;7.65;29.34;4.53;25.81;31.74;29.20;9.82;10.92;2.83;16.86;13.17
;0.46;58.75;13.16;5.95;6.54;5.84;11.81;4.90;2.50;3.81;19.43;6.09;0.10;28.63;7.96;0.82;12.35;22.78;19.57;0.97
;10.39;42.45;28.81;0.91;16.62;5.25;13.61;11.65;15.21;4.00;1.10;2.25;6.16;45.46;10.69;1.03;17.62;14.35;1.32;3.82
;12.11;29.20;2.94;13.71;10.45;10.55;13.69;3.82;15.68;3.61;17.10;10.68;18.13;6.94;28.83;3.02;3.98;6.01;1.16;10.37
;7.00;14.55;7.60;8.22;0.26;6.39;21.38;1.37;5.08;5.01;12.31;8.97;8.08;12.44;19.12;1.30;5.01;1.10;10.67;7.85
;10.31;24.59;17.23;6.47;11.42;7.25;16.83;0.08;12.55;1.69;4.42;9.52;0.25;33.91;14.81;1.56;4.33;0.48;8.00;4.33
;8.61;82.00;20.47;24.88;9.86;7.67;1.17;14.77;1.83;4.65;2.52;4.65;4.06;6.42;18.33;0.58;9.71;0.35;24.91;2.70
;0.22;20.60;13.54;26.24;17.31;14.15;9.38;9.99;3.43;4.86;19.56;14.02;5.60;20.09;0.43;3.84;7.50;14.19;17.78;0.74
;8.42;16.71;5.12;25.08;22.36;12.48;9.01;13.50;2.47;1.96;17.67;16.61;1.00;19.08;3.25;6.45;4.67;11.67;10.16;1.94
;1.33;29.60;1.18;31.14;13.74;0.18;28.69;7.76;24.13;6.18;18.15;7.48;0.61;40.52;12.52;7.31;0.60;1.55;7.35;5.32
;1.60;16.56;11.32;23.23;13.30;7.54;11.63;10.91;7.00;7.34;24.19;12.14;6.81;17.94;2.07;4.90;1.89;13.66;9.05;1.41
;35.25;42.95;5.85;7.74;13.13;6.77;15.23;10.71;1.65;5.49;23.69;7.91;12.11;7.42;41.61;29.51;16.31;15.44;18.87;11.95
;9.78;29.13;3.76;8.27;3.78;1.16;10.17;2.28;12.55;1.52;1.17;1.34;1.60;12.54;0.34;9.32;4.73;1.84;7.16;9.00
;2.40;23.76;10.79;1.11;10.36;3.29;7.53;1.56;12.88;1.47;12.94;6.80;0.41;7.13;13.22;11.45;3.18;10.63;11.45;23.37
;13.38;10.34;11.74;22.87;12.13;11.18;17.20;4.55;5.06;9.85;10.10;10.74;2.11;28.97;7.30;0.28;10.55;8.35;2.56;2.80
;22.39;28.49;1.44;11.40;6.03;0.45;1.73;6.21;12.55;4.98;1.80;3.35;12.67;6.35;13.09;2.41;16.91;11.53;16.57;7.49
;9.14;12.72;8.56;9.40;12.78;3.32;10.72;10.22;7.80;8.14;23.10;17.25;8.03;12.76;0.24;26.02;1.59;2.75;14.13;21.73
;15.87;4.54;9.30;12.15;5.03;1.04;7.04;7.66;14.98;3.30;12.81;8.67;12.40;28.87;7.06;9.79;1.64;13.07;3.37;12.68
;1.91;45.17;8.73;2.38;6.92;2.35;30.24;8.48;16.42;1.90;5.64;1.92;6.41;12.18;4.93;4.28;14.40;1.69;2.49;3.14
;5.90;4.15;16.65;17.78;21.00;4.12;0.98;11.39;11.87;5.35;11.42;12.13;0.82;32.30;2.79;19.85;0.08;4.10;10.47;1.22
;8.87;13.04;10.29;6.65;3.55;3.19;11.07;6.81;9.87;0.32;5.54;8.35;12.27;21.87;9.43;12.43;10.65;10.74;12.03;1.58
;6.22;20.03;4.69;0.30;15.71;6.27;11.16;2.88;13.18;8.52;7.87;5.98;3.93;1.36;3.69;11.15;4.94;5.05;16.82;3.18
;13.22;49.21;17.52;12.10;6.78;2.11;11.74;16.28;0.72;3.03;11.14;1.31;13.73;3.42;1.01;11.16;5.61;1.90;4.10;3.07
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;5.22;0.45;4.47;1.70;9.67;0.92;7.80;0.91;0.03;5.90;10.47;11.66;9.10;0.76;5.09;3.06;2.75;2.38;0.64;4.11
;8.55;17.88;9.60;4.66;3.46;0.72;3.82;8.84;2.79;11.11;19.59;0.92;2.88;3.18;1.38;5.02;4.00;5.18;8.95;11.58
;7.47;50.90;4.56;3.06;1.85;3.22;6.34;3.66;1.12;2.12;11.18;11.19;2.80;10.09;2.99;2.03;17.44;3.89;5.69;4.22
;0.05;30.43;1.04;4.12;4.98;4.22;0.89;15.76;15.92;2.89;0.23;5.63;2.63;8.38;4.58;6.72;14.95;1.93;3.22;11.29
;23.19;58.01;4.06;7.09;3.44;7.44;13.41;4.67;11.89;7.13;0.63;25.66;0.34;6.97;16.25;25.81;30.43;17.79;10.24;12.33
;8.84;19.57;3.34;0.41;1.49;0.41;5.99;4.18;13.07;1.62;25.72;8.20;1.29;7.96;10.76;1.52;9.48;7.98;0.59;16.49
;12.12;13.54;6.42;10.82;9.42;1.36;4.25;4.34;12.48;3.76;1.00;2.00;4.43;13.36;4.11;0.88;2.33;2.15;8.14;3.68
;13.90;16.27;4.76;2.54;1.00;3.85;1.69;6.62;5.90;3.13;14.92;23.64;1.45;13.02;4.60;7.53;2.00;0.49;13.51;14.93
;4.75;29.15;1.24;8.61;8.73;4.94;6.51;17.20;15.15;0.52;1.53;13.26;2.73;16.62;2.14;9.94;1.69;5.79;4.52;9.97
;1.83;14.90;0.71;2.05;3.05;0.63;4.25;2.89;7.15;5.16;4.13;14.47;11.23;11.52;10.04;2.95;9.17;0.83;14.25;0.60
;1.33;29.07;14.33;2.18;10.80;4.94;4.05;4.93;10.83;2.73;8.30;1.37;3.09;2.00;6.15;9.18;3.77;7.34;9.68;2.74
;10.65;2.00;0.44;5.00;3.34;2.89;1.00;1.50;3.45;1.98;5.32;0.46;6.37;4.81;9.42;10.52;8.44;1.69;17.89;3.48
;6.17;32.26;25.65;33.26;4.77;2.66;4.29;19.03;5.99;21.65;14.64;34.05;21.60;14.31;15.16;26.60;24.16;2.50;0.55;19.74
;1.94;4.65;6.29;5.47;4.15;0.17;1.15;5.41;9.30;1.08;13.42;6.24;2.88;6.93;5.31;4.47;2.80;2.81;13.41;16.77
;10.69;10.89;11.03;8.75;0.69;5.02;2.86;7.55;43.37;4.53;12.85;1.16;3.35;0.22;7.25;2.15;6.85;0.31;22.25;2.34
;4.15;26.07;7.53;19.79;4.11;3.19;0.52;8.38;3.10;9.61;11.23;16.38;5.36;9.89;12.39;24.13;17.82;2.52;8.48;21.18
;3.84;42.49;12.48;8.80;4.25;1.61;15.00;0.76;2.51;0.24;14.15;0.16;5.56;9.33;8.79;7.84;10.46;0.84;0.40;0.07
;0.38;14.12;0.96;1.01;4.21;0.07;0.48;6.57;2.22;3.24;1.43;7.21;2.03;3.39;9.05;4.66;11.08;0.20;10.85;0.29
;3.74;18.80;4.74;8.88;1.86;3.19;11.85;7.89;14.50;1.45;11.77;8.67;0.65;0.36;0.97;1.92;6.65;3.34;3.99;8.79
;0.32;2.33;1.63;1.04;4.22;0.61;3.17;3.42;1.07;4.71;5.41;11.90;2.07;0.73;7.13;0.98;10.96;3.86;8.17;5.78
;2.09;1.18;0.20;4.52;5.41;1.51;2.31;1.42;4.44;4.88;9.20;20.22;1.90;0.33;8.36;0.02;11.86;0.80;6.75;1.52
;3.17;38.40;7.85;8.28;0.06;0.11;6.07;9.04;13.15;2.71;7.33;1.84;2.89;8.00;6.72;12.87;6.89;3.53;3.41;13.56
;4.31;6.61;0.61;3.80;7.23;1.12;0.92;4.21;3.18;2.61;6.27;21.91;4.70;2.65;6.75;0.42;10.12;3.62;6.09;5.29
;0.67;20.75;3.64;7.66;3.97;3.89;1.83;6.02;3.23;0.75;6.58;24.56;1.90;1.49;5.88;5.93;3.78;2.66;8.66;12.68
;0.61;47.91;13.17;3.87;6.66;2.19;0.56;26.94;40.71;1.37;3.65;22.73;3.31;8.24;0.59;10.36;21.78;1.00;18.62;1.63
;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
Moy;8.4;25.3;7.5;7.6;7.8;4.0;8.0;7.6;11.0;4.4;10.2;9.0;4.8;12.0;7.3;8.5;7.5;4.8;8.6;7.8
 20;12;62;6;12;5;0;4;4;18;1;15;14;2;20;4;10;4;1;8;10
ecartt;7.6;19.4;6.5;7.4;6.4;3.4;6.0;5.8;10.1;3.4;7.4;8.2;4.7;9.8;6.8;7.9;6.1;4.5;7.8;7.0

Taux de variation des acides aminés[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Taux de variation des acides aminés
  • Légende:
  1. écart*: moyenne des écarts de l'aa calculée ci-dessus
  2. ax et cte: de l'équation de la courbe de tendance linéaire, "effectif de l'aa" = ax+cte. A calculer à partir du tableau des diagrammes des aas. Le signe de ax indique le sens de la variation de l'aa.
  3. Max et Min (avec ou sans zin et crp) sont en fin du tableau des diagrammes des aas.
  4. Les bactéries zin et crp sont extrêmes, ce qui fait que le Maximum et le minimum sans eux ne concernent que 109 bactéries et avec les écart* faibles, le rapport M/m (Maximum sur minimum) reflète mieux la courbe de tendance linéaire.
  • Tableau non formaté
;;;;Sans zin ni crp;;;Avec zin et crp;;
;ax;cte;écart*;Max;min;M/m;Max;min;M/m
A;7.49;131;8.4;693;221;3.1;693;91;7.6
C;-0.24;69;25.3;121;21;5.7;121;21;5.7
D;1.61;342;7.5;526;292;1.8;526;148;3.6
E;0.77;485;7.6;694;340;2.0;694;196;3.5
F;-1.88;338;7.8;326;171;1.9;599;171;3.5
G;3.54;284;4.0;538;309;1.7;538;217;2.5
H;0.42;109;8.0;162;92;1.8;162;61;2.7
I;-7.34;785;7.6;767;261;2.9;1074;261;4.1
K;-8.17;840;11.0;783;229;3.4;1263;229;5.5
L;0.35;595;4.4;753;543;1.4;753;543;1.4
M;0.40;135;10.2;207;97;2.1;207;70;2.9
N;-5.58;528;9.0;544;123;4.4;864;123;7.0
P;2.61;161;4.8;401;190;2.1;401;113;3.6
Q;0.47;198;12.0;302;148;2.0;302;97;3.1
R;4.79;154;7.3;546;221;2.5;546;128;4.3
S;-1.72;418;8.5;496;220;2.3;496;220;2.3
T;1.14;271;7.5;391;231;1.7;391;174;2.2
V;3.09;323;4.8;588;255;2.3;588;134;4.4
W;0.48;51;8.6;117;54;2.2;117;50;2.3
Y;-2.22;329;7.8;306;149;2.1;399;149;2.7

Les coefficients de corrélation entre aas[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Les coefficients de corrélation entre aas
  • Les valeurs présentées ici sont les coefficients de corrélation X 100. La corrélation entre 2 aas est celle de 2 colonnes du tableau des diagrammes des aas. Pour obtenir les valeurs absolues il suffit de copier ce tableau (largeur de colonne 1.3 cm) et de remplacer le moins (-) par rien. Pour extraire le maximum d'une colonne il suffit de remplacer 100 par rien (format sans décimales et option de recherche 'cellule entière').
  • Légende:
  1. moyenne : moyenne des corrélations en valeurs absolues d'un aa.
  2. 74 : nombre de corrélations en valeurs absolues d'un aa supérieures à 0.74.
  3. 79 : nombre de corrélations en valeurs absolues d'un aa supérieures à 0.79.
  4. max : corrélation maximum parmi les valeurs absolues des corrélations d'un aa.
;;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
;A;100.00;-27.32;62.75;17.01;-69.96;90.26;47.12;-88.74;-88.06;4.46;42.60;-81.23;83.57;36.83;82.79;-57.39;59.03;73.06;55.02;-83.70
;C;-27.32;100.00;-38.43;-20.73;28.85;-21.37;-0.13;27.97;21.91;5.19;1.87;11.97;-25.13;-23.24;-13.34;36.44;-36.93;-16.13;-24.81;10.86
;D;62.75;-38.43;100.00;28.10;-73.58;64.51;41.57;-71.57;-71.89;-27.74;53.56;-59.94;51.25;51.67;43.13;-19.40;66.58;60.69;32.02;-62.27
;E;17.01;-20.73;28.10;100.00;-49.50;35.11;10.16;-47.24;-23.92;0.33;14.55;-56.38;36.45;-6.71;22.32;-29.80;16.85;54.67;1.49;-22.53
;F;-69.96;28.85;-73.58;-49.50;100.00;-79.62;-50.10;82.55;79.74;-5.13;-49.55;81.03;-73.72;-50.81;-66.36;36.79;-60.30;-79.51;-44.41;71.06
;G;90.26;-21.37;64.51;35.11;-79.62;100.00;46.25;-92.73;-89.58;8.04;47.62;-89.76;88.35;30.25;86.04;-51.27;55.81;82.10;57.82;-84.39
;H;47.12;-0.13;41.57;10.16;-50.10;46.25;100.00;-56.15;-65.73;3.95;42.68;-57.56;49.51;54.10;50.89;-6.56;46.86;53.84;27.87;-49.02
;I;-88.74;27.97;-71.57;-47.24;82.55;-92.73;-56.15;100.00;92.00;-8.58;-45.82;93.08;-89.00;-40.24;-83.29;48.08;-63.17;-90.12;-54.62;82.12
;K;-88.06;21.91;-71.89;-23.92;79.74;-89.58;-65.73;92.00;100.00;-11.16;-50.09;86.47;-84.63;-53.54;-86.23;34.00;-65.83;-82.99;-60.24;83.75
;L;4.46;5.19;-27.74;0.33;-5.13;8.04;3.95;-8.58;-11.16;100.00;-34.95;-12.50;17.36;10.69;23.01;-3.25;-27.34;7.75;13.08;-10.46
;M;42.60;1.87;53.56;14.55;-49.55;47.62;42.68;-45.82;-50.09;-34.95;100.00;-45.88;31.87;39.08;29.61;-15.33;43.52;36.43;0.60;-39.48
;N;-81.23;11.97;-59.94;-56.38;81.03;-89.76;-57.56;93.08;86.47;-12.50;-45.88;100.00;-87.50;-31.46;-84.58;43.23;-52.32;-90.27;-47.85;81.37
;P;83.57;-25.13;51.25;36.45;-73.72;88.35;49.51;-89.00;-84.63;17.36;31.87;-87.50;100.00;27.00;89.01;-53.48;50.31;79.85;63.50;-79.62
;Q;36.83;-23.24;51.67;-6.71;-50.81;30.25;54.10;-40.24;-53.54;10.69;39.08;-31.46;27.00;100.00;25.09;-1.54;41.25;28.65;20.66;-38.19
;R;82.79;-13.34;43.13;22.32;-66.36;86.04;50.89;-83.29;-86.23;23.01;29.61;-84.58;89.01;25.09;100.00;-45.71;39.24;77.47;67.62;-80.17
;S;-57.39;36.44;-19.40;-29.80;36.79;-51.27;-6.56;48.08;34.00;-3.25;-15.33;43.23;-53.48;-1.54;-45.71;100.00;-27.41;-41.33;-31.84;24.20
;T;59.03;-36.93;66.58;16.85;-60.30;55.81;46.86;-63.17;-65.83;-27.34;43.52;-52.32;50.31;41.25;39.24;-27.41;100.00;52.03;35.78;-50.40
;V;73.06;-16.13;60.69;54.67;-79.51;82.10;53.84;-90.12;-82.99;7.75;36.43;-90.27;79.85;28.65;77.47;-41.33;52.03;100.00;46.88;-71.93
;W;55.02;-24.81;32.02;1.49;-44.41;57.82;27.87;-54.62;-60.24;13.08;0.60;-47.85;63.50;20.66;67.62;-31.84;35.78;46.88;100.00;-50.63
;Y;-83.70;10.86;-62.27;-22.53;71.06;-84.39;-49.02;82.12;83.75;-10.46;-39.48;81.37;-79.62;-38.19;-80.17;24.20;-50.40;-71.93;-50.63;100.00
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
moyenne;;60.57;20.29;50.99;26.49;59.03;61.70;39.61;64.91;63.54;12.81;34.58;61.84;59.86;31.90;56.28;30.54;46.22;58.48;37.87;55.14
 74;;7;;1;;7;9;;9;9;;;9;9;;8;;;7;;7
 79;;7;;0;;5;9;;9;9;;;9;8;;7;;;6;;7
max;;90.26;38.43;73.58;56.38;82.55;92.73;65.73;93.08;92.00;34.95;53.56;93.08;89.01;54.10;89.01;57.39;66.58;90.27;67.62;84.39

Diagramme coraa[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Diagramme coraa
  • moyenne de l'aa en fonction de sa corrélation moyenne ( cor moy). La corrélation moyenne est donnée au bas de la matrice des corrélations entre aas.
  • La moyenne des aas (moy. aa) se trouve au bas du tableau des diagrammes des aas.
  • Le diagramme coraa.
;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
cor moy;58;20;49;25;57;60;38;63;62;12;33;60;58;31;55;30;45;56;37;54
moy. aa;490;58;419;521;248;453;128;433;450;611;154;261;286;220;383;336;325;471;74;222

Synthèse des corrélations des codons et des aas[modifier | modifier le wikicode]

Tableau synthétique[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableau synthétique
  • Légende: corrélations en valeur absolue et multipliée par 100 entre 2 aas ou 2 codons.
  1. Corrélations entre aas (acides aminés): d'après la matrice des corrélations.
    1. moy : moyenne des corrélations d'un aa.
    2. 74−79 : nombre de corrélations d'un aa supérieures à 0.74 − dont corrélations supérieures à 0.79.
    3. max : corrélation maximum d'un aa.
  2. Corrélations entre codons
    1. t,c,a,g,t/c,a/g : terminaison des codons (t/c pour t ou c), pour lesquels on a la moyenne "moy" sous moyt (comme pour les aas) et le nombre " 74−79" sous 74−79t (comme pour les aas).
    2. moyt : total des moyennes "moy" des codons d'un aa.
    3. 74−79t  : total des nombres " 74−79" des codons d'un aa.
    4. 0-70 : pour un codon, zéro corrélations supérieures à 0.74 − avec une corrélation maximale (en valeur absolue) de 0.70.
    5. stop : les codons stops. Les codons taa et tga ont une seule corrélation supérieure à 0.74 et c'est celle entre eux. Elle est négative (*). Sont indiqués aussi le maximum de tag et les maxima de taa et tga en dehors de leur corrélation de -0.802.
  3. Résumés :
    1. moyn : nombre des moyennes "moy" pour une gamme donnée en en-tête de la colonne.
    2. 74n : nombre des nombres " 74−79" pour une gamme donnée en en-tête de la colonne.
    3. 74t : total des corrélations supérieures à 0.74 seulement, des codons d'un aa.
    4. moyt : déjà défini dans codons
    5. %total: 20 aas et 61 codons (pour les aas).
  4. Résumé III: La corrélation entre aas traduit peu la corrélation qui existe entre codons. Ainsi
    1. Les aas à un codon, M W, sont peu corrélés avec les autres aas et peu corrélés avec les autres codons;
    2. Les aas, A F I P V Y, sont très corrélés avec les autres aas et leurs codons sont très corrélés avec les autres codons;
    3. Les aas, G K N R, sont très corrélés avec les autres aas et leurs codons sont peu corrélés avec les autres codons;
    4. Les aas, C D E H L Q S T, sont peu corrélés avec les autres aas et leurs codons sont très corrélés avec les autres codons.
  • Tableau synthétique non formaté
;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
aas;cor tot;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
moy;60.6;20.3;51.0;26.5;59.0;61.7;39.6;64.9;63.5;12.8;34.6;61.8;59.9;31.9;56.3;30.5;46.2;58.5;37.9;55.1
 74−79;7−7;;1−0;;7−5;9−9;;9−9;9−9;;;9−9;9−8;;8−7;;;7−6;;7−7
max;;38;74;56;;;66;;;35;54;;;54;;57;67;;68;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
codons ;cor tot;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
moyt;242.3;111.1;135.2;119.9;131.5;190.9;126.2;171.3;119.4;300.5;19.5;116.4;238.4;129.6;222.5;344.0;241.5;244.1;43.2;126.3
t;56.8;57.8;65.8;-;63.7;39.6;60.0;63.2;-;39.2;-;58.9;63.0;-;18.2;62.5;64.1;62.7;-;66.2
c;66.9;53.3;69.4;-;67.8;68.6;66.2;63.8;-;60.0;-;57.6;53.9;-;66.6;54.8;66.0;62.9;-;60.1
a;59.2;-;-;58.2;-;56.0;-;44.3;62.7;51.5;-;-;60.2;63.3;22.4;63.5;63.0;58.4;-;-
g;59.5;-;-;61.7;-;26.8;-;-;56.8;61.9;19.5;-;61.3;66.3;48.5;58.2;48.4;60.1;43.2;-
t/a;;;;;;;;;;61.2;;;;;53.2;62.3;;;;
c/g;;;;;;;;;;26.6;;;;;13.5;42.6;;;;
 74−79t;62−30;8−5;65−48;25−10;56−40;40−30;44−25;50−24;28−12;47−23;0−0;27−18;51−22;50−33;33−18;75−29;76−33;65−18;0−0;48−28
t;7 −4;8−5;28−21;-;22−15;0-70;14 −6;23−13;-;0-69;-;13−10;21−11;-;0-70;16 −7;25 −10;19−11;-;31−20
c;33−17;0-72;37−27;-;34−25;33−28;30−19;26−11;-;9 −4;-;14 −8;1 −1;-;29−17;4 −76;30−17;24 −7;-;17 −8
a;13 −6;-;-;8 −4;-;6 −2;-;1 −76;20−11;0-69;-;-;12 −3;21−12;0-46;27−12;21 −6;10 −78;-;-
g;9 −3;-;-;17−6;-;1-75;-;-;8 −1;20 −6;0-55;-;17 −7;29−21;1 −75;8 −3;0-73;12 −77;0-72;-
t/a;;;;;;;;;;18−13;;;;;2 −1;20 −7;;;;
c/g;;;;;;;;;;0-52;;;;;0-43;0-65;;;;
codons ;Stop;;max;suivant;;;max;;;;;;;;;;;;;
;;taa;80*;60;;tag;48;;;;;;;;;;;;;
;;tga;80*;62;;*  Corrélation taa/tga =;;;-80.2;;;;;;;;;;;
I;Résumés;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
codons ; 27;12-26;10-6;4-0;;codons ; 58;57-51; 49;;;aas;9-7;1;0;;aas; 58;57-51; 49
74n;11;23;9;18;;moyn;40;8;13;;;74n;10;1;9;;moyn;8;3;9
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
II;;;;;;Les plus faibles;;;;Les plus forts;;;;;;;;;;
;;;;;gamme; 3;%total; 33;%total; 12/7;%total; 54;%total;;;;;;;
;;;;;codons;17;27.9;6;9.8;34;55.7;45;73.8;;;;;;;
;;;;;aas;10;50.0;5;25.0;10;50.0;10;50.0;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
III;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
aas;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
 74;7;;1;;7;9;;9;9;;;9;9;;8;;;7;;7
moy ;60.6;20.3;51.0;26.5;59.0;61.7;39.6;64.9;63.5;12.8;34.6;61.8;59.9;31.9;56.3;30.5;46.2;58.5;37.9;55.1
codons ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
74t;62;8;65;25;56;40;44;50;28;47;0;27;51;50;33;75;76;65;0;48
moyt;242.3;111.1;135.2;119.9;131.5;190.9;126.2;171.3;119.4;300.5;19.5;116.4;238.4;129.6;222.5;344.0;241.5;244.1;43.2;126.3
Repartition des fréquences de corrélation des aas et des codons[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Repartition des fréquences de corrélation des aas et des codons
  • Les effectifs ou fréquence (fr) sont comptés à partir des matrices des coefficients de corrélation des aas et des codons. La matrice est formatée sans décimales et copiée dans 'writer'. L'effectif d'une corrélation donnée (exemple 3) est affiché (18) quand on exécute la recherche sur la matrice de cette corrélation avec l'option 'tout rechercher'.
  • Légende :
  1. cor : corrélation
  2. fr : fréquence
  • Les diagrammes: Repartition des corrélations codons et aas. Dans le même tableau de diagrammes: Fréquences des corrélations entre codons, Répartition des corrélations entre codons, Fréquences des corrélations entre aas, Répartition des corrélations entre aas
  • Fréquences des corrélations entre codons (multipliées par 100).
cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr
0;18;20;14;40;14;60;34;80;30;-4;10;-24;4;-44;24;-64;30;-84;10
1;12;21;10;41;12;61;26;81;34;-5;20;-25;6;-45;20;-65;40;-85;8
2;12;22;10;42;24;62;64;82;28;-6;14;-26;16;-46;16;-66;58;-86;4
3;18;23;14;43;16;63;24;83;28;-7;12;-27;8;-47;16;-67;44;-87;6
4;16;24;14;44;32;64;46;84;16;-8;10;-28;18;-48;24;-68;48;-88;4
5;8;25;18;45;14;65;46;85;14;-9;14;-29;20;-49;26;-69;60;-89;2
6;18;26;18;46;28;66;46;86;6;-10;12;-30;20;-50;20;-70;58;-90;6
7;2;27;6;47;12;67;64;87;18;-11;10;-31;4;-51;20;-71;52;-91;2
8;18;28;6;48;12;68;42;88;4;-12;6;-32;18;-52;34;-72;64;-92;2
9;14;29;14;49;26;69;40;89;6;-13;14;-33;18;-53;22;-73;52;total;4032
10;10;30;14;50;40;70;40;90;6;-14;6;-34;18;-54;24;-74;42;;
11;14;31;20;51;18;71;28;91;10;-15;16;-35;16;-55;32;-75;52;;
12;6;32;12;52;42;72;30;92;8;-16;6;-36;10;-56;34;-76;44;;
13;4;33;14;53;24;73;48;93;2;-17;6;-37;8;-57;24;-77;56;;
14;10;34;20;54;38;74;24;94;0;-18;10;-38;24;-58;50;-78;42;;
15;18;35;12;55;18;75;48;95;0;-19;10;-39;24;-59;24;-79;58;;
16;16;36;10;56;38;76;34;96;2;-20;6;-40;16;-60;34;-80;26;;
17;14;37;14;57;18;77;28;-1;12;-21;14;-41;22;-61;32;-81;18;;
18;6;38;10;58;38;78;32;-2;16;-22;10;-42;10;-62;36;-82;30;;
19;20;39;8;59;42;79;34;-3;12;-23;8;-43;6;-63;28;-83;26;;
  • Fréquences des corrélations entre aas (multipliées par 100).
cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr
0;4;20;0;40;0;60;0;80;4;-4;0;-24;2;-44;2;-64;0;-84;4
1;4;21;2;41;2;61;2;81;4;-5;2;-25;4;-45;0;-65;0;-85;4
2;2;22;4;42;2;62;0;82;4;-6;0;-26;0;-46;6;-66;6;-86;2
3;0;23;2;43;8;63;4;83;4;-7;4;-27;6;-47;2;-67;0;-87;2
4;4;24;2;44;2;64;0;84;4;-8;0;-28;2;-48;2;-68;0;-88;2
5;2;25;2;45;0;65;2;85;0;-9;2;-29;0;-49;2;-69;0;-89;4
6;0;26;0;46;2;66;0;86;4;-10;2;-30;2;-50;10;-70;2;-90;8
7;0;27;2;47;6;67;2;87;0;-11;2;-31;2;-51;6;-71;0;-91;0
8;4;28;6;48;4;68;2;88;2;-12;0;-32;2;-52;2;-72;6;-92;0
9;0;29;4;49;0;69;0;89;2;-13;4;-33;0;-53;2;-73;0;-93;2
10;2;30;4;50;4;70;0;90;2;-14;0;-34;0;-54;2;-74;4;total;380
11;4;31;0;51;4;71;2;91;0;-15;2;-35;2;-55;2;-75;0;;
12;2;32;4;52;4;72;0;92;2;-16;2;-36;0;-56;4;-76;0;;
13;2;33;0;53;0;73;2;93;2;-17;0;-37;2;-57;2;-77;0;;
14;0;34;2;54;6;74;0;94;0;-18;0;-38;4;-58;2;-78;0;;
15;2;35;2;55;4;75;0;95;0;-19;2;-39;2;-59;0;-79;0;;
16;0;36;8;56;2;76;0;96;0;-20;0;-40;2;-60;6;-80;8;;
17;6;37;4;57;0;77;2;-1;0;-21;4;-41;2;-61;0;-81;2;;
18;0;38;0;58;2;78;0;-2;2;-22;0;-42;0;-62;2;-82;0;;
19;0;39;4;59;2;79;0;-3;2;-23;4;-43;0;-63;2;-83;4;;
Tableaux triés des corrélations des aas et des codons entre eux[modifier | modifier le wikicode]
Tableau trié des corrélations des aas entre eux[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableau trié des corrélations des aas entre eux
  • Image du tableau formaté:
voir ici





  • Tableau non formaté
Corrélation entre codons dans les gènes de protéines: I Diagrammes étendus.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
111 bactéries, 6 protéines chaque, d'un total moyen de 6 550 aas.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tri du tableau des corrélations entre aas: Corrélations fortes entre groupe d’aas.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;https://fr.wikiversity.org/wiki/Recherche:Corrélation_entre_les_codons_dans_les_gènes_de_protéines;;;;;;;;;;;;;;;;;
aa;G;A;P;V;R;D;Q;M;H;T;W;E;L;S;C;Y;F;N;K;I;
G;;90;88;82;86;65;30;48;46;56;58;35;8;-51;-21;-84;-80;-90;-90;-93;G
A;90;;84;73;83;63;37;43;47;59;55;17;4;-57;-27;-84;-70;-81;-88;-89;A
P;88;84;;80;89;51;27;32;50;50;63;36;17;-53;-25;-80;-74;-87;-85;-89;P
V;82;73;80;;77;61;29;36;54;52;47;55;8;-41;-16;-72;-80;-90;-83;-90;V
R;86;83;89;77;;43;25;30;51;39;68;22;23;-46;-13;-80;-66;-85;-86;-83;R
D;65;63;51;61;43;;52;54;42;67;32;28;-28;-19;-38;-62;-74;-60;-72;-72;D
Q;30;37;27;29;25;52;;39;54;41;21;-7;11;-2;-23;-38;-51;-31;-54;-40;Q
M;48;43;32;36;30;54;39;;43;44;1;15;-35;-15;2;-39;-50;-46;-50;-46;M
H;46;47;50;54;51;42;54;43;;47;28;10;4;-7;0;-49;-50;-58;-66;-56;H
T;56;59;50;52;39;67;41;44;47;;36;17;-27;-27;-37;-50;-60;-52;-66;-63;T
W;58;55;63;47;68;32;21;1;28;36;;1;13;-32;-25;-51;-44;-48;-60;-55;W
E;35;17;36;55;22;28;-7;15;10;17;1;;0;-30;-21;-23;-50;-56;-24;-47;E
L;8;4;17;8;23;-28;11;-35;4;-27;13;0;;-3;5;-10;-5;-13;-11;-9;L
S;-51;-57;-53;-41;-46;-19;-2;-15;-7;-27;-32;-30;-3;;36;24;37;43;34;48;S
C;-21;-27;-25;-16;-13;-38;-23;2;0;-37;-25;-21;5;36;;11;29;12;22;28;C
Y;-84;-84;-80;-72;-80;-62;-38;-39;-49;-50;-51;-23;-10;24;11;;71;81;84;82;Y
F;-80;-70;-74;-80;-66;-74;-51;-50;-50;-60;-44;-50;-5;37;29;71;;81;80;83;F
N;-90;-81;-87;-90;-85;-60;-31;-46;-58;-52;-48;-56;-13;43;12;81;81;;86;93;N
K;-90;-88;-85;-83;-86;-72;-54;-50;-66;-66;-60;-24;-11;34;22;84;80;86;;92;K
I;-93;-89;-89;-90;-83;-72;-40;-46;-56;-63;-55;-47;-9;48;28;82;83;93;92;;I
;G;A;P;V;R;D;Q;M;H;T;W;E;L;S;C;Y;F;N;K;I;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
90;;;corrélations fortes  79 dans les carrés  5X5.;;;;;;;;;;;;;;;;;;
39;28;24;corrélations moyennes et faibles positives.;;;;;;;;;;;;;;;;;;
-11;;;corrélations faibles positives et négatives de Leu.;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tableau trié des corrélations des codons entre eux[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableau trié des corrélations des codons entre eux

Un tableau de cette taille formaté avec wikipédia serait très compliqué à faire. Aussi j'ai opté de prendre une image de ce tableau formaté sous le tableur calc de LibreOffice.

  • Image du tableau formaté:
    voir ici
  • Construction: 3 lignes-colonnes sont ajoutées pour trier les codons. La L-C "ordre original" sert à retrouver l’ordre de la matrice des corrélations entre codons. Elle est numérotée de 1 à 64 de façon progressive sur cette matrice. Les 2 autres L-C "ordres optimisés" séparent les numéros des codons se terminant par "a,t" (en incluant agg, ttg et en excluant tga) des numéros des codons se terminant par "g,c" (en procédant de façon inverse pour agg, ttg et tga).
  • Tri sur les valeurs les plus élevées des corrélations: les numéros des 2 L-C sont obtenus par estimation de l'ordre des codons suivant le classement de leurs corrélations positives avec les autres codons. Le tableau final est optimisé pour avoir des groupes de codons fortement corrélés entre eux, les plus grands possibles. Voici ci-dessous les ordres estimés et optimisés obtenus, à recopier dans un tableur. Les codons ayant beaucoup de corrélations alternées, positives et négatives, ne sont pas inclus, c'est à dire atg, tag, ctg, agg. Les tris ne concernent alors que 2 carrés à corrélations positives de 29X29 codons.
Tri par le codon le plus fort;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Effectifs par tranche de corrélations positives;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
codon;;tat;ttt;aat;tta;aaa;att;gat;gtt;caa;act;cct;gca;tca;gct;aca;cca;tct;agt;cat;gaa;tgt;gta;gga;aga;cta;ata;ctt;ggt;taa;ttg;cga;cgt;agg
 82;;5;5;5;5;5;6;4;3;2;1;1;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;−;−
 89;;4;3;4;2;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;−
79-88;;4;4;2;5;2;7;10;7;7;6;5;5;7;4;1;3;3;3;2;3;2;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;−;−
69-78;;6;6;4;4;6;7;6;6;8;12;11;5;7;5;17;8;15;12;9;6;6;8;3;1;1;4;1;0;0;0;0;−;−
59-68;;9;8;6;7;11;6;8;10;7;6;7;10;8;7;7;10;6;9;9;10;14;12;14;14;13;4;4;5;0;0;0;−;−
49-58;;3;4;5;6;2;3;3;4;3;2;3;4;3;8;1;5;1;1;2;7;3;7;8;6;7;5;5;5;10;2;0;−;−
39-48;;;2;5;2;2;2;1;1;3;2;3;3;2;4;2;1;3;1;6;1;;1;;4;6;3;8;5;11;5;3;−;−
29-38;;2;;;;2;4;2;1;2;1;1;2;1;1;;2;2;3;1;2;4;1;1;;1;8;6;7;3;8;8;−;−
19-28;;2;3;2;2;;1;;1;;1;;1;1;;2;1;;1;;1;1;;2;;2;1;5;4;2;9;11;−;−
9-18;;;;2;2;2;;;;;;;;1;1;;;;;;;;1;;2;;2;1;1;3;4;4;−;−
 9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;2;;3;;3;1;2;4;−;−
Total;;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;29;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;−;−
ordre estimé;;1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;32;33
ordre optimisé;;1;2;3;4;5;6;8;9;10;11;12;13;7;14;19;16;17;18;15;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;32;33
ordre d’origine;;17;9;19;1;7;59;37;51;29;55;48;39;12;40;56;47;11;13;27;35;43;52;31;21;4;60;3;32;62;2;22;23;24
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
codon;;gac;ttc;ggc;cac;cgc;cag;gcc;acc;atc;ccg;ctg;tac;gcg;gtc;aac;tcg;ctc;gag;aag;ccc;gtg;tcc;tgc;acg;cgg;tga;agc;tgg;ggg;atg;tag;;
 89;;3;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;−;;
79-88;;10;11;11;9;11;9;8;8;7;5;3;3;2;6;5;3;3;2;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;−;;
69-78;;7;7;5;8;4;8;8;7;7;7;9;7;10;8;4;8;10;11;6;2;11;5;2;2;1;0;0;0;1;−;−;;
59-68;;5;3;4;4;6;5;6;6;7;4;5;8;6;9;9;7;7;9;12;12;12;11;12;8;8;3;3;2;0;−;−;;
49-58;;2;4;5;4;5;4;4;4;2;8;4;7;4;3;6;6;4;4;4;7;5;7;9;7;10;12;13;14;2;−;−;;
39-48;;;;;;;;;1;3;1;5;1;2;;2;2;3;2;4;3;;4;2;8;7;10;4;9;1;−;−;;
29-38;;;;;1;;2;1;1;1;2;1;;2;1;2;1;1;;;3;;1;4;2;2;1;6;3;7;−;−;;
19-28;;2;2;1;;2;;;1;;;1;1;2;1;;;;;1;;;1;;1;;1;3;1;11;−;−;;
9-18;;;;1;1;;;1;;1;1;;;;1;;2;;;;;1;;;1;1;1;;;5;−;−;;
 9;;;;;;;;;;;;;1;;;1;;1;1;1;1;;;;;;1;;;2;−;−;;
Total;;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;−;−;;
ordre estimé;;1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;;
ordre optimisé;;1;2;3;4;5;6;7;8;9;14;10;11;15;12;13;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;;
ordre d’origine;;38;10;33;28;25;30;42;58;61;49;5;18;41;54;20;14;6;36;8;50;53;15;44;57;26;64;16;46;34;45;63;;
  • Tableau non formaté
;;;;;;;;;;;;;;https://fr.wikiversity.org/wiki/Recherche:Corrélation_entre_les_codons_dans_les_gènes_de_protéines  .;;;;;;;;;;;;;#Diagrammes_étendus_des_aas  .;;;;;/Annexe/Tableaux#Tableau_trié_des_corrélations_des_codons_entre_eux  .;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Corrélation entre codons dans les gènes de protéines: I Diagrammes étendus.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
111 bactéries, 6 protéines chaque, d'un total moyen de 6 550 aas.;;;;;;;;;;;;;;;91;85;80;corrélations fortes  79 dans le carré  29X29 des positives;;;;;;;;30;-60;corrélations positives/négatives normales;;;;;;;-79;corrélations fortes  -79 dans les rectangles des négatives;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tri du tableau des corrélations entre codons: Corrélations fortes entre groupe de codons.;;;;;;;;;;;;;;;57;40;;corrélations faibles   59 dans le carré  29X29 des positives;;;;;;;;9;-26;corrélations positives/négatives anormales (base 3);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
   tri sur les corrélations les plus élevées;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ordre original;;;;17;9;19;1;7;59;12;37;51;29;55;48;39;40;27;47;11;13;56;35;43;52;31;21;4;60;3;32;62;2;22;23;24;63;45;34;46;16;64;26;57;44;15;53;50;8;36;6;14;41;49;20;54;18;5;61;58;42;30;25;28;33;10;38;
;ordres optimisés;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;31;30;29;28;27;26;25;24;23;22;21;20;19;18;17;16;15;14;13;12;11;10;9;8;7;6;5;4;3;2;1;
;;;;1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;32;33;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;tat;ttt;aat;tta;aaa;att;tca;gat;gtt;caa;act;cct;gca;gct;cat;cca;tct;agt;aca;gaa;tgt;gta;gga;aga;cta;ata;ctt;ggt;taa;ttg;cga;cgt;agg;tag;atg;ggg;tgg;agc;tga;cgg;acg;tgc;tcc;gtg;ccc;aag;gag;ctc;tcg;gcg;ccg;aac;gtc;tac;ctg;atc;acc;gcc;cag;cgc;cac;ggc;ttc;gac;
17;;1;tat;100;91;92;90;91;86;81;79;66;78;73;68;60;56;78;62;75;81;75;63;76;68;65;64;54;67;33;34;49;23;25;0;-4;4;-26;-33;-69;-59;-52;-56;-61;-66;-74;-77;-66;-77;-79;-77;-66;-73;-71;-82;-76;-88;-75;-79;-82;-79;-86;-79;-92;-82;-89;-90;tat
9;;2;ttt;91;100;91;85;93;87;79;68;63;69;69;67;57;50;68;59;77;77;69;55;80;59;65;64;52;70;41;27;44;19;23;-8;8;4;-40;-28;-63;-53;-47;-52;-63;-61;-68;-72;-56;-73;-73;-70;-69;-73;-76;-77;-75;-76;-73;-83;-79;-77;-82;-79;-83;-82;-90;-87;ttt
19;;3;aat;92;91;100;91;92;85;79;61;50;68;66;54;44;40;62;53;69;73;63;43;69;50;56;59;41;69;19;20;41;9;15;-13;-6;2;-46;-35;-72;-58;-41;-48;-60;-61;-66;-69;-55;-70;-69;-62;-58;-67;-66;-80;-65;-77;-69;-74;-73;-68;-81;-68;-81;-72;-79;-78;aat
1;;4;tta;90;85;91;100;84;85;81;66;56;81;75;58;47;50;67;62;71;78;67;51;71;57;59;61;54;62;13;26;45;9;21;-8;-8;4;-41;-30;-62;-65;-46;-44;-60;-70;-72;-71;-55;-72;-69;-64;-61;-66;-70;-82;-65;-79;-73;-79;-76;-71;-87;-70;-80;-74;-82;-78;tta
7;;5;aaa;91;93;92;84;100;83;78;65;62;67;67;62;55;46;61;59;73;72;70;60;73;61;64;67;46;71;35;31;49;11;14;-6;0;-1;-39;-38;-70;-52;-49;-58;-64;-65;-68;-75;-61;-78;-76;-69;-70;-68;-70;-71;-75;-74;-68;-76;-77;-79;-82;-78;-82;-80;-84;-84;aaa
59;;6;att;86;87;85;85;83;100;82;75;70;83;75;67;60;62;73;67;75;72;70;60;67;54;57;46;47;38;32;38;52;25;34;15;-13;-2;-30;-31;-66;-58;-51;-51;-58;-64;-67;-71;-62;-77;-79;-72;-66;-69;-70;-74;-74;-77;-70;-75;-77;-77;-79;-73;-80;-79;-85;-84;att
12;;7;tca;81;79;79;81;78;82;100;75;74;79;77;67;65;58;66;74;70;75;82;64;62;58;67;68;62;54;42;38;46;19;16;-1;0;8;-28;-37;-62;-59;-52;-53;-61;-71;-74;-75;-62;-68;-74;-67;-67;-72;-74;-71;-70;-73;-76;-78;-81;-76;-83;-76;-78;-79;-79;-79;tca
37;;8;gat;79;68;61;66;65;75;75;100;85;83;81;83;81;81;87;77;75;80;75;79;64;75;63;58;66;35;52;59;52;46;36;25;2;1;3;-28;-52;-48;-59;-61;-53;-60;-66;-69;-72;-68;-79;-81;-70;-71;-69;-71;-81;-83;-72;-71;-80;-83;-75;-82;-87;-83;-83;-91;gat
51;;9;gtt;66;63;50;56;62;70;74;85;100;71;82;81;83;84;69;81;73;67;76;81;60;67;65;57;64;33;65;62;51;40;23;27;12;4;1;-32;-45;-49;-58;-63;-58;-58;-57;-76;-68;-60;-75;-73;-75;-68;-70;-54;-77;-63;-70;-72;-76;-84;-70;-82;-73;-82;-76;-80;gtt
29;;10;caa;78;69;68;81;67;83;79;83;71;100;80;71;66;72;81;76;70;80;73;68;62;65;56;48;65;30;31;50;51;46;42;21;-8;6;-13;-24;-49;-56;-57;-44;-48;-72;-72;-70;-63;-74;-75;-70;-63;-66;-71;-73;-68;-77;-79;-71;-78;-76;-88;-75;-78;-79;-81;-80;caa
55;;11;act;73;69;66;75;67;75;77;81;82;80;100;77;74;82;69;83;79;75;69;70;66;72;63;60;65;41;43;56;52;30;20;21;-5;-4;-9;-36;-44;-54;-54;-60;-66;-67;-68;-75;-69;-67;-73;-72;-73;-70;-75;-66;-75;-69;-74;-77;-79;-82;-79;-76;-74;-80;-78;-78;act
48;;12;cct;68;67;54;58;62;67;67;83;81;71;77;100;79;85;74;70;82;70;77;73;69;76;73;60;64;43;69;48;45;49;36;17;17;6;-8;-22;-38;-41;-54;-59;-55;-55;-58;-67;-58;-57;-67;-71;-73;-78;-80;-65;-77;-64;-77;-77;-79;-80;-72;-81;-74;-84;-79;-83;cct
39;;13;gca;60;57;44;47;55;60;65;81;83;66;74;79;100;75;69;82;67;65;77;79;59;74;56;52;61;32;64;67;44;36;25;32;8;8;5;-34;-35;-41;-55;-66;-48;-58;-56;-64;-69;-59;-72;-67;-69;-60;-66;-52;-77;-58;-64;-67;-72;-83;-64;-72;-68;-75;-73;-75;gca
40;;14;gct;56;50;40;50;46;62;58;81;84;72;82;85;75;100;66;77;71;63;66;70;51;67;54;39;64;16;54;64;47;52;33;42;-4;-1;10;-26;-30;-40;-53;-57;-48;-55;-52;-63;-64;-54;-64;-70;-67;-67;-67;-50;-69;-58;-66;-62;-68;-74;-63;-69;-63;-73;-66;-70;gct
27;;15;cat;78;68;62;67;61;73;66;87;69;81;69;74;69;66;100;62;74;71;70;68;66;64;56;46;54;34;45;42;44;47;46;24;0;-1;9;-18;-42;-47;-47;-49;-42;-50;-61;-63;-65;-69;-75;-75;-56;-64;-59;-77;-68;-85;-70;-66;-77;-72;-74;-71;-90;-73;-79;-85;cat
47;;16;cca;62;59;53;62;59;67;74;77;81;76;83;70;82;77;62;100;70;68;75;72;58;67;52;53;68;32;46;67;54;31;21;30;-3;-5;-5;-34;-39;-54;-55;-58;-58;-73;-60;-68;-69;-61;-69;-66;-72;-65;-74;-54;-71;-58;-69;-66;-72;-78;-75;-73;-65;-75;-70;-72;cca
11;;17;tct;75;77;69;71;73;75;70;75;73;70;79;82;67;71;74;70;100;64;69;62;82;67;69;60;59;49;44;42;42;33;34;18;4;-2;-15;-26;-40;-58;-45;-58;-60;-60;-56;-70;-66;-69;-72;-71;-72;-67;-72;-69;-74;-70;-70;-73;-79;-83;-73;-78;-78;-82;-78;-83;tct
13;;18;agt;81;77;73;78;72;72;75;80;67;80;75;70;65;63;71;68;64;100;73;61;72;70;66;66;68;54;40;38;37;26;31;-5;5;10;-29;-22;-52;-44;-44;-48;-55;-65;-70;-68;-57;-65;-64;-66;-65;-72;-75;-77;-71;-74;-76;-77;-78;-75;-82;-78;-77;-82;-83;-83;agt
56;;19;aca;75;69;63;67;70;70;82;75;76;73;69;77;77;66;70;75;69;73;100;75;64;76;73;68;67;51;61;40;43;25;24;4;9;9;-21;-30;-48;-50;-50;-56;-55;-66;-66;-74;-61;-63;-69;-65;-69;-74;-73;-68;-72;-66;-79;-76;-85;-78;-81;-77;-76;-81;-76;-79;aca
35;;20;gaa;63;55;43;51;60;60;64;79;81;68;70;73;79;70;68;72;62;61;75;100;50;72;66;59;55;31;58;51;58;32;19;24;3;-3;10;-33;-44;-38;-62;-64;-47;-54;-60;-63;-61;-62;-86;-71;-68;-60;-62;-51;-76;-60;-59;-63;-71;-76;-66;-72;-71;-73;-71;-75;gaa
43;;21;tgt;76;80;69;71;73;67;62;64;60;62;66;69;59;51;66;58;82;72;64;50;100;66;62;62;60;65;34;36;33;28;29;4;14;3;-25;-19;-35;-52;-37;-50;-56;-52;-56;-63;-54;-62;-62;-62;-61;-62;-69;-67;-69;-67;-67;-73;-71;-75;-72;-75;-73;-79;-79;-80;tgt
52;;22;gta;68;59;50;57;61;54;58;75;67;65;72;76;74;67;64;67;67;70;76;72;66;100;66;63;69;52;49;53;48;29;17;15;17;0;-7;-29;-34;-39;-53;-61;-53;-57;-59;-67;-59;-55;-59;-68;-68;-67;-67;-52;-78;-58;-65;-70;-74;-77;-69;-77;-68;-78;-72;-76;gta
31;;23;gga;65;65;56;59;64;57;67;63;65;56;63;73;56;54;56;52;69;66;73;66;62;66;100;83;56;62;62;7;19;23;35;-26;32;22;-32;-18;-35;-43;-32;-49;-50;-48;-51;-65;-41;-43;-55;-49;-60;-72;-70;-64;-62;-54;-76;-75;-77;-71;-69;-77;-66;-80;-68;-71;gga
21;;24;aga;64;64;59;61;67;46;68;58;57;48;60;60;52;39;46;53;60;66;68;59;62;63;83;100;58;76;49;12;18;3;6;-45;33;16;-39;-30;-41;-44;-27;-49;-57;-55;-56;-62;-41;-40;-49;-46;-57;-65;-66;-61;-58;-52;-66;-72;-70;-65;-69;-72;-64;-71;-65;-67;aga
4;;25;cta;54;52;41;54;46;47;62;66;64;65;65;64;61;64;54;68;59;68;67;55;60;69;56;58;100;41;41;43;37;26;26;4;20;9;-13;-16;-29;-39;-45;-44;-46;-56;-57;-57;-47;-41;-46;-55;-56;-59;-65;-50;-60;-51;-66;-62;-66;-65;-67;-68;-58;-69;-62;-64;cta
60;;26;ata;67;70;69;62;71;38;54;35;33;30;41;43;32;16;34;32;49;54;51;31;65;52;62;76;41;100;28;1;15;-4;-5;-44;43;16;-45;-20;-40;-35;-21;-38;-51;-38;-44;-50;-27;-34;-38;-39;-47;-57;-58;-56;-51;-45;-55;-71;-58;-53;-61;-62;-58;-60;-60;-56;ata
3;;27;ctt;33;41;19;13;35;32;42;52;65;31;43;69;64;54;45;46;44;40;61;58;34;49;62;49;41;28;100;25;22;31;20;-1;37;13;-3;-11;-19;-9;-34;-40;-35;-22;-29;-47;-33;-23;-37;-39;-51;-54;-53;-35;-50;-30;-58;-49;-56;-52;-41;-57;-46;-56;-49;-52;ctt
32;;28;ggt;34;27;20;26;31;38;38;59;62;50;56;48;67;64;42;67;42;38;40;51;36;53;7;12;43;1;25;100;53;37;5;70;-12;-23;25;-39;-18;-28;-45;-55;-32;-49;-33;-45;-61;-46;-52;-56;-48;-36;-36;-9;-53;-34;-29;-29;-34;-55;-38;-53;-39;-51;-42;-45;ggt
62;;29;taa;49;44;41;45;49;52;46;52;51;51;52;45;44;47;44;54;42;37;43;58;33;48;19;18;37;15;22;53;100;18;-5;42;-15;-48;8;-26;-38;-21;-80;-44;-40;-41;-45;-49;-48;-52;-60;-59;-54;-37;-42;-32;-53;-48;-33;-36;-42;-50;-44;-47;-51;-46;-49;-52;taa
2;;30;ttg;23;19;9;9;11;25;19;46;40;46;30;49;36;52;47;31;33;26;25;32;28;29;23;3;26;-4;31;37;18;100;46;30;13;8;16;9;6;-9;-28;-13;2;-15;-21;-19;-28;-24;-30;-40;-25;-32;-29;-20;-32;-27;-43;-23;-34;-33;-36;-39;-33;-41;-29;-38;ttg
22;;31;cga;25;23;15;21;14;34;16;36;23;42;20;36;25;33;46;21;34;31;24;19;29;17;35;6;26;-5;20;5;-5;46;100;6;3;19;-2;22;1;-17;-8;-1;-2;-18;-15;-23;-15;-28;-21;-18;-14;-26;-25;-38;-16;-34;-38;-21;-30;-29;-26;-33;-28;-38;-32;-35;cga
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38;1;;gac;-90;-87;-78;-78;-84;-84;-79;-91;-80;-80;-78;-83;-75;-70;-85;-72;-83;-83;-79;-75;-80;-76;-71;-67;-64;-56;-52;-45;-52;-38;-35;-11;-9;-3;19;25;61;53;58;60;61;62;71;72;67;73;81;79;77;76;78;80;87;84;78;80;87;87;84;87;92;90;91;100;gac
;;;;tat;ttt;aat;tta;aaa;att;tca;gat;gtt;caa;act;cct;gca;gct;cat;cca;tct;agt;aca;gaa;tgt;gta;gga;aga;cta;ata;ctt;ggt;taa;ttg;cga;cgt;agg;tag;atg;ggg;tgg;agc;tga;cgg;acg;tgc;tcc;gtg;ccc;aag;gag;ctc;tcg;gcg;ccg;aac;gtc;tac;ctg;atc;acc;gcc;cag;cgc;cac;ggc;ttc;gac;
Tableaux triés, connexions entre codons et aas[modifier | modifier le wikicode]
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original;63;45;34;46;16;64;26;57;44;15;53;50;8;36;6;14;41;49;20;54;18;5;61;58;42;30;25;28;33;10;38;;
optimisé;31;30;29;28;27;26;25;24;23;22;21;20;19;18;17;16;15;14;13;12;11;10;9;8;7;6;5;4;3;2;1;;
;tag;atg;ggg;tgg;agc;tga;cgg;acg;tgc;tcc;gtg;ccc;aag;gag;ctc;tcg;gcg;ccg;aac;gtc;tac;ctg;atc;acc;gcc;cag;cgc;cac;ggc;ttc;gac;;
Max;22.25;55.16;74.87;61.45;61.70;60.32;74.87;73.17;72.02;75.92;77.13;79.31;79.66;81.04;79.79;80.94;89.00;89.00;82.94;87.07;91.59;89.57;88.54;89.03;89.03;89.57;95.68;92.27;95.68;91.28;92.27;;
Min;-48.15;-46.46;-38.78;-71.53;-64.87;-80.24;-65.90;-66.15;-73.30;-74.35;-76.77;-72.38;-78.31;-86.37;-80.77;-75.13;-77.62;-80.14;-82.38;-81.38;-88.25;-79.19;-82.53;-85.32;-83.65;-88.14;-81.70;-92.36;-83.92;-90.20;-91.48;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;synthèse;;20+2 connectés forts;;;5 connectés moyens : 65-73;;;;;2 solitaires : tga   et    ggg;;;;;2 très faibles : ;;atg-cgt;55;;;;;;;;;;;;;
;;;;dont gtg, tcc  76;;;avec ;73;tgc  acg  tgg;;;;taa-tga :-80, -62 gaa;;;;;;tag-taa;-48;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;66;cgg  agc;;;;ggg-cgg : 75,   57 ccc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
original;24;23;22;2;17;9;19;1;7;59;12;37;51;29;55;48;39;40;27;47;11;13;56;35;43;52;31;21;4;60;3;32;62
optimisé;33;32;31;30;1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29
;agg;cgt;cga;ttg;tat;ttt;aat;tta;aaa;att;tca;gat;gtt;caa;act;cct;gca;gct;cat;cca;tct;agt;aca;gaa;tgt;gta;gga;aga;cta;ata;ctt;ggt;taa
max;43.32;69.88;46.30;52.10;92.05;92.94;92.05;90.98;92.94;87.33;82.27;86.61;84.97;82.64;83.27;85.36;83.47;85.36;86.61;83.27;82.34;81.44;82.27;80.74;82.11;75.97;82.93;82.93;68.51;75.97;68.72;67.35;58.25
min;-38.68;-44.58;-38.30;-42.83;-92.36;-90.20;-80.73;-86.50;-84.30;-84.59;-83.35;-91.48;-83.65;-88.14;-81.50;-83.92;-82.64;-73.65;-90.01;-77.95;-83.42;-83.40;-85.32;-86.37;-79.61;-77.83;-80.36;-72.28;-68.69;-71.17;-58.20;-61.03;-80.24
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gcc;gcc;gga;;aga;;;
;;synthèse;;24+1 connectés forts;;;3 connectés moyens : 68;;;;;2 solitaires : taa   et    cgt;;;;;3 très faibles : ;;ttg-gct;;52;;;;;;;;;;;;
;;;;dont ata-aga   76;;;avec ;cta  ctt  ggt;;;;;tga-taa :-80, -60 gag;;;;;;agg-ata;;43;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;cgt-ggt : 70,  45 aga;;;;;;cga-cat,ttg;;46;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;20+2 connectés forts :;;;20 forts  79 connectés entre eux et 2  75 connectés avec beaucoup de forts;;;;;;;;;;;solitaire  ggg-cgg : 75,   57 ccc ; ggg a 1 seule corrélation forte de 75 avec cgg moyen, et un maximum de 57 avec ccc fort;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y;;;;;;;;;;;;;
Max;90.26;36.44;66.58;54.67;82.55;90.26;53.84;93.08;92.00;23.01;53.56;93.08;89.01;54.10;89.01;48.08;66.58;82.10;67.62;83.75;;;;;;;;;;;;;
Min;-88.74;-38.43;-73.58;-56.38;-79.62;-92.73;-65.73;-92.73;-89.58;-34.95;-49.55;-89.76;-89.00;-53.54;-86.23;-57.39;-65.83;-90.12;-60.24;-84.39;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;synthèse;;10 forts     83;     ;;;1 fort moyen  74;;;;3 moyens  67;;;6 très faibles   57;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;KNIFY  PRAGV;;;D;;;;WHT;;;MQSCLE;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tableau trié des 10 aas fortement corrélés entre eux[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableau trié des 10 aas fortement corrélés entre eux
  • Tableau non formaté
  • Tableau formaté (+ D)
  • Distribution des fréquences entre ces 10 aas et le total
;;corrélations entre les 10 aas les plus corrélés + D.;;;;;;;;;
;I;K;N;F;Y;G;A;P;V;R;D
I;;92;93;83;82;-93;-89;-89;-90;-83;-72
K;92;;86;80;84;-90;-88;-85;-83;-86;-72
N;93;86;;81;81;-90;-81;-87;-90;-85;-60
F;83;80;81;;71;-80;-70;-74;-80;-66;-74
Y;82;84;81;71;;-84;-84;-80;-72;-80;-62
G;-93;-90;-90;-80;-84;;90;88;82;86;65
A;-89;-88;-81;-70;-84;90;;84;73;83;63
P;-89;-85;-87;-74;-80;88;84;;80;89;51
V;-90;-83;-90;-80;-72;82;73;80;;77;61
R;-83;-86;-85;-66;-80;86;83;89;77;;43
D;-72;-72;-60;-74;-62;65;63;51;61;43;
Tableaux triés de groupes de codons fortement corrélés entre eux[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableaux triés de groupes de codons fortement corrélés entre eux
  • Uniquement les corrélations positives
  • Tableau formaté de 7 codons fortement corrélés se terminant par a,t.
    • Tableau non formaté
;;Y;F;N;L;K;I;S
;codon;tat;ttt;aat;tta;aaa;att;tca
Y;tat;100;91;92;90;91;86;81
F;ttt;91;100;91;85;93;87;79
N;aat;92;91;100;91;92;85;79
L;tta;90;85;91;100;84;85;81
K;aaa;91;93;92;84;100;83;78
I;att;86;87;85;85;83;100;82
S;tca;81;79;79;81;78;82;100
  • Tableau formaté de 8 codons moyennement corrélés se terminant par a,t.
    • Tableau non formaté
;;D;V;Q;T;P;A;A;H
;codon;gat;gtt;caa;act;cct;gca;gct;cat
D;gat; ;85;83;81;83;81;81;87
V;gtt;85; ;71;82;81;83;84;69
Q;caa;83;71; ;80;71;66;72;81
T;act;81;82;80; ;77;74;82;69
P;cct;83;81;71;77; ;79;85;74
A;gca;81;83;66;74;79; ;75;69
A;gct;81;84;72;82;85;75; ;66
H;cat;87;69;81;69;74;69;66; 
  • Tableau formaté de 12 codons fortement corrélés se terminant par g,c.
    • Tableau non formaté
;;V;Y;L;I;T;A;Q;R;H;G;F;D
;codon;gtc;tac;ctg;atc;acc;gcc;cag;cgc;cac;ggc;ttc;gac
V;gtc; ;64;62;77;78;84;71;80;78;83;82;87
Y;tac;64; ;66;66;73;68;76;67;92;70;82;84
L;ctg;62;66; ;75;88;76;90;77;76;83;74;78
I;atc;77;66;75; ;82;79;79;82;76;84;89;80
T;acc;78;73;88;82; ;89;86;81;84;86;81;87
A;gcc;84;68;76;79;89; ;78;87;79;88;83;87
Q;cag;71;76;90;79;86;78; ;82;83;85;83;84
R;cgc;80;67;77;82;81;87;82; ;80;96;85;87
H;cac;78;92;76;76;84;79;83;80; ;81;87;92
G;ggc;83;70;83;84;86;88;85;96;81; ;87;90
F;ttc;82;82;74;89;81;83;83;85;87;87; ;91
D;gac;87;84;78;80;87;87;84;87;92;90;91; 
Les Corrélations faibles entre codons[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Les Corrélations faibles entre codons
  • Légende: tga processus non GC pour ce codon; mcor corrélation moyenne du codon.
  • Tableau non formaté
;cta;ata;ctt;ggt;taa;ggg;tgg;agc;tga;cgg;acg;tgc;tcc
cta;;41;41;43;37;-16;-29;-39;-45;-44;-46;-56;-57
ata;41;;28;1;15;-20;-40;-35;-21;-38;-51;-38;-44
ctt;41;28;;25;22;-11;-19;-9;-34;-40;-35;-22;-29
ggt;43;1;25;;53;-39;-18;-28;-45;-55;-32;-49;-33
taa;37;15;22;53;;-26;-38;-21;-80;-44;-40;-41;-45
ggg;-16;-20;-11;-39;-26;;37;26;15;75;24;30;36
tgg;-29;-40;-19;-18;-38;37;;33;43;50;44;34;52
agc;-39;-35;-9;-28;-21;26;33;;23;29;31;62;39
tga;-45;-21;-34;-45;-80;15;43;23;;44;42;37;44
cgg;-44;-38;-40;-55;-44;75;50;29;44;;46;42;50
acg;-46;-51;-35;-32;-40;24;44;31;42;46;;44;40
tgc;-56;-38;-22;-49;-41;30;34;62;37;42;44;;65
tcc;-57;-44;-29;-33;-45;36;52;39;44;50;40;65;
;;;;;;;;;;;;;
mcor;51.5;44.3;39.2;39.6;42;26.8;43.2;42.6;44.8;48.5;48.4;53.3;54.8
Corrélations isolées, fortes et faibles entre codons[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Corrélations isolées, fortes et faibles entre codons
ccg     ccg     aga     aac     caa     tct
gcg     ggc     gga     cac     att     tgt
89      84      83      83      83      82
                                        
caa     tat     gag     ttt     gct     gct
tta     agt     cac     tgt     aat     aac
81      81      81      80      40      -50
                                        
tga     cgt     tga     cgt     cgg     ata
taa     atg     gtc     ggt     ggg     aga
-80     55      60      70      75      76
Codons ne suivant pas le processus GC[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Codons ne suivant pas le processus GC
  • Légende: mcod, moyenne du codon − mcor, moyenne des corrélations en valeurs absolues du codon − 7 cod dans le carré des 7 codons − seul, corrélation solitaire forte − max, corrélation maximum en dehors de la solitaire.
  • tga est l’équivalent de taa puisque il y a revirement total.
  • Alors que ttg se comporte comme cga, mais à l’envers.
  • Donc il y a 6 indéterminés : ttg cga cgt agg tag atg.
  • taa et ggg sont normaux donc ont un total de 63 codons pour le décompte des processus.
  • Les 7 codons ont un total de 57 codons en dehors des 7.
  • Il y a une inconnue sur le processus de la corrélation dans le carré des 7 codons.

Corrélations entre bactéries et conformation des protéines[modifier | modifier le wikicode]

Conformation des protéines par le nombre d'aas et de codons[modifier | modifier le wikicode]

  • Légende:La conformation moyenne des 6 protéines étudiées peut être représentée par les moyennes des aas calculées dans le tableau des diagrammes des aas. Pour chaque bactérie j'ai fait le diagramme "moyenne de l'aa" /"effectif de son aa correspodant"; La conformation moyenne des 6 protéines pour cette bactérie peut être alors représentée par les 3 paramètres de la droite de tendance de ce diagramme. A savoir:
  1. R2: coefficient de détermination de la droite (ici multiplié par 100)
  2. a: la pente de la droite (ici notée ax).
  3. b: la constante de la droite.

Les 3 paramètres sont reportés tels quels en fonction du contenu en GC (%GC) des bactéries dans les diagrammes des chapitres suivants.

  • La conformation des gènes des 6 protéines est étudiée de la même manière qu'avec les aas, mais ici je considère les 64 codons d'après le tableau des diagrammes des codons.
  • Dans le chapitre des exemples qui suit sont représentés 12 tableaux de ces diagrammes.
Conformation des protéines par le nombre d'aas[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Conformation des protéines par le nombre d'aas
  • format1 : voir 1er diagramme
  • Voir la légende
;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b
zin;13.5;11.2;0.764;77.0;lat;36.3;84.4;0.873;41.6;ype;47.6;94.9;1.009;-3.0;ret;61.3;91.1;1.034;-11.0
crp;16.6;13.9;0.727;89.3;bbd;36.8;93.8;0.972;9.2;amo;48.0;95.9;1.046;-15.0;sus;61.9;95.1;1.000;0.0
hcr;22.5;44.0;0.917;27.2;liv;37.1;97.5;1.012;-4.0;pgi;48.3;98.6;0.962;12.4;saci;62.3;92.0;1.042;-13.9
mcac;23.7;63.1;0.918;26.9;hmr;37.5;88.4;1.043;-14.0;mah;48.7;96.0;0.995;1.6;smk;62.7;88.3;1.000;0.1
ssdc;24.2;63.0;0.881;38.8;tde;37.9;92.1;1.022;-0.6;ssm;49.0;98.4;0.999;0.3;dvl;63.0;90.2;0.985;4.9
sbw;25.1;63.4;0.868;43.1;spi;38.3;97.0;0.965;11.4;eal;49.7;95.7;1.026;-8.5;ddr;63.4;85.8;1.007;-2.3
uur;25.5;62.7;0.874;41.3;vpr;38.6;96.3;0.966;11.0;lfc;50.0;91.8;1.024;-7.9;tai;63.8;83.2;1.059;-19.2
ple;26.2;57.2;0.875;40.9;chp;39.1;96.5;0.976;7.8;eco;50.8;95.6;1.025;-8.2;gau;64.3;85.7;1.096;-31.5
smf;26.3;77.9;1.021;-6.9;spl;39.1;97.6;1.007;-2.3;sbz;51.3;96.1;1.017;-5.7;xcb;65.0;84.0;1.045;-14.8
fnc;27.1;83.3;1.047;-15.5;tsu;39.2;92.4;0.938;20.2;bvs;51.7;97.5;0.953;15.4;rru;65.4;84.1;1.069;-22.7
bfl;27.4;65.4;0.815;60.5;nis;39.7;89.3;1.058;-19.1;sty;52.1;95.9;1.016;-5.1;dpt;66.2;83.1;1.045;-14.6
cbl;28.3;84.1;0.989;34.9;cmn;40.3;96.6;0.997;1.1;tpas;52.8;90.3;0.894;34.6;pae;66.6;91.4;1.054;-17.8
rip;28.5;59.1;0.834;54.2;nse;41.1;91.6;0.953;15.5;apt;53.0;84.1;1.026;-8.5;roa;67.4;85.8;1.051;-16.8
rpr;29.0;82.2;0.920;26.1;cta;41.3;97.1;1.008;-2.7;caa;53.6;96.6;1.016;-5.2;bmv;68.1;83.5;1.067;-21.8
pub;29.7;74.5;0.968;10.6;hhd;41.8;95.3;0.990;3.2;cgq;54.1;90.3;1.023;-7.5;tos;68.6;78.7;1.188;-61.5
cad;29.9;83.3;1.008;-2.6;gva;42.0;92.0;0.953;15.3;dal;54.5;96.2;0.993;2.2;vin;68.9;88.5;1.093;-30.5
cje;30.5;82.7;1.032;-10.3;cbd;42.4;96.9;1.044;-14.4;eno;55.1;95.8;1.014;-4.5;age;69.4;94.7;1.106;-34.8
pmh;31.1;84.0;0.967;10.9;bae;43.2;98.0;1.022;-7.2;mcu;55.4;88.9;0.960;13.1;opr;70.0;82.6;1.134;-44.0
tme;31.4;79.3;1.025;-8.1;aae;43.5;84.8;1.100;-32.8;din;56.1;97.6;0.963;12.0;mts;70.3;84.3;1.082;-26.8
sep;32.1;93.1;0.939;20.0;bsu;43.5;98.1;1.031;-10.3;say;56.8;78.2;1.003;-1.1;sma;70.7;84.7;1.040;-13.1
hhl;32.5;92.2;1.042;-13.9;hth;44.0;89.7;1.057;-18.8;bmf;57.2;90.8;1.015;-5.0;amd;71.3;78.3;1.049;-16.1
cff;33.3;86.0;0.995;1.7;lpl;44.5;92.1;0.924;24.9;kpn;57.5;95.2;1.020;-6.5;sho;72.0;83.3;1.033;-10.9
ial;33.9;87.6;0.978;7.1;pdi;45.1;95.6;0.965;11.6;aba;58.4;96.7;0.997;1.1;sgr;72.2;83.3;1.026;-8.5
ljf;34.5;95.5;0.962;12.5;ppoy;45.5;97.9;1.010;-3.4;dba;58.6;96.5;1.003;-0.1;cmi;72.7;80.4;1.087;-28.5
dte;34.9;86.4;1.120;-39.3;tma;46.2;89.9;1.067;-21.9;synd;59.1;85.7;1.062;-20.4;salb;73.3;83.2;1.037;-12.1
lla;35.3;98.1;1.027;-8.8;sbn;46.3;96.4;1.016;-5.3;pgd;59.6;88.3;0.983;5.6;ksk;74.2;80.1;1.037;-12.1
axl;35.7;95.9;0.990;3.4;fbt;46.5;98.3;0.969;10.2;pac;60.0;83.9;0.980;6.4;ade;74.9;84.8;1.119;-38.8
thl;36.0;96.3;0.950;16.2;tli;47.1;94.3;1.071;-23.2;bla;60.5;87.1;0.943;18.8;;;;;
Conformation des protéines par le nombre de codons[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Conformation des protéines par le nombre de codons
  • format2 : voir 2ème diagramme.
  • Voir la légende
  • Ce diagramme est l'équivalent de celui des aas car il réunit tout les codons. Les 2 diagrammes sont cependant très différents par la grande variance de R2 avec les codons, somme de 2 variances opposées que sont celle des triplets bbc,g et celle des bbt,a, et une très faible variance de R2 avec les aas, nécessaire au maintient des fonctions de ces 6 protéines.
;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b
crp;16.6;11.1;0.987;1.3;tde;37.9;61.5;0.995;0.6;ssm;49.0;65.8;1.005;-0.5;dvl;63.0;35.7;1.065;-6.6
ssdc;24.2;18.1;0.889;11.4;spi;38.3;48.8;0.96;4.1;eal;49.7;61.9;1.204;-20.8;ddr;63.4;38.1;1.137;-14
sbw;25.1;20.4;0.943;5.9;vpr;38.6;39.1;0.969;3.2;lfc;50.0;60.9;0.823;18.2;tai;63.8;16.6;0.744;26.3
ple;26.2;15.5;0.749;25.7;chp;39.1;41.8;0.839;16.5;eco;50.8;59.2;1.22;-22.4;gau;64.3;40.4;1.055;-6.6
smf;26.3;21.1;0.969;3.2;spl;39.1;51.4;0.939;6.3;sbz;51.3;64.7;1.196;-20;xcb;65.0;37;1.227;-23.2
fnc;27.1;21.9;0.955;4.6;tsu;39.2;46.9;0.993;0.7;bvs;51.7;55.6;1.084;-8.5;rru;65.4;36.7;1.195;-19.9
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Conformation des protéines par le nombre de codons bbc,g[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Conformation des protéines par le nombre de codons bbc,g
  • format3 : voir 3ème diagramme
  • Voir la légende
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Conformation des protéines par le nombre de codons bbt,a[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Conformation des protéines par le nombre de codons bbt,a
  • format4 : voir 4ème diagramme
  • Voir la légende
;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b
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lat;36.3;84.6;1.251;29.9;ype;47.6;72.9;1.170;-10.3;ret;61.3;61.1;0.637;-20.4;;;;;
bbd;36.8;85.8;1.370;3.6;amo;48.0;47.4;0.641;15.7;sus;61.9;68.9;0.609;-21.9;;;;;
liv;37.1;86.2;1.555;-2.2;pgi;48.3;79.0;0.889;11.6;saci;62.3;59.0;0.385;-7.1;;;;;
hmr;37.5;64.7;1.146;18.6;mah;48.7;85.2;1.091;-13.5;smk;62.7;56.9;0.491;-12.6;;;;;
Conformation, récapitulatif[modifier | modifier le wikicode]
  • La colonne 3° R2 correspond au coefficient de détermination d'un polynôme de degré 3.
Coefficient pente constante R2
Paramètre a b r2 a b r2 r'23 r23
Diagramme
aas 0.003 0.86 391 -0.99 47.5 410 540 874
codons 0.005 0.76 279 -0.50 24.6 280 320 709
bbg,c 0.040 -0.91 907 -0.54 26.3 170 260 691
bba,t -0.033 2.59 894 -0.62 30.8 250 420 665

Conformation des protéines, exemples[modifier | modifier le wikicode]

Conformation des protéines par le nombre d'aas[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Conformation des protéines par le nombre d'aas
  • formate et formatf: Voir diagrammes 5 et 6
  • Voir la légende pour R2 a b.
  1. moyen: moyenne de l'aa, voir la légende ci-dessus.
  2. zero: colonne à valeurs nulles pour reporter les noms des aas.
  3. hth: code KEGG de la bactérie
aa;moyen.;zero;hth;lpl;din;say
C;58;0;64;23;83;49
W;74;0;69;71;59;117
H;128;0;131;148;146;155
M;154;0;132;190;178;142
Q;220;0;190;302;250;270
Y;222;0;288;249;215;203
F;248;0;245;228;250;197
N;261;0;206;256;232;158
P;286;0;279;294;285;360
T;325;0;282;385;316;342
S;336;0;322;316;349;281
R;383;0;393;346;390;539
D;419;0;370;491;406;403
I;433;0;449;384;429;318
K;450;0;569;394;373;229
G;453;0;435;435;482;488
V;471;0;486;471;463;553
A;490;0;351;530;510;558
E;521;0;622;436;520;519
L;611;0;659;595;609;662
;;;;;;
R2;;;897;921;976;782
a;;;1057;924;963;1003
b;;;-188;249;120;-11
;;;;;;
%GC;;;44.0;44.5;56.1;56.8
Conformation des protéines par le nombre de codons bbc,g[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Conformation des protéines par le nombre de codons bbc,g
  • formata et formatb: Voir diagrammes 1 et 2
  • Voir la légende pour R2 a b.
  1. moyen: moyenne du codon, voir la légende ci-dessus.
  2. zero: colonne à valeurs nulles pour reporter les noms des codons.
  3. eal: code KEGG de la bactérie
codon;moyen.;zero;eal;lfc;bae;aae
tag;1;0;0;2;3;3
agg;24;0;5;57;10;193
tgc;31;0;32;24;19;35
cgg;44;0;12;72;26;0
ggg;54;0;48;92;51;46
agc;55;0;63;42;71;40
tcg;58;0;37;45;24;14
ccc;61;0;15;84;6;170
tcc;66;0;88;135;58;92
cac;70;0;83;48;61;110
acg;71;0;61;57;100;87
tgg;71;0;71;66;66;78
ttg;81;0;54;95;88;12
ccg;101;0;204;89;144;34
ctc;104;0;63;133;60;267
tac;107;0;121;55;101;227
gtc;118;0;66;144;103;67
acc;121;0;173;97;34;90
ttc;125;0;123;73;102;156
gcg;126;0;244;52;129;97
aac;128;0;185;89;133;192
cgc;132;0;135;46;95;9
cag;132;0;195;110;131;125
gtg;137;0;140;68;118;80
atg;154;0;188;158;160;114
gcc;164;0;96;134;77;62
ggc;169;0;182;85;144;47
ctg;180;0;440;124;116;84
atc;181;0;240;154;167;76
gac;202;0;237;151;154;277
aag;202;0;106;141;126;409
gag;226;0;154;169;147;244
;;;;;;
R2;;;518;529;676;224
a;;;1180;556;712;792
b;;;-83;296;104;240
;;;;;;
%GC;;;49.7;50.0;43.2;43.5
Conformation des protéines par le nombre de codons bbt,a[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Conformation des protéines par le nombre de codons bbt,a
  • formatc et formatd: Voir diagrammes 3 et 4
  • Voir la légende pour R2 a b.
  1. moyen: moyenne du codon, voir la légende ci-dessus.
  2. zero: colonne à valeurs nulles pour reporter les noms des codons.
  3. fnc: code KEGG de la bactérie
codon;moyen.;zero;thl;lat;chp;spl
tga;2;0;0;0;1;0
taa;3;0;5;6;3;6
cga;20;0;34;36;37;12
tgt;27;0;23;67;55;49
cta;30;0;63;47;76;162
agt;38;0;72;72;64;26
tca;50;0;73;91;52;88
cca;58;0;98;75;66;130
cat;59;0;82;113;105;55
aga;60;0;48;62;88;20
cct;65;0;120;139;160;93
aca;65;0;139;110;107;84
act;68;0;120;101;122;120
tct;69;0;113;204;176;103
ata;84;0;34;169;83;10
gta;84;0;155;117;123;125
gga;88;0;118;151;163;21
caa;89;0;237;181;137;128
gca;91;0;142;119;99;151
ctt;97;0;65;160;118;149
cgt;103;0;187;175;142;247
gct;108;0;229;177;231;212
tat;116;0;205;156;164;83
tta;120;0;270;180;243;93
ttt;123;0;177;203;178;110
gtt;132;0;207;196;201;217
aat;133;0;233;237;161;63
ggt;142;0;194;129;153;311
att;168;0;289;287;265;182
gat;217;0;345;363;313;279
aaa;247;0;360;323;298;176
gaa;296;0;483;329;376;326
;;;;;;
;;;880;846;864;530
;;;1600;1251;1248;985
;;;13;299;235;258
;;;;;;
;;;36.0;36.3;39.1;39.1

Fréquences des corrélations entre bactéries / codons[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Fréquences des corrélations entre bactéries / codons
  • format5 et format6: voir diagrammes 1 et 2
  • Tableau construit à partir de la matrice des corrélations entre bactéries/codons ci-dessous.
cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr
0;62;20;68;40;80;60;116;80;126;100;8;-20;54;-40;38
1;62;21;86;41;82;61;90;81;120;-1;62;-21;60;-41;42
2;60;22;80;42;88;62;120;82;176;-2;56;-22;60;-42;52
3;76;23;84;43;88;63;126;83;182;-3;52;-23;74;-43;38
4;56;24;66;44;100;64;120;84;184;-4;50;-24;88;-44;20
5;36;25;80;45;118;65;128;85;150;-5;52;-25;80;-45;16
6;58;26;90;46;88;66;104;86;154;-6;62;-26;48;-46;4
7;74;27;76;47;94;67;112;87;152;-7;58;-27;84;-47;2
8;72;28;92;48;102;68;106;88;144;-8;48;-28;58;total;12210
9;78;29;76;49;108;69;140;89;146;-9;34;-29;76;;
10;66;30;102;50;94;70;128;90;144;-10;60;-30;70;;
11;66;31;80;51;100;71;124;91;128;-11;66;-31;64;;
12;64;32;76;52;100;72;120;92;98;-12;48;-32;66;;
13;40;33;74;53;92;73;134;93;82;-13;52;-33;60;;
14;50;34;76;54;108;74;150;94;86;-14;62;-34;56;;
15;78;35;98;55;110;75;138;95;66;-15;38;-35;70;;
16;76;36;74;56;110;76;142;96;30;-16;44;-36;74;;
17;72;37;104;57;94;77;148;97;36;-17;68;-37;46;;
18;74;38;98;58;100;78;150;98;42;-18;40;-38;54;;
19;68;39;82;59;112;79;120;99;22;-19;48;-39;46;;
6550;aas;5,710;5,760;5,864;6,157;6,041;6,132;5,709;6,361;6,600;6,345;6,697;6,334;6,762;6,715;6,569;6,265;6,706;6,431;6,271;6,094;5,974;6,826;6,618;6,108;6,750;6,098;6,095;6,152;6,822;6,705;6,136;6,548;6,640;6,089;6,694;6,625;6,656;6,775;6,694;6,612;6,541;6,612;6,213;6,876;6,598;6,116;6,663;6,118;6,590;6,158;6,981;6,312;6,437;6,625;7,141;6,600;6,655;6,583;6,924;6,596;6,495;6,649;7,164;6,641;6,631;6,990;6,647;6,795;6,709;6,661;6,572;6,714;6,643;6,674;6,490;5,844;6,773;6,638;6,820;6,546;6,472;6,745;6,549;6,780;6,795;6,566;6,672;6,805;6,720;6,859;6,582;7,021;6,764;6,688;6,845;6,664;6,576;7,207;6,617;7,209;6,713;6,646;6,487;6,581;6,465;6,559;6,561;6,452;6,571;6,532;6,733
304;%GC;13.5;16.6;22.5;23.7;24.2;25.1;25.5;26.2;26.3;27.1;27.4;28.3;28.5;29.0;29.7;29.9;30.5;31.1;31.4;32.1;32.5;33.3;33.9;34.5;34.9;35.3;35.7;36.0;36.3;36.8;37.1;37.5;37.9;38.3;38.6;39.1;39.1;39.2;39.7;40.3;41.1;41.3;41.8;42.0;42.4;43.2;43.5;43.5;44.0;44.5;45.1;45.5;46.2;46.3;46.5;47.1;47.6;48.0;48.3;48.7;49.0;49.7;50.0;50.8;51.3;51.7;52.1;52.8;53.0;53.6;54.1;54.5;55.1;55.4;56.1;56.8;57.2;57.5;58.4;58.6;59.1;59.6;60.0;60.5;61.3;61.9;62.3;62.7;63.0;63.4;63.8;64.3;65.0;65.4;66.2;66.6;67.4;68.1;68.6;68.9;69.4;70.0;70.3;70.7;71.3;72.0;72.2;72.7;73.3;74.2;74.9
;KEGG;zin;crp;hcr;mcac;ssdc;sbw;uur;ple;smf;fnc;bfl;cbl;rip;rpr;pub;cad;cje;pmh;tme;sep;hhl;cff;ial;ljf;dte;lla;axl;thl;lat;bbd;liv;hmr;tde;spi;vpr;chp;spl;tsu;nis;cmn;nse;cta;hhd;gva;cbd;bae;aae;bsu;hth;lpl;pdi;ppoy;tma;sbn;fbt;tli;ype;amo;pgi;mah;ssm;eal;lfc;eco;sbz;bvs;sty;tpas;apt;caa;cgq;dal;eno;mcu;din;say;bmf;kpn;aba;dba;synd;pgd;pac;bla;ret;sus;saci;smk;dvl;ddr;tai;gau;xcb;rru;dpt;pae;roa;bmv;tos;vin;age;opr;mts;sma;amd;sho;sgr;cmi;salb;ksk;ade
;zin;100;97;86;77;84;85;76;90;77;74;80;73;77;78;78;67;74;74;72;64;58;75;62;44;50;48;53;57;64;51;51;54;46;37;37;55;12;36;52;51;56;47;41;10;52;37;17;33;30;16;6;9;21;18;12;25;18;2;19;21;6;7;41;5;8;-4;4;21;-1;-17;-24;-7;1;-10;-10;0;-18;-3;-23;-20;-25;-15;-27;-27;-24;-23;-29;-27;-30;-27;-27;-29;-27;-25;-21;-28;-34;-29;-29;-33;-32;-30;-32;-33;-33;-32;-32;-33;-32;-31;-31
;crp;97;100;91;84;89;89;83;91;78;75;85;72;81;82;83;67;78;78;74;68;65;74;66;52;54;54;61;63;70;55;56;54;50;43;41;62;16;41;54;59;60;55;45;16;57;41;16;38;28;23;6;11;19;21;14;24;20;0;19;22;7;7;46;4;7;-5;3;27;2;-18;-22;-8;-1;-9;-10;3;-19;-4;-24;-21;-28;-16;-28;-30;-26;-24;-32;-30;-33;-29;-32;-30;-29;-27;-23;-31;-37;-31;-32;-36;-35;-34;-36;-36;-36;-36;-36;-36;-35;-35;-35
;hcr;86;91;100;95;95;96;95;90;87;86;93;81;90;93;94;75;92;92;85;86;82;81;84;73;71;75;82;83;86;75;78;61;63;64;62;80;37;58;67;76;71;73;67;36;72;63;20;60;30;43;15;27;30;39;24;32;35;4;35;37;20;17;66;14;17;-2;12;40;20;-7;-10;-3;8;0;-5;10;-7;3;-18;-17;-24;-11;-24;-27;-21;-20;-31;-27;-30;-28;-38;-25;-28;-24;-22;-30;-39;-30;-36;-39;-38;-37;-39;-40;-40;-40;-40;-41;-40;-39;-39
;mcac;77;84;95;100;95;95;97;87;86;86;94;81;87;93;95;74;90;93;81;90;90;78;84;83;70;79;87;88;85;74;79;58;60;68;66;84;44;55;60;80;68;77;68;43;74;59;18;57;23;53;17;26;26;46;22;30;40;-1;32;37;15;18;62;15;17;-4;12;37;21;-7;-6;-6;8;2;-6;11;-8;3;-18;-20;-24;-11;-22;-29;-22;-23;-33;-29;-32;-29;-40;-26;-29;-26;-23;-31;-39;-32;-39;-41;-40;-39;-41;-42;-41;-42;-42;-43;-42;-41;-42
;ssdc;84;89;95;95;100;98;95;93;88;86;97;83;87;95;92;75;89;90;82;90;87;80;79;78;66;75;84;85;87;69;77;60;58;64;65;83;41;51;58;77;69;74;65;39;71;55;16;53;27;46;17;25;22;43;22;32;38;1;30;33;14;17;58;14;16;-5;11;41;20;-10;-8;-10;7;-1;-9;8;-10;1;-23;-23;-27;-13;-23;-30;-24;-25;-36;-30;-34;-32;-38;-28;-31;-28;-26;-33;-40;-33;-39;-42;-41;-41;-41;-42;-43;-42;-42;-44;-42;-42;-42
;sbw;85;89;96;95;98;100;94;94;90;89;95;86;91;95;95;79;93;91;87;91;86;84;84;78;73;80;84;88;89;74;82;62;64;68;70;85;44;57;65;80;71;77;71;41;74;62;22;60;31;47;17;28;30;46;25;34;42;3;34;36;16;22;63;20;20;-3;15;41;23;-9;-8;-6;12;1;-7;8;-10;5;-21;-22;-26;-12;-24;-30;-24;-25;-36;-30;-33;-30;-41;-28;-31;-29;-25;-33;-41;-34;-41;-44;-43;-41;-42;-43;-44;-44;-44;-45;-44;-43;-45
;uur;76;83;95;97;95;94;100;86;82;81;93;76;83;92;92;68;89;89;79;91;87;75;82;82;66;82;90;90;86;73;82;58;60;72;70;84;49;55;62;80;69;77;70;45;77;62;14;60;20;57;21;33;23;50;27;29;45;0;37;41;20;22;62;19;21;1;16;43;28;-1;-1;-3;12;7;-2;15;-2;7;-14;-16;-20;-6;-17;-23;-17;-18;-30;-24;-28;-25;-38;-21;-25;-22;-20;-27;-35;-27;-36;-38;-36;-36;-37;-38;-38;-38;-38;-40;-38;-38;-38
;ple;90;91;90;87;93;94;86;100;93;91;91;90;88;92;91;86;86;88;89;84;79;86;77;67;68;67;76;78;81;68;70;70;60;56;59;75;34;49;60;68;73;65;59;30;64;51;28;49;41;38;15;19;31;35;18;41;31;9;28;30;9;13;52;10;11;-5;6;33;11;-14;-14;-10;3;-7;-13;2;-16;-3;-24;-25;-30;-16;-29;-32;-27;-28;-37;-33;-35;-33;-34;-31;-32;-31;-28;-34;-41;-35;-40;-43;-41;-41;-42;-42;-43;-42;-43;-44;-43;-42;-43
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Fréquences des corrélations entre bactéries / aas[ © Copyright Wikipedia authors - The articles gathered in this document are under the GFDL licence.
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